基因页：atoh8
概括？
| 基因 | 84913 |
| 象征 | atoh8 |
| 同义词 | HATH6 | BHLHA21 |
| 描述 | Atonal BHLH转录因子8 |
| 参考 | HGNC：HGNC：24126|HPRD：09813| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2P11.2 |
| Pascal P值 | 0.152 |
| Sherlock P值 | 0.904 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0004 | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG00400334 | 2 | 85981962 | atoh8 | 9.6e-10 | -0.013 | 1.14E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003677 | DNA结合 | IEA | - | |
| GO：0030528 | 转录调节器活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007399 | 神经系统的发展 | IEA | 神经突（GO期限：5） | - |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| 去：0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
| 去：0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Gargalovic对氧化磷脂的反应蓝色DN | 61 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gargalovic对氧化磷脂的反应灰色DN | 74 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 | 329 | 219 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SEKI炎症反应LPS DN | 23 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 142 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应很晚 | 317 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durand Stroma ns | 162 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-125/351 | 131 | 137 | M8 | HSA-MIR-125B脑 | ucccugagacccuaacuuguga |
| HSA-MIR-125A脑 | ucccugagacccuuaaccugug | ||||
| mir-133 | 1022 | 1028 | M8 | HSA-MIR-133A | uugguccccuucaaccagcugu |
| HSA-MIR-133B | uguguccccuucaaccagcua | ||||
| mir-137 | 722 | 729 | 1A，M8 | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
| mir-182 | 292 | 299 | 1A，M8 | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
| mir-331 | 1026 | 1033 | 1A，M8 | HSA-MIR-331脑 | gccccugggccuauccuagaa |
| mir-9 | 295 | 301 | 1a | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |
| HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga | ||||
| mir-96 | 293 | 299 | 1a | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |