概括
基因 85378
象征 TUBGCP6
同义词 GCP-6 | GCP6 | MCCRP | MCCRP1 | MCPHCR
描述 微管蛋白伽马复合物相关蛋白6
参考 MIM:610053|HGNC:HGNC:18127|ENSEMBL:ENSG00000128159|HPRD:15589|Vega:Otthumg00000030150
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22Q13.31-Q13.33
Pascal P值 0.034
Sherlock P值 0.598
胎儿β 0.308
DMG 1(#研究)
主持人 小脑
皮质
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG19723402 22 50659156 TUBGCP6 4.848e-4 0.407 0.046 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS999051 CHR1 203411858 TUBGCP6 85378 0.12 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
反应组细胞周期 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期有丝分裂 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome募集有丝分裂的中心体蛋白和复合物 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组募集NUMA到有丝分裂的中心体 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome有丝分裂G2 G2 M相 81 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌22q13 Amplicon 17 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg KDM3A靶向缺氧 208 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因