基因页面:CEP19
总结吗?
GeneID | 84984年 |
象征 | CEP19 |
同义词 | C3orf34 | MOSPGF |
描述 | 19 kda centrosomal蛋白质 |
参考 | MIM: 615586|HGNC: HGNC: 28209|运用:ENSG00000174007|HPRD: 17488|织女:OTTHUMG00000153933 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 3 q29 |
帕斯卡假定值 | 0.369 |
夏洛克假定值 | 0.082 |
胎儿β | -0.241 |
eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 皮质 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CNV:是的 | 拷贝数变异的研究 | 人工管理 | |
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs10211183 | chr2 | 60302291 | C3orf34 | 84984年 | 0.19 | 反式 | ||
rs2840033 | chr5 | 124609648 | C3orf34 | 84984年 | 0.07 | 反式 | ||
rs1463626 | 3 | 196454560 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 3.058 e - | 0.02 | -15396年 | gtex_brain_ba24 |
rs9849684 | 3 | 196433031 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.585 e-8 | 0 | 6133年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs7646550 | 3 | 196433421 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.585 e-8 | 0 | 5743年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs9840915 | 3 | 196433441 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.585 e-8 | 0 | 5723年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs7616240 | 3 | 196433623 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.585 e-8 | 0 | 5541年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs71621289 | 3 | 196433653 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.777 e-8 | 0 | 5511年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs7647102 | 3 | 196433984 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.585 e-8 | 0 | 5180年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs9843349 | 3 | 196435138 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 2.38 e-8 | 0 | 4026年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs55901490 | 3 | 196435331 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 2.352 e-8 | 0 | 3833年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs6776064 | 3 | 196435534 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 2.354 e-8 | 0 | 3630年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs6785167 | 3 | 196435986 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 2.354 e-8 | 0 | 3178年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs6809954 | 3 | 196435994 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.585 e-8 | 0 | 3170年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs11919448 | 3 | 196436629 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 2.402 e-8 | 0 | 2535年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs9834389 | 3 | 196437004 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 4.469 e-8 | 0 | 2160年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs9858181 | 3 | 196437197 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.364 e - | 0 | 1967年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs9875088 | 3 | 196437309 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 4.202 e-8 | 0 | 1855年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs7628991 | 3 | 196437936 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.12 e - | 0 | 1228年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs6583170 | 3 | 196438428 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 8.557 e - | 0 | 736年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs9863311 | 3 | 196440527 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.76 e-6 | 0 | -1363年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs9846528 | 3 | 196440733 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.274 e-6 | 0 | -1569年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs9850649 | 3 | 196440808 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.274 e-6 | 0 | -1644年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs9863919 | 3 | 196440935 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.274 e-6 | 0 | -1771年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs11185453 | 3 | 196441140 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 6.644 e - | 0 | -1976年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs11185454 | 3 | 196441170 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.274 e-6 | 0 | -2006年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs73089240 | 3 | 196441583 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.853 e-6 | 0 | -2419年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1580470 | 3 | 196442132 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.274 e-6 | 0 | -2968年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs7627914 | 3 | 196442734 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.467 e-6 | 0 | -3570年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1906045 | 3 | 196443826 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.523 e-6 | 0 | -4662年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs56196731 | 3 | 196443996 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.274 e-6 | 0 | -4832年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs79777668 | 3 | 196444636 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 7.221 e - | 0 | -5472年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs7632005 | 3 | 196444970 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.274 e-6 | 0 | -5806年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs7632017 | 3 | 196445009 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.535 e-6 | 0 | -5845年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs9789985 | 3 | 196445436 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.274 e-6 | 0 | -6272年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs9790275 | 3 | 196445482 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.274 e-6 | 0 | -6318年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs73203735 | 3 | 196446161 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 7.498 e - | 0 | -6997年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs55809933 | 3 | 196447340 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 7.843 e - | 0 | -8176年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs67887445 | 3 | 196447519 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.242 e-6 | 0 | -8355年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs77654748 | 3 | 196447619 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 7.892 e - | 0 | -8455年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs9864896 | 3 | 196448103 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.376 e-6 | 0 | -8939年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs9869881 | 3 | 196448911 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 8.287 e - | 0 | -9747年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1567766 | 3 | 196450415 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 8.78 e - | 0 | -11251年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs28454528 | 3 | 196451134 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 9.923 e - | 0 | -11970年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2049232 | 3 | 196452238 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 3.978 e - | 0 | -13074年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1976847 | 3 | 196453427 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.274 e-6 | 0 | -14263年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1568603 | 3 | 196453467 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 4.339 e - | 0 | -14303年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs12637375 | 3 | 196453654 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 7.185 e - | 0 | -14490年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs6772328 | 3 | 196457132 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 9.831 e - | 0 | -17968年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs56342540 | 3 | 196458538 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 7.068 e - | 0 | -19374年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs73072745 | 3 | 196459004 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.321 e-6 | 0 | -19840年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs9860612 | 3 | 196459300 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.653 e-6 | 0 | -20136年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs9847505 | 3 | 196459301 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.702 e-6 | 0 | -20137年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs3850647 | 3 | 196459709 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 7.299 e - | 0 | -20545年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs6805472 | 3 | 196461169 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.395 e-6 | 0 | -22005年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1047113 | 3 | 196461474 | CEP19 | ENSG00000174007.7 | 1.026 e-6 | 0 | -22310年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CEP19_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
周炎症反应费马DN | 284年 | 156年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NUYTTEN NIPP1的目标了 | 769年 | 437年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NUYTTEN EZH2的目标了 | 1037年 | 673年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
鲜明的前额叶皮层22 q11删除DN | 517年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
乔治MIR192和MIR215的目标 | 893年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时 | 953年 | 554年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KRIGE TOSEDOSTAT反应24小时 | 783年 | 442年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CREIGHTON内分泌治疗抵抗2 | 473年 | 224年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
国外RB1目标衰老 | 572年 | 352年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG RXRA 8 d | 882年 | 506年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |