基因页:REPS1
概括?
基因 | 85021 |
象征 | REPS1 |
同义词 | ralbp1 |
描述 | RALBP1相关的EPS域,包含1个 |
参考 | MIM:614825|HGNC:HGNC:15578|Ensembl:ENSG00000135597|HPRD:09687|Vega:Otthumg0000000015685 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q24.1 |
Pascal P值 | 0.175 |
Sherlock P值 | 0.325 |
胎儿β | 0.416 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG13850325 | 6 | 139309169 | REPS1 | 6.25e-5 | -0.408 | 0.023 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
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Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee肝癌ACOX1 DN | 65 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Myc E2F1 DN | 64 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee肝癌E2F1 DN | 64 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
布鲁诺造血 | 66 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |