概括
基因 8480
象征 rae1
同义词 mig14 | mrnp41 | mnrp41 | dj481f12.3 | dj800j21.1
描述 核糖核酸导出1
参考 MIM:603343|HGNC:HGNC:9828|HPRD:11939|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20q13.31
Pascal P值 0.699
Sherlock P值 0.249
胎儿β 1.382
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG05045383 20 55926193 rae1 -0.02 0.36 DMG:Nishioka_2013


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SPG20 0.87 0.86
Qki 0.86 0.80
岩浆 0.84 0.78
MPP5 0.84 0.82
GAB1 0.83 0.81
WDR51B 0.83 0.82
dpy19l4 0.82 0.77
tor1aip1 0.81 0.79
AP003355.2 0.81 0.78
KDSR 0.81 0.73
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
WDR86 -0.40 -0.43
AL022328.1 -0.40 -0.36
纳米3 -0.40 -0.45
C1orf86 -0.39 -0.42
IL32 -0.38 -0.32
AC016757.1 -0.37 -0.30
AC135724.1 -0.36 -0.34
RP9P -0.36 -0.34
HES4 -0.35 -0.44
ST20 -0.35 -0.32

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
非编码RNA的反应组代谢 49 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IFN刺激基因的反应组抗病毒机制 66 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
含有前mRNA的封顶内含子的反应组处理 140 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
成熟转录本向细胞质的反应组传输 54 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome mRNA处理 161 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
源自内在转录本的成熟mRNA的反应组传输 33 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome葡萄糖转运 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
READEM RNA的代谢 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素信号传导 159 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
碳水化合物的反应组代谢 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome流感生命周期 203 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NEP NS2与细胞出口机械相互作用 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV感染 207 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
核糖核蛋白转运到宿主核的反应组转运 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV生命周期 125 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 132 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV生命周期的后期 104 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VPR与宿主细胞蛋白的反应组相互作用 33 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄糖激酶调节蛋白对葡萄糖激酶的反应组调节 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bidus转移 214 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ouellet培养的卵巢癌侵入性与LMP UP 69 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射4的响应4 61 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌20q12 Q13 Amplicon 149 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
按拷贝数量的丁肺癌表达 100 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特(Smith Tert) 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素反应dn 245 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WELCSH BRCA1靶向DN 141 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee转移和RNA处理 17 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan早期分化基因dn 42 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未注释的DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ceribelli基因不活跃,受NFY的约束 45 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanoevelen肌发生SIN3A靶标 220 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因