基因页面:GTPBP3
总结吗?
GeneID | 84705年 |
象征 | GTPBP3 |
同义词 | COXPD23 | GTPBG3 | MSS1 | MTGP1 | THDF1 |
描述 | 三磷酸鸟苷结合蛋白3(线粒体) |
参考 | MIM: 608536|HGNC: HGNC: 14880|运用:ENSG00000130299|HPRD: 12255|织女:OTTHUMG00000182766 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 19 p13.11 |
帕斯卡假定值 | 0.924 |
夏洛克假定值 | 0.01 |
这样假定值 | 0.002 |
胎儿β | 1.138 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
支持 | CompositeSet |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: vanEijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括432个不同甲基化CpG网站对应391精神分裂症患者之间独特的成绩单(n = 260)和对照组(n = 250)的影响。 | 1 |
认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
GTPBP3 | chr19 | 17450270 | C | CGG | NM_001128855 NM_001195422 NM_032620 NM_133644 |
。 。 。 。 |
移码的 移码的 移码的 移码的 |
精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg08145177 | 19 | 17413767 | GTPBP3 | 6.966的军医 | 3.746 | DMG: vanEijk_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs7737968 | chr5 | 134403228 | GTPBP3 | 84705年 | 0.04 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GTPBP3_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
MULLIGHAN MLL签名1 DN | 242年 | 165年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MULLIGHAN MLL签名2 DN | 281年 | 186年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过跟踪DN HAMAI细胞凋亡 | 186年 | 107年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN NUYTTEN EZH2目标 | 1024年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
魏MYCN目标与E箱 | 795年 | 478年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH OCT4目标 | 290年 | 172年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH SOX2目标 | 734年 | 436年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH号目标 | 179年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CREIGHTON内分泌治疗抵抗1 | 528年 | 324年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
桑塞姆APC MYC目标 | 217年 | 138年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
桑塞姆APC需要MYC的目标 | 210年 | 123年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG RXRA 8 d | 882年 | 506年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN FORTSCHEGGER PHF8目标 | 784年 | 464年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |