基因页:GJA10
概括?
基因 | 84694 |
象征 | GJA10 |
同义词 | CX62 |
描述 | 间隙连接蛋白α10 |
参考 | MIM:611924|HGNC:HGNC:16995|ENSEMBL:ENSG00000135355|HPRD:13104|Vega:Otthumg0000000015210 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q15 |
Pascal P值 | 0.074 |
胎儿β | 0.097 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GJA10_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005243 | 间隙连接通道活动 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007416 | 突触发生 | IEA | 突触(GO期限:6) | - |
去:0007154 | 细胞通信 | IEA | - | |
去:0009416 | 对光刺激的反应 | IEA | - | |
去:0007276 | 配子一代 | IEA | - | |
去:0050908 | 检测视觉感知涉及的光刺激 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005922 | 康纳克森复合物 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
GO:0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome膜贩运 | 129 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome间隙交界处贩运 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome间隙连接组件 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 | 275 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |