基因页面:BARX2
总结吗?
| GeneID | 8538年 |
| 象征 | BARX2 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | BARX同源框2 |
| 参考 | MIM: 604823|HGNC: HGNC: 956|运用:ENSG00000043039|HPRD: 16074|织女:OTTHUMG00000165776 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 11 q25 |
| 帕斯卡假定值 | 0.062 |
| 胎儿β | -0.041 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg00577182 | 11 | 129245558 | BARX2 | 5.14 e-5 | -0.224 | 0.022 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs10894158 | chr11 | 129736156 | BARX2 | 8538年 | 0.16 | 独联体 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RTN3 | 0.90 | 0.87 |
| FBXO34 | 0.90 | 0.87 |
| MAPK9 | 0.90 | 0.90 |
| TRIM37 | 0.90 | 0.84 |
| IQWD1 | 0.90 | 0.89 |
| NDRG3 | 0.89 | 0.90 |
| DDHD2 | 0.89 | 0.86 |
| SNAP91 | 0.89 | 0.89 |
| PIK3CB | 0.89 | 0.85 |
| STXBP1 | 0.89 | 0.88 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.55 | -0.34 |
| AF347015.18 | -0.55 | -0.41 |
| AP002478.3 | -0.54 | -0.50 |
| ACSF2 | -0.52 | -0.49 |
| AC098691.2 | -0.52 | -0.44 |
| RAB13 | -0.52 | -0.64 |
| AF347015.2 | -0.51 | -0.31 |
| RAB34 | -0.51 | -0.55 |
| MT-CO2 | -0.51 | -0.34 |
| AF347015.26 | -0.51 | -0.31 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| MULLIGHAN MLL签名1 DN | 242年 | 165年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN MLL签名2 DN | 281年 | 186年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH PRC2目标 | 652年 | 441年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 桑塞姆APC DN的目标 | 366年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| THEILGAARD中性粒细胞在皮肤伤口DN | 225年 | 163年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 黄成人组织干细胞模块 | 721年 | 492年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 福斯特KDM1A目标了 | 266年 | 142年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LIM乳腺干细胞DN | 428年 | 246年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |