基因页：lingo1

概括？
基因 84894
象征 lingo1
同义词 Lern1 | lrrn6a | UNQ201
描述 含亮氨酸丰富的重复和IG结构域包含1
参考 MIM：609791|HGNC：HGNC：21205|Ensembl：ENSG00000169783|HPRD：14322|Vega：Otthumg00000172629
基因类型 蛋白质编码
地图位置 15Q24.3
Pascal P值 0.067
Sherlock P值 0.49
胎儿β 0.702
DMG 1（＃研究）
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
梭子基底神经节
支持 细胞内信号转导
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG10107330 15 77922677 lingo1 1.26e-5 0.647 0.014 DMG：Wockner_2014
CG26884775 15 77906127 lingo1 4.059E-4 0.351 0.044 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2667781 15 77858619 lingo1 ENSG00000169783.8 2.411E-6 0.04 254623 gtex_brain_putamen_basal
RS2667782 15 77862296 lingo1 ENSG00000169783.8 2.46E-6 0.04 250946 gtex_brain_putamen_basal
RS2667783 15 77862529 lingo1 ENSG00000169783.8 2.468e-6 0.04 250713 gtex_brain_putamen_basal
RS2667775 15 77864802 lingo1 ENSG00000169783.8 2.468e-6 0.04 248440 gtex_brain_putamen_basal
RS2682921 15 77865459 lingo1 ENSG00000169783.8 2.468e-6 0.04 247783 gtex_brain_putamen_basal
RS939488 15 77867780 lingo1 ENSG00000169783.8 2.721E-6 0.04 245462 gtex_brain_putamen_basal
RS868297 15 77873769 lingo1 ENSG00000169783.8 2.571E-6 0.04 239473 gtex_brain_putamen_basal
RS2667769 15 77874877 lingo1 ENSG00000169783.8 2.552E-6 0.04 238365 gtex_brain_putamen_basal
RS2667768 15 77875117 lingo1 ENSG00000169783.8 2.56E-6 0.04 238125 gtex_brain_putamen_basal
RS2682911 15 77875591 lingo1 ENSG00000169783.8 2.571E-6 0.04 237651 gtex_brain_putamen_basal
RS2667767 15 77876031 lingo1 ENSG00000169783.8 2.113E-6 0.04 237211 gtex_brain_putamen_basal
RS867918 15 77882726 lingo1 ENSG00000169783.8 2.593E-6 0.04 230516 gtex_brain_putamen_basal
RS58600827 15 77884322 lingo1 ENSG00000169783.8 2.583E-6 0.04 228920 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
PID P75 NTR途径 69 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P75 NTR受体介导的信号传导 81 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP63目标 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Oct4目标 290 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath NOS目标 179 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
staege ewing家庭肿瘤 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性2 473 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌干细胞向上 47 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因