概括
基因 8501
象征 SLC43A1
同义词 LAT3 | PB39 | POV1 | R00504
描述 Solute Carrier家族43成员1
参考 MIM:603733|HGNC:HGNC:9225|Ensembl:ENSG00000149150|HPRD:07227|Vega:Otthumg00000167030
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q12.1
Pascal P值 0.001
主持人 小脑半球
小脑
皮质
伏隔核基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.42

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DOCK3 0.95 0.94
ABR 0.94 0.94
STXBP1 0.93 0.95
BTBD9 0.92 0.91
KIAA1467 0.92 0.90
clstn1 0.92 0.92
FBXO34 0.91 0.90
DLGAP1 0.91 0.93
htt 0.91 0.90
PNMA2 0.91 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.64 -0.57
C1orf54 -0.62 -0.64
AP002478.3 -0.62 -0.61
GNG11 -0.61 -0.61
C1orf61 -0.60 -0.68
ACSF2 -0.59 -0.59
higd1b -0.59 -0.54
FXYD1 -0.59 -0.51
PLA2G5 -0.59 -0.52
VAMP5 -0.58 -0.55

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0015175 中性氨基酸跨膜转运蛋白活性 艾达 12930836
GO:0015179 L-氨基酸跨膜转运蛋白活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0015807 L-氨基酸转运 IEA -
GO:0015804 中性氨基酸转运 艾达 12930836
去:0006810 运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
去:0005887 质膜的积分 塔斯 12930836

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
反应组氨基酸跨质膜的转运 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 94 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组氨基酸和寡肽SLC转运蛋白 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌 96 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌24小时DN 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson对砷的回应 217 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭亮氨酸剥夺 142 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kang氟尿嘧啶抵抗DN 16 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yegnasubramanian前列腺癌 128 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Korkola胚胎癌与精液瘤DN 25 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 259 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合的骨靶标 271 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma S向上 297 194 该途径中的所有SZGR 2.0基因