基因页面:PEX3
总结吗?
| GeneID | 8504年 |
| 象征 | PEX3 |
| 同义词 | PBD10A | TRG18 |
| 描述 | 过氧化物酶病生物起源因素3 |
| 参考 | MIM: 603164|HGNC: HGNC: 8858|HPRD: 04407| |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6 q24.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.646 |
| 胎儿β | -0.121 |
| DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 2 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg06866400 | 6 | 143771904 | ADAT2; PEX3 | 1.33 e-5 | -0.375 | 0.014 | DMG: Wockner_2014 |
| cg21684385 | 6 | 143772210 | PEX3 | 1.07 e-8 | -0.014 | 4.56 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SF1 | 0.96 | 0.96 |
| DNMT1 | 0.95 | 0.96 |
| CHERP | 0.95 | 0.97 |
| RPRD2 | 0.95 | 0.94 |
| CPSF7 | 0.94 | 0.93 |
| NUP214 | 0.94 | 0.94 |
| pfa | 0.94 | 0.96 |
| PATL1 | 0.94 | 0.92 |
| 即 | 0.94 | 0.95 |
| SF3A1 | 0.94 | 0.95 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.78 | -0.89 |
| MT-CO2 | -0.77 | -0.90 |
| C5orf53 | -0.75 | -0.79 |
| AF347015.33 | -0.74 | -0.84 |
| S100B | -0.74 | -0.84 |
| AF347015.27 | -0.74 | -0.85 |
| FXYD1 | -0.74 | -0.84 |
| MT-CYB | -0.73 | -0.84 |
| HIGD1B | -0.72 | -0.85 |
| AF347015.8 | -0.72 | -0.86 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 10704444|11883941 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007031 | 过氧物酶体组织 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0007031 | 过氧物酶体组织 | 小鬼 | 10958759|12924628 | |
| 去:0045046 | 蛋白导入过氧物酶体膜 | 小鬼 | 15007061 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005777 | 过氧物酶体 | 小鬼 | 12924628 | |
| 去:0005778 | 过氧化物酶病膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005779 | 不可或缺的酶膜 | 艾达 | 9657383|10430017 | |
| 去:0005779 | 不可或缺的酶膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG过氧物酶体 | 78年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME ABCA转运蛋白在脂质稳态 | 18 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME ABC家族蛋白介导运输 | 34 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME小分子的跨膜运输 | 413年 | 270年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过CD40 HOLLMANN细胞凋亡 | 201年 | 125年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN MLL签名2 DN | 281年 | 186年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TIEN肠道益生菌24小时 | 557年 | 331年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 长岛NRG1信号DN | 58 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 角化细胞DN ENK紫外线反应 | 485年 | 334年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 乳腺癌顶浆分泌与腔的农民 | 326年 | 213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 | 855年 | 609年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 滑落紫外线反应通过ERCC3常见的DN | 483年 | 336年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH MYC和上述目标 | 230年 | 156年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 沈SMARCA2目标了 | 424年 | 268年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 费尔南德斯受MYC | 182年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FLECHNER活检肾移植排斥和好的DN | 546年 | 351年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FLECHNER活检肾移植好的VS捐赠 | 555年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MAHAJAN应对IL1A DN | 76年 | 57 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAVIN FOXP3目标集群P2 | 79年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 麦凯布受HOXC6 | 469年 | 239年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝脏肿瘤旁正常组织 | 174年 | 96年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织DN | 274年 | 165年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BONOME卵巢癌穷人生存 | 31日 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BONOME卵巢癌生存非最优减积 | 510年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 若林史江脂肪生成PPARG RXRA 8 d | 882年 | 506年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 若林史江脂肪生成PPARG RXRA绑定与H4K20ME1马克 | 145年 | 82年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过KDM3A KRIEG缺氧不 | 770年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 农民乳腺癌集群3 | 16 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |