基因页：OGT

概括?
基因ID 8473
Symbol OGT
同义词 HINCUT-1|HRNT1|O-GLCNAC
描述 O连接的N-乙酰葡萄糖（GLCNAC）转移酶
参考 MIM：300255|HGNC:HGNC:8127|Ensembl:ENSG00000147162|HPRD:02222|Vega:OTTHUMG00000033316
基因type protein-coding
地图位置 XQ13
Sherlock P值 0.405
Fetal beta 0.869
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET
染色质重塑基因
Potential synaptic genes

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
PMID:cooccur 高通量文献搜索 Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症Co-occurance关键词:schizophrenia,schizophrenic,schizophrenias Click to show details
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.01

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
CAB39 0.94 0.95
BAG5 0.94 0.94
USP33 0.94 0.93
AppBP2 0.94 0.94
RBBP5 0.94 0.94
FBXO28 0.94 0.94
LRPPRC 0.93 0.93
CUL5 0.93 0.94
ARCN1 0.93 0.93
UBQLN1 0.93 0.94
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
MT-CO2 -0.72 -0.72
FXYD1 -0.71 -0.73
higd1b -0.71 -0.72
AF347015.31 -0.70 -0.71
AF347015.21 -0.68 -0.69
MT-CYB -0.68 -0.69
IFI27 -0.67 -0.70
AF347015.8 -0.67 -0.70
CST3 -0.67 -0.71
AF347015.33 -0.66 -0.67

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0008375 acetylglucosaminyltransferase activity 塔斯 9083068
GO:0005515 protein binding 新闻学会 12670868
GO:0016757 转移酶活性，转移糖基团 IEA -
Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006493 protein amino acid O-linked glycosylation 塔斯 9083067
去：0007165 signal transduction 塔斯 9083067
GO:0007584 response to nutrient 塔斯 9083068
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0005829 cytosol 塔斯 9083067
GO:0005634 核 塔斯 9083067
GO:0005737 细胞质 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
CDK2 p33（CDK2） 细胞周期蛋白依赖性激酶2 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
CSNK2A1 CK2A1 |CKII casein kinase 2, alpha 1 polypeptide - HPRD 10753899
FIBP fgfibp |FIBP-1 fibroblast growth factor (acidic) intracellular binding protein 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
GSK3B - glycogen synthase kinase 3 beta - HPRD 10753899
HCFC1 CFF |HCF-1 |HCF1 |HFC1 |MGC70925 |VCAF 宿主细胞因子C1（VP16-辅助蛋白） - HPRD，Biogrid 12670868
mapt ddpac |FLJ31424 |FTDP-17 |maptl |MGC138549 |MSTD |mtbt1 |mtbt2 |ppnd |tau microtubule-associated protein tau - HPRD，Biogrid 8910513|12911634
NUP62CL FLJ20130 nucleoporin 62kDa C-terminal like 两个杂交 BioGRID 16189514
OGT FLJ23071 | HRNT1 | MGC22921 | O-GLCNAC O连接的N-乙酰葡萄糖胺（GlcNAC）转移酶（UDP-N-乙酰葡萄糖：多肽-N-乙酰葡萄糖苷转移酶） Biochemical Activity BioGRID 10753899
SIN3A DKFZp434K2235 | FLJ90319 | KIAA0700 SIN3 homolog A, transcription regulator (yeast) - HPRD，Biogrid 12150998
snap91 AP180 | CALM | DKFZp781O0519 | KIAA0656 突触体相关蛋白，91KDA同源物（小鼠） - HPRD 8063760
trak1 OIP106 运输蛋白，动力素结合1 - HPRD，Biogrid 12435728|12724313
trak2 ALS2CR3 | CALS-C | GRIF-1 | GRIF1 | KIAA0549 | OIP98 运输蛋白，动力素结合2 - HPRD，Biogrid 12435728
WDR8 FLJ20430 |MGC99569 WD repeat domain 8 亲和力捕获ms BioGRID 17353931


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
ONKEN UVEAL MELANOMA UP 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WILCOX RESPONSE TO PROGESTERONE DN 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不佳 276 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LAIHO COLORECTAL CANCER SERRATED DN 86 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG LMO4 TARGETS UP 372 227 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSMAN BLADDER CANCER DN 406 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE KERATINOCYTE DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1急性LOF DN 228 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN DN 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 3 4WK UP 214 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 4 5WK DN 196 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 5 6WK DN 137 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP 197 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 COMMON DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMUNDSON RESPONSE TO ARSENITE 217 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA2 PCC NETWORK 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN NIPP1 TARGETS UP 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN TUMOR DIFFERENTIATED WELL VS POORLY UP 236 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH SOX2 TARGETS 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH CYCLING GENES 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEPARD BMYB MORPHOLINO DN 200 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML复发预后 35 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER PBL KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP 151 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML SURVIVAL 129 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu衰老的脑dn 153 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德斯癌元签名 64 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HEDENFALK BREAST CANCER BRCA1 VS BRCA2 163 113 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BACOLOD RESISTANCE TO ALKYLATING AGENTS DN 60 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克道尔急性肺损伤DN 48 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RESPONSE TO TRABECTEDIN DN 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR UP 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRADE COLON CANCER UP 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL UP 260 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEST ADRENOCORTICAL TUMOR DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib的反应 245 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI PSEUDOPODIA CHEMOTAXIS DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病DN 181 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇2的时间反应2 86 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期S 162 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PURBEY TARGETS OF CTBP1 NOT SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Guillaumond KLF10靶向DN 30 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rao由Sall4绑定 227 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO FGFR1 TARGETS IN PROSTATE CANCER MODEL DN 308 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-101 820 826 m8 HSA-MIR-101 UACAGUACUGUGAUAACUGAAG
miR-103/107 906 912 m8 HSA-MIR-103脑 AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUGA
HSA-MIR-107脑 agcagcauuguacgggcuauca
mir-140 543 549 m8 hsa-miR-140脑 agugguuuuacccuaugguag
mir-141/200a 878 884 m8 hsa-miR-141 UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-145 1974年 1980年 1A hsa-miR-145 GUCCAGUUUUCCCAGGAAUCCCUU
mir-15/16/195/424/497 907 913 m8 hsa-miR-15a脑 UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
hsa-miR-15b脑 uagcagcacaucaugguuaca
hsa-miR-195SZ UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
hsa-miR-497 CAGCAGCACACUGUGGUUUGU
mir-181 1495 1502 1A,m8 hsa-miR-181a脑 aacauucaacgcugucggugagu
hsa-miR-181bSZ aacauucauugcugucggggg
hsa-miR-181c脑 aacauucaaccugucggugagu
hsa-miR-181d脑 aacauucauuguugucggggguggguu
mir-182 767 773 1A hsa-miR-182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
mir-186 360 366 1A hsa-miR-186 CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU
miR-204/211 55 62 1A,m8 HSA-MIR-204脑 Uucccuuugucauccuaugccu
HSA-MIR-211 uucccuuugucauccuucgccu
mir-23 419 425 1A hsa-miR-23a脑 aucacauugccagggauucc
hsa-miR-23b脑 aucacauugccagggauuacc
mir-24 33 39 m8 HSA-MIR-24SZ UGGCUCAGUUCAGCAGGAACAG
mir-26 1533年 1539年 1A hsa-miR-26a脑 Uucaaguaauccaggauaggc
hsa-miR-26bSZ uucaaguaauucaggauagguu
miR-299-5p 542 548 1A HSA-MIR-299-5P UGGUUUACCGUCCCACAUACAU
mir-485-5p 36 42 1A HSA-MIR-485-5p AGAGGCUGGCCGUGAUGAAUUC
miR-544 1008 1014 1A HSA-MIR-544 AUUCUGCAUUUUUAGCAAGU
miR-7 268 275 1A,m8 HSA-MIR-7SZ Uggaagacuaguuuuuguug
miR-96 766 773 1A,m8 HSA-MIR-96脑 UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC