基因页面:CNDP1
总结吗?
GeneID | 84735年 |
象征 | CNDP1 |
同义词 | CN1 | CPGL2 | HsT2308 |
描述 | 肌肽二肽酶1 (metallopeptidase M20家庭) |
参考 | MIM: 609064|HGNC: HGNC: 20675|运用:ENSG00000150656|HPRD: 09883|HPRD: 09894|织女:OTTHUMG00000132852 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 18 q22.3 |
帕斯卡假定值 | 0.009 |
胎儿β | -3.93 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg11200644 | 18 | 72265018 | CNDP1 | 2.44 e-11 | -0.015 | 3.48 e - | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs6448932 | chr4 | 12595798 | CNDP1 | 84735年 | 0.07 | 反式 | ||
rs7830259 | chr8 | 14087643 | CNDP1 | 84735年 | 0.03 | 反式 | ||
rs8099488 | chr18 | 56200149 | CNDP1 | 84735年 | 0.18 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CNDP1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004180 | 羧肽酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008237 | metallopeptidase活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008233 | 肽酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0046983 | 蛋白质二聚活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006508 | 蛋白水解作用 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG组氨酸代谢 | 29日 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGGβ-丙氨酸代谢 | 22 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝癌DN | 540年 | 340年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |