基因页:PRSS12
概括?
基因 | 8492 |
象征 | PRSS12 |
同义词 | BSSP-3 | BSSP3 | MRT1 |
描述 | 蛋白酶,丝氨酸12 |
参考 | MIM:606709|HGNC:HGNC:9477|Ensembl:ENSG00000164099|HPRD:05989|Vega:Otthumg00000161166 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4Q28.1 |
Pascal P值 | 0.014 |
耶和华 | 伏隔核基底神经节 |
支持 | 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PRSS12_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共同表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FAM113A | 0.88 | 0.87 |
Rab24 | 0.87 | 0.86 |
trmu | 0.84 | 0.83 |
ADCK5 | 0.84 | 0.84 |
HDAC10 | 0.84 | 0.88 |
AC010538.1 | 0.84 | 0.84 |
NCAPH2 | 0.83 | 0.81 |
DOM3Z | 0.83 | 0.84 |
RP3-402G11.1 | 0.83 | 0.79 |
CENPT | 0.83 | 0.85 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.8 | -0.60 | -0.52 |
MT-CO2 | -0.60 | -0.51 |
AF347015.2 | -0.60 | -0.53 |
AF347015.31 | -0.60 | -0.51 |
mt-cyb | -0.60 | -0.52 |
AF347015.21 | -0.59 | -0.52 |
AF347015.27 | -0.59 | -0.53 |
AF347015.15 | -0.57 | -0.51 |
MT-ATP8 | -0.57 | -0.57 |
AF347015.33 | -0.56 | -0.48 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004252 | 丝氨酸型内肽酶活性 | IEA | 谷氨酸(GO期限:7) | - |
去:0005044 | 清道夫受体活性 | IEA | - | |
去:0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
去:0006508 | 蛋白水解 | IEA | - | |
细胞成分 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Charafe乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
环氧化物素的浓凋亡 | 239 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Mycn放大靶向 | 92 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim MyCl1扩增靶向 | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27Me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Goldrath免疫记忆 | 65 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王顺铂反应和XPC DN | 228 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bacolod抗烷基化剂的抗性 | 26 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4Me3和H3K27Me3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸反应dn | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标增长 | 243 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoelzel NF1靶向 | 139 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 | 229 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA ECM监管机构 | 238 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |