概括
基因 8515
象征 itga10
同义词 Pro827
描述 整合素亚基α10
参考 MIM:604042|HGNC:HGNC:6135|ENSEMBL:ENSG00000143127|HPRD:04952|Vega:Otthumg0000000013751
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q21

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CNV:是的 拷贝数变异研究 手动策划
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00814

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000287 镁离子结合 IEA -
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0005509 钙离子结合 IEA -
去:0005518 胶原蛋白结合 塔斯 9685391
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007160 细胞 - 矩阵粘附 塔斯 9685391
去:0007155 细胞粘附 IEA -
去:0007229 整联蛋白介导的信号通路 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0008305 整联蛋白复合物 塔斯 9685391

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg焦点粘附 201 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ECM受体相互作用 84 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG肥厚性心肌病HCM 85 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG心律失常右心肌病ARVC 76 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG扩张心肌病 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST整合素信号通路 82 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Integin1途径 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID整合素CS途径 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ARF6贩运途径 49 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CXCR4途径 102 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome整合素细胞表面相互作用 79 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gal白血病干细胞向上 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2向上 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein Midbrain标记 82 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-375 1564年 1570年 1a HSA-MIR-375 uuuguucguucggcucgcguga
mir-493-5p 575 581 1a HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu