基因页：ikbkap
概括？
| 基因 | 8518 |
| 象征 | ikbkap |
| 同义词 | dys | elp1 | fd | ikap | iki3 | tot1 |
| 描述 | B细胞中Kappa光多肽基因增强子的抑制剂，激酶复合物相关蛋白 |
| 参考 | MIM：603722|HGNC：HGNC：5959|Ensembl：ENSG00000070061|HPRD：04763|Vega：Otthumg00000020465 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 9q31 |
| Pascal P值 | 0.045 |
| Sherlock P值 | 0.766 |
| 胎儿β | 0.532 |
| 主持人 | 伏隔核基底神经节 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.1609 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004871 | 信号传感器活性 | 塔斯 | 9751059 | |
| 去：0003677 | DNA结合 | 艾达 | 11714725 | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 10094049|14667819|15383276 |
|
| 去：0008607 | 磷酸化酶激酶调节剂活性 | 艾达 | 11818576 | |
| 去：0016944 | RNA聚合酶II转录伸长因子活性 | 艾达 | 11714725 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006357 | 调节RNA聚合酶II启动子的转录 | 艾达 | 11818576 | |
| 去：0006350 | 转录 | IEA | - | |
| 去：0006461 | 蛋白质复合物组件 | 塔斯 | 9751059 | |
| 去：0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | 塔斯 | 9751059 | |
| 去：0006955 | 免疫反应 | 塔斯 | 9751059 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005730 | 核仁 | 艾达 | 11714725 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 11714725 | |
| 去：0008023 | 转录伸长因子复合物 | 艾达 | 11714725 | |
| GO：0016591 | DNA定向的RNA聚合酶II，全酶 | 艾达 | 11714725 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| BAT3 | Bag-6 |Bag6 |D6S52E |G3 | HLA-B相关的成绩单3 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| C11orf79 | FLJ20487 | 染色体11开放阅读框79 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| CCT5 | cct-epsilon |CCTE |KIAA0098 |TCP-1- epsilon | 伴侣素含有TCP1，亚基5（Epsilon） | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| CDKN2B | cdk4i |ink4b |mts2 |P15 |TP15 |p15ink4b | 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B（P15，抑制CDK4） | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| 楚克 | ikbka |ikk-alpha |ikk1 |ikka |nfkbika |TCF16 | 保守的螺旋环螺旋无处不在激酶 | IKAP与IKK-Alpha互动。这种相互作用是基于未指定物种的人IKAP和IKK-ALPHA之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 9751059 |
| 楚克 | ikbka |ikk-alpha |ikk1 |ikka |nfkbika |TCF16 | 保守的螺旋环螺旋无处不在激酶 | - | HPRD，Biogrid | 9751059 |
| CSTF2 | CSTF-64 | 切割刺激因子，3'Pre-RNA，亚基2，64KDA | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| ELP2 | FLJ10879 |Shinc-2 |Statip1 |Stip | 伸长蛋白2同源物（S. cerevisiae） | 共纯化 | Biogrid | 11714725 |
| elp3 | FLJ10422 |Kat9 | 伸长蛋白3同源物（酿酒酵母） | - | HPRD | 10936 |
| elp3 | FLJ10422 |Kat9 | 伸长蛋白3同源物（酿酒酵母） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共纯化 |
Biogrid | 11714725 |
| ELP4 | C11orf19 |FLJ20498 |pax6neb |paxneb |DJ68P15A.1 | 伸长蛋白4同源物（S. cerevisiae） | 共纯化 | Biogrid | 11714725 |
| ikbkb | FLJ40509 |ikk-beta |ikk2 |ikkb |MGC131801 |nfkbikb | B细胞，激酶β的Kappa光多肽基因增强子的抑制剂 | IKAP与Ikk-Beta互动。 | 绑定 | 9751059 |
| ikbkb | FLJ40509 |ikk-beta |ikk2 |ikkb |MGC131801 |nfkbikb | B细胞，激酶β的Kappa光多肽基因增强子的抑制剂 | - | HPRD，Biogrid | 9751059 |
| man2a2 | mana2x | 甘露糖苷酶，Alpha，2A级，成员2 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| MAP3K14 | ftdcr1b |HS |hsnik |尼克 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶14 | - | HPRD，Biogrid | 9751059 |
| MAP3K14 | ftdcr1b |HS |hsnik |尼克 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶14 | IKAP与Nik互动。 | 绑定 | 9751059 |
| MAPK8 | jnk |JNK1 |JNK1A2 |JNK21B1/2 |prkm8 |SAPK1 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶8 | - | HPRD，Biogrid | 12058026 |
| MRPL42 | HSPC204 |MRP-L31 |MRPL31 |MRPS32 |PTD007 |RPML31 | 线粒体核糖体蛋白L42 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| NDUFB9 | B22 |DKFZP566O173 |FLJ22885 |lyrm3 |UQOR22 | NADH脱氢酶（泛氨基酮）1 Beta子复合物，9，22KDA | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| NFKBIA | ikba |Mad-3 |nfkbi | B细胞抑制剂Alpha中Kappa光多肽基因增强子的核因子 | 重构的复合物 | Biogrid | 9751059 |
| nipsnap3a | DKFZP564D177 |FLJ13953 |HSPC299 |MGC14553 |nipsnap4 |tassc | NIPSNAP同源物3A（秀丽隐杆线虫） | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| PLP2 | A4 |A4-LSB |MGC126187 | 蛋白质蛋白2（结肠上皮富含） | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| Snapin | 快照 | 快速相关的蛋白质 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| TAC3 | NKB |nknb |Pro1155 |Zneurok1 | tachykinin 3 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| ttr | HST2651 |palb |TBPA | 经硫代蛋白 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| TXNDC9 | apacd | 含有9的硫氧还蛋白结构域 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Biocarta CD40途径 | 15 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta TNFR2途径 | 18 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2目标 | 424 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标 | 212 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Worschech肿瘤排斥DN | 10 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Firestein增殖 | 175 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boyault肝癌子类G1 UP | 113 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML与11q23重新排列 | 351 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤 | 207 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| Let-7/98 | 313 | 319 | M8 | HSA-LET-7A脑 | ugagguaguaguauauaguu |
| HSA-LET-7B脑 | ugagguaguagguuguguguguu | ||||
| HSA-LET-7C脑 | ugagguaguagguuguaugguu | ||||
| HSA-LET-7D脑 | agagguaguagguugcauagu | ||||
| HSA-LET-7E脑 | ugagguaggagguuauauagu | ||||
| HSA-LET-7F脑 | ugagguagauuguauauaguu | ||||
| HSA-MIR-98脑 | ugagguaaguuguauuguu | ||||
| HSA-LET-7GSZ | ugagguaguuguuguacagu | ||||
| HSA-LET-7I脑 | ugagguaguugugugugugcugu | ||||
| mir-494 | 299 | 306 | 1A，M8 | HSA-MIR-494脑 | ugaaacauacgggaaaccucuu |