基因页面:IGSF21

总结吗?
GeneID 84966年
象征 IGSF21
同义词 - - - - - -
描述 immunoglobin总科成员21
参考 HGNC: HGNC: 28246|运用:ENSG00000117154|HPRD: 11309|织女:OTTHUMG00000002432
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 1 p36.13
帕斯卡假定值 4.598的军医
夏洛克假定值 0.963
胎儿β -0.471
DMG 2(#研究)
eGene 小脑半球
小脑
额叶皮质BA9
迈尔斯的顺式和反式
支持 G2Cdb.humanPSD
G2Cdb.humanPSP

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:GWASdb 全基因组关联研究 精神分裂症GWASdb记录
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 2
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 2

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg13921220 1 18610522 IGSF21 1.956的军医 0.484 0.035 DMG: Wockner_2014
cg17211582 1 18435858 IGSF21 9.56 e-9 -0.024 4.24 e-6 DMG: Jaffe_2016

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs1578978 chr8 118196802 IGSF21 84966年 0.04 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

没有大脑中的基因区域


第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 源 PubMed ID
ALDH2 ALDH-E2 | ALDHI | ALDM | MGC1806 醛脱氢酶2家(线粒体) 2台混合动力 BioGRID 16169070
ANXA3 ANX3 膜联蛋白A3 2台混合动力 BioGRID 16169070
ATF3 - - - - - - 激活转录因子3 2台混合动力 BioGRID 16169070
BCR 所有| bcr - abl1 | BCR1 | CML | D22S11 | D22S662 | FLJ16453 | PHL 断点集群区域 2台混合动力 BioGRID 16169070
BTBD2 - - - - - - BTB (POZ)域包含2 2台混合动力 BioGRID 16169070
C5orf13 D4S114 | P311 | PRO1873 | PTZ17 5开放阅读框13号染色体 2台混合动力 BioGRID 16169070
CRCT1 C1orf42 | NICE-1 cysteine-rich c端1 2台混合动力 BioGRID 16169070
DGKD DGKdelta | FLJ26930 | KIAA0145 | dgkd-2 二酰基甘油激酶,δ130 kda 2台混合动力 BioGRID 16169070
二 滴| FLJ27340 增强剂的基本的相同器官(果蝇) 2台混合动力 BioGRID 16169070
ETHE1 HSCO | YF13H12 ethylmalonic脑病1 2台混合动力 BioGRID 16169070
GIPC2 FLJ20075 | SEMCAP-2 | SEMCAP2 GIPC PDZ域包含家庭,成员2 2台混合动力 BioGRID 16169070
GSTM4 GSTM4-4 | GTM4 | MGC131945 | MGC9247 谷胱甘肽S-transferaseμ4 2台混合动力 BioGRID 16169070
HSPB1 CMT2F | DKFZp586P1322 | HMN2B | HS.76067 | HSP27 | HSP28 | Hsp25 | SRP27 27 kda热休克蛋白1 2台混合动力 BioGRID 16169070
MAD2L1BP CMT2 | KIAA0110 | MGC11282 |一国- 261 g23.6 MAD2L1结合蛋白 2台混合动力 BioGRID 16169070
项目实施 HSD48 | MGC117224 | NACA1 新生polypeptide-associated复杂的α亚基 2台混合动力 BioGRID 16169070
PAEP GD | GdA | GdF | GdS | MGC138509 | MGC142288 | PAEG | PEP | PP14 progestagen-associated子宫内膜的蛋白质 2台混合动力 BioGRID 16169070
PAFAH1B3 - - - - - - Ib acetylhydrolase platelet-activating因素,对碘氧基苯甲醚,γ亚基29 kda 2台混合动力 BioGRID 16169070
PCDHA4 CNR1 | CNRN1 | CRNR1 | MGC138307 | MGC142169 | PCDH-ALPHA4 protocadherin alpha 4 2台混合动力 BioGRID 16169070
PRMT1 ANM1 | HCP1 | HRMT1L2 | IR1B4 蛋白质精氨酸甲基转移酶1 2台混合动力 BioGRID 16169070
PSMD11 MGC3844 | Rpn6 | S9 | p44.5 蛋白酶体(prosome macropain) 26 s亚基,non-ATPase 11 2台混合动力 BioGRID 16169070
RPP14 FLJ31508 |好 核糖核酸酶P / MRP 14 kda亚基 2台混合动力 BioGRID 16169070
S100A8 60 b8ag | CAGA | CFAG | CGLA | CP-10 | L1Ag | MA387 | MIF | MRP8 | NIF | P8 S100钙结合蛋白A8 2台混合动力 BioGRID 16169070
SEPHS1 MGC4980 | SELD | SPS | SPS1 selenophosphate合成酶1 2台混合动力 BioGRID 16169070
SERPINB9 CAP-3 | CAP3 | PI9 serpin肽酶抑制剂,支系B(卵白蛋白),成员9 2台混合动力 BioGRID 16169070
SULT1E1 美国东部时间| EST-1 | MGC34459 | STE sulfotransferase家庭1 e, estrogen-preferring,成员1 2台混合动力 BioGRID 16169070
TRBV2 TCRBV22S1A2N1T | TCRBV2S1 变量T细胞受体β2 2台混合动力 BioGRID 16169070
UBE2V2 DDVIT1 | DDVit-1 | EDAF-1 | EDPF-1 | EDPF1 | MMS2 | UEV-2 | UEV2 ubiquitin-conjugating酶E2变种2 2台混合动力 BioGRID 16169070


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
BENPORATH SUZ12目标 1038年 678年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH速度的目标 1062年 725年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH ES与H3K27ME3 1118年 744年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH PRC2目标 652年 441年 所有SZGR 2.0基因通路
WHITEHURST紫杉醇敏感性 39 19 所有SZGR 2.0基因通路
损害阻力BCL2抑制剂DN 48 31日 所有SZGR 2.0基因通路
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 1069年 729年 所有SZGR 2.0基因通路
迈斯纳人大HCP H3K4ME2和H3K27ME3 349年 234年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 435年 318年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森人大HCP H3K27ME3 341年 243年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 590年 403年 所有SZGR 2.0基因通路
马顿斯维甲酸反应了 857年 456年 所有SZGR 2.0基因通路