基因页:SLC43A1
概括?
基因 | 8501 |
象征 | SLC43A1 |
同义词 | LAT3 | PB39 | POV1 | R00504 |
描述 | Solute Carrier家族43成员1 |
参考 | MIM:603733|HGNC:HGNC:9225|Ensembl:ENSG00000149150|HPRD:07227|Vega:Otthumg00000167030 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q12.1 |
Pascal P值 | 0.001 |
主持人 | 小脑半球 小脑 皮质 伏隔核基底神经节 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值:1.42 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SLC43A1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
DOCK3 | 0.95 | 0.94 |
ABR | 0.94 | 0.94 |
STXBP1 | 0.93 | 0.95 |
BTBD9 | 0.92 | 0.91 |
KIAA1467 | 0.92 | 0.90 |
clstn1 | 0.92 | 0.92 |
FBXO34 | 0.91 | 0.90 |
DLGAP1 | 0.91 | 0.93 |
htt | 0.91 | 0.90 |
PNMA2 | 0.91 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.64 | -0.57 |
C1orf54 | -0.62 | -0.64 |
AP002478.3 | -0.62 | -0.61 |
GNG11 | -0.61 | -0.61 |
C1orf61 | -0.60 | -0.68 |
ACSF2 | -0.59 | -0.59 |
higd1b | -0.59 | -0.54 |
FXYD1 | -0.59 | -0.51 |
PLA2G5 | -0.59 | -0.52 |
VAMP5 | -0.58 | -0.55 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0015175 | 中性氨基酸跨膜转运蛋白活性 | 艾达 | 12930836 | |
GO:0015179 | L-氨基酸跨膜转运蛋白活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0015807 | L-氨基酸转运 | IEA | - | |
GO:0015804 | 中性氨基酸转运 | 艾达 | 12930836 | |
去:0006810 | 运输 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 12930836 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
反应组氨基酸跨质膜的转运 | 31 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 | 94 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组氨基酸和寡肽SLC转运蛋白 | 49 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘前列腺癌 | 96 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tien肠益生菌24小时DN | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amundson对砷的回应 | 217 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭亮氨酸剥夺 | 142 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kang氟尿嘧啶抵抗DN | 16 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Xu GH1自分泌目标 | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yegnasubramanian前列腺癌 | 128 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Korkola胚胎癌与精液瘤DN | 25 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 | 259 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合的骨靶标 | 271 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |