基因页面:ATG4C
总结吗?
| GeneID | 84938年 |
| 象征 | ATG4C |
| 同义词 | APG4-C | APG4C | AUTL1 | AUTL3 |
| 描述 | 自噬相关4 c半胱氨酸肽酶 |
| 参考 | MIM: 611339|HGNC: HGNC: 16040|运用:ENSG00000125703|HPRD: 07473|织女:OTTHUMG00000009142 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 1 p31.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.525 |
| 夏洛克假定值 | 0.322 |
| 胎儿β | -0.725 |
| eGene | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.02692 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2322319 | chr3 | 3637199 | ATG4C | 84938年 | 0.11 | 反式 | ||
| rs17137051 | chr16 | 4521748 | ATG4C | 84938年 | 0.13 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际空间站 | 12446702 | |
| 去:0004197 | cysteine-type肽链内切酶活性 | 国际空间站 | 12446702 | |
| 去:0008017 | 微管结合 | 国际空间站 | 12446702 | |
| 去:0008233 | 肽酶的活动 | 艾达 | 12446702 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0000045 | 自噬小体的形成 | 国际空间站 | 12446702 | |
| 去:0006508 | 蛋白水解作用 | 艾达 | 12446702 | |
| 去:0006511 | ubiquitin-dependent蛋白质分解代谢的过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006623 | 蛋白质定位泡 | 国际空间站 | 12446702 | |
| 去:0006914 | 自噬 | IGI | 12446702 | |
| 去:0006612 | 蛋白质定位膜 | 国际空间站 | 12446702 | |
| 去:0015031 | 蛋白质的运输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005829 | 胞质 | 国际空间站 | 12446702 | |
| 去:0005875 | 微管相关的复杂 | 国际空间站 | 12446702 | |
| 去:0005576 | 细胞外区域 | 艾达 | 12446702 | |
| 去:0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
| 去:0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际空间站 | 12446702 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG调节自噬 | 35 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 年级结肠癌DN | 33 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZEMBUTSU对顺铂的敏感性 | 20. | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王GSK3反应抑制剂SB216763 | 397年 | 206年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |