SZGR2 - Beplay体育中心

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GeneID	84708
Symbol	LNX1
同义词	lnx \| mpdz \| pdzrn2
描述	ligand of numb-protein X 1, E3 ubiquitin protein ligase
参考	MIM：609732\|HGNC：HGNC：6657\|Ensembl：ENSG00000072201\|HPRD：17287\|Vega：Otthumg00000102099
基因类型	蛋白质编码
地图位置	4Q12
Pascal P值	0.066
Sherlock P值	0.777
胎儿β	-0.684
DMG	1（＃研究）

Gene in Data Sources

基因集名称	基因组方法	描述	信息
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
DMG：Wockner_2014	全基因组DNA甲基化分析	该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。	4

Section I. Genetics and epigenetics annotation

差异甲基化基因

探测	染色体	位置	最近的基因	p（dis）	beta（dis）	fdr（dis）	学习
CG01877606	4	54457746	LNX1	1.37E-5	-0.443	0.014	DMG：Wockner_2014
CG06634862	4	54457645	LNX1	1.44E-5	-0.376	0.014	DMG：Wockner_2014
CG23664174	4	54357316	LNX1	2.232E-4	0.591	0.036	DMG：Wockner_2014
CG07080653	4	54374249	LNX1	2.601E-4	0.655	0.038	DMG：Wockner_2014

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者	别名b	官方全名b	实验	Source	PubMed ID
akirin2	C6orf166 \|FBI1 \|FLJ10342 \|DJ486L4.2	Akirin 2	Two-hybrid	Biogrid	16189514
APIP	apip2 \|CGI-29 \|MMRP19 \|DJ179L10.2	APAF1 interacting protein	Two-hybrid	Biogrid	16189514
C19orf50	FLJ25480 \|MGC2749 \|MST096 \|MSTP096	chromosome 19 open reading frame 50	Two-hybrid	Biogrid	16189514
Calcoco2	MGC17318 \|NDP52	钙结合和盘绕螺旋结构域2	Two-hybrid	Biogrid	16189514
CCDC85B	dipa	包含85B	Two-hybrid	Biogrid	16189514
CEP72	FLJ10565 \|KIAA1519 \|MGC5307	中心蛋白72KDA	Two-hybrid	Biogrid	16189514
CUTC	CGI-32 \|RP11-483F11.3	CUTC铜转运蛋白同源物（大肠杆菌）	Two-hybrid	Biogrid	16189514
DCTD	MGC111062	DCMP脱氨酶	Two-hybrid	Biogrid	16189514
DDX17	DKFZP761H2016 \|P72 \|RH70	死亡（ASP-GLU-ALA-ASP）盒多肽17	Two-hybrid	Biogrid	16189514
DVL3	KIAA0208	Dish，DSH同源3（果蝇）	Two-hybrid	Biogrid	16189514
EHMT2	BAT8 \|C6orf30 \|DKFZP686H08213 \|FLJ35547 \|g9a \|KMT1C \|NG36 \|NG36/G9A	正式组蛋白 - 赖氨酸N-甲基转移酶2	Two-hybrid	Biogrid	16189514
ENOX1	CNOX \|FLJ10094 \|Pig38 \|BA64J21.1 \|CCNOX	Ecto-Nod二硫键 - 硫醇交换器1	Two-hybrid	Biogrid	16189514
FBP1	FBP	果糖1,6-磷酸酶1	Two-hybrid	Biogrid	16189514
FHL3	MGC19547 \|MGC23614 \|MGC8696 \|Slim2	four and a half LIM domains 3	Two-hybrid	Biogrid	16189514
JTV1	AIMP2 \| P38 \| PRO0992	JTV1基因	Two-hybrid	Biogrid	16189514
KCTD13	FKSG86 \|PDIP1 \|poldip1	含13的钾通道四聚化域	Two-hybrid	Biogrid	16189514
KCTD17	FLJ12242 \|FLJ98761	含17的钾通道四聚化域	Two-hybrid	Biogrid	16189514
khdrbs3	Etle \|萨尔普\|SLM-2 \|SLM2 \|T-Star \|tstar \|etoile	KH结构域含有RNA结合，信号转导相关3	Two-hybrid	Biogrid	16189514
KLHL12	C3IP1 \|dkir \|FLJ27152	类似Kelch的12（果蝇）	Two-hybrid	Biogrid	16189514
KRT15	CK15 \| K15 \| K1CO	角蛋白15	Two-hybrid	Biogrid	16189514
KRTAP4-12	kap4.12 \|KRTAP4.12	角蛋白相关蛋白4-12	Two-hybrid	Biogrid	16189514
LDOC1	bcur1 \|mar7 \|mart7	亮氨酸拉链，在癌症中下调1	Two-hybrid	Biogrid	16189514
LNX2	FLJ12933 \|FLJ23932 \|FLJ38000 \|MGC46315 \|PDZRN1	ligand of numb-protein X 2	-	HPRD	11922143
Magea11	法师11 \|Mage11 \|magea-11 \|MGC10511	黑色素瘤抗原家族A，11	Two-hybrid	Biogrid	16189514
MAGEB18	MGC33889	黑色素瘤抗原家族B，18	Two-hybrid	Biogrid	16189514
纳德	FLJ13052 \|FLJ37724 \|DJ283E3.1	NAD激酶	Two-hybrid	Biogrid	16189514
NAGK	gnk \|HSA242910	N-乙酰葡萄糖激酶	亲和力捕获 - 韦斯特恩 Two-hybrid	Biogrid	16189514
NECAB2	EFCBP2	N末端EF手钙结合蛋白2	Two-hybrid	Biogrid	16189514
NUMB	S171	麻木同源物（果蝇）	-	HPRD，Biogrid	9535908\|11782429
pafah1b3	-	血小板激活因子乙酰水合酶，同工型IB，伽马亚基29KDA	亲和力捕获 - 韦斯特恩 Two-hybrid	Biogrid	16189514
PAICS	ADE2 \| ADE2H1 \| AIRC \| DKFZp781N1372 \| MGC1343 \| MGC5024 \| PAIS	磷酸氨基氨基咪唑羧化酶，磷酸氨基氨基咪唑辅助辅助酰胺合成酶合成酶	Two-hybrid	Biogrid	16189514
PCBD1	DCOH \|PCBD \|PCD \|PHS	翼蛋白-4α-甲醇胺脱水酶/二聚体脱氢酶的肝细胞核因子1α	Two-hybrid	Biogrid	16189514
Rabac1	pra1 \|praf1 \|yip3	RAB受体1（原始化）	Two-hybrid	Biogrid	16189514
RAD54B	FSBP \|RDH54	RAD54同源物B（S. cerevisiae）	Two-hybrid	Biogrid	16189514
RBMX	HNRPG \| RBMXP1 \| RBMXRT \| RNMX \| hnRNP-G	RNA binding motif protein, X-linked	Two-hybrid	Biogrid	16189514
RPIA	RPI	ribose 5-phosphate isomerase A	Two-hybrid	Biogrid	16189514
SAT1	DC21 \|KFSD \|星期六\|SSAT \|SSAT-1	spermidine/spermine N1-acetyltransferase 1	Two-hybrid	Biogrid	16189514
SFRS1	ASF \|MGC5228 \|SF2 \|sf2p33 \|SRP30A	剪接因子,精氨酸/ serine-rich1	Two-hybrid	Biogrid	16189514
TIFA	MGC20791 \|T2BP \|T6BP \|Tifaa	与叉头相关结构域的TRAF相互作用蛋白	Two-hybrid	Biogrid	16189514
traf2	MGC：45012 \|陷阱\|陷阱3	TNF受体相关因子2	Two-hybrid	Biogrid	16189514
TRIM23	ard1 \|arfd1 \|RNF46	含三方图案23	Two-hybrid	Biogrid	16189514
Trip13	16E1BP	甲状腺激素受体相互作用13	Two-hybrid	Biogrid	16189514
TSC22D4	THG-1 \|THG1	TSC22域家庭，成员4	Two-hybrid	Biogrid	16189514
ZBTB43	ZBTB22B \|Znf-X \|ZNF297B	zinc finger and BTB domain containing 43	Two-hybrid	Biogrid	16189514
ZBTB8	bozf1 \|FLJ90065 \|MGC17919	锌指和包含8个的BTB结构域	Two-hybrid	Biogrid	16189514

Section V. Pathway annotation

路径名	路径大小	＃szgr 2.0基因	信息
PID Notch途径	59	49	All SZGR 2.0 genes in this pathway
乳腺癌腔与基础	380	215	All SZGR 2.0 genes in this pathway
乳腺癌腔与间充质	450	256	All SZGR 2.0 genes in this pathway
纽曼ERCC6靶向DN	39	24	All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌	1821年	933	All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN	805	505	All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌变性DN	537	339	All SZGR 2.0 genes in this pathway
冷吉非替尼抵抗DN	230	115	All SZGR 2.0 genes in this pathway
HUMMERICH SKIN CANCER PROGRESSION UP	88	58	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 5	482	296	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Massarweh tamoxifen抗性	578	341	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BEIER GLIOMA STEM CELL DN	66	42	All SZGR 2.0 genes in this pathway
HAN SATB1 TARGETS UP	395	249	All SZGR 2.0 genes in this pathway
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 24HR DN	505	328	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bruins通过TP53组A的UVC响应	898	516	All SZGR 2.0 genes in this pathway
杨Bcl3靶向	364	236	All SZGR 2.0 genes in this pathway

基因页：LNX1