基因页面:PLCD4
总结吗?
| GeneID | 84812年 |
| 象征 | PLCD4 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | 磷脂酶Cδ4 |
| 参考 | MIM: 605939|HGNC: HGNC: 9062|运用:ENSG00000115556|HPRD: 07296|织女:OTTHUMG00000154743 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 2 q35 |
| 夏洛克假定值 | 1.549 e-5 |
| 胎儿β | -0.508 |
| eGene | 小脑半球 小脑 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 认为:McCarthy_2014 | 全外显子组测序分析 | 全外显子组测序的57个三人小组与零星或家族性精神分裂症。 | |
| GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.01016 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.00916 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PLCD4 | chr2 | 219498436 | 一个 | G | NM_032726 | p.I520V | 错义SNV | 精神分裂症 | 认为:McCarthy_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0004871 | 信号传感器活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005509 | 钙离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0004435 | 磷酸肌醇磷脂酶C活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016787 | 水解酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008081 | 磷酸二酯水解酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0016042 | 脂质分解过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0007242 | 细胞内的信号级联 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006629 | 脂质代谢过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0007340 | 顶体反应 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005783 | 内质网 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG磷酸肌醇代谢 | 54 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG钙信号通路 | 178年 | 134年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG磷脂酰肌醇信号系统 | 76年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| APPIERTO FENRETINIDE反应 | 38 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MARTORIATI MDM4目标胎儿肝脏 | 227年 | 137年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NUYTTEN NIPP1的目标了 | 769年 | 437年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HILLION HMGA1的目标 | 90年 | 71年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伽马辐射2 g后AMUNDSON穷人生存 | 171年 | 96年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MATZUK精子 | 114年 | 77年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MEF和H3K27ME3连结控制协定 | 70年 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森人大与H3K4ME3连结控制协定 | 58 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 199 | 547年 | 553年 | 1 | hsa - mir - 199 a | CCCAGUGUUCAGACUACCUGUUC |
| hsa - mir - 199 b | CCCAGUGUUUAGACUAUCUGUUC | ||||