基因页面:NKD1
总结吗?
GeneID | 85407年 |
象征 | NKD1 |
同义词 | Naked1 |
描述 | 裸体角质层同族体1(果蝇) |
参考 | MIM: 607851|HGNC: HGNC: 17045|运用:ENSG00000140807|HPRD: 08482|织女:OTTHUMG00000133169 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 16 q12.1 |
帕斯卡假定值 | 0.006 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.01775 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NKD1_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005509 | 钙离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 15687260|16567647 | |
去:0004462 | lactoylglutathione裂合酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0016055 | Wnt受体信号通路 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005886 | 等离子体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG WNT信号通路 | 151年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WNT信号 | 89年 | 71年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
圣WNTβ连环蛋白通路 | 34 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID PS1通路 | 46 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萨瓦特结直肠腺瘤了 | 141年 | 75年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
崔TCF21目标2 | 428年 | 266年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
桑塞姆需要MYC WNT通路 | 58 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
蒋介石肝癌CTNNB1子类 | 176年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
蒋介石肝癌子类干扰素DN | 52 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 | 435年 | 318年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应通过TP53集团 | 898年 | 516年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
赞美上帝FOXO3 DN的目标 | 187年 | 109年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
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UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
let-7/98 | 427年 | 433年 | m8 | hsa-let-7a大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU |
hsa-let-7b大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU | ||||
hsa-let-7c大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUU | ||||
hsa-let-7d大脑 | AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU | ||||
hsa-let-7e大脑 | UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU | ||||
hsa-let-7f大脑 | UGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUU | ||||
hsa - mir - 98大脑 | UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU | ||||
hsa-let-7g深圳 | UGAGGUAGUAGUUUGUACAGU | ||||
hsa-let-7i大脑 | UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGU | ||||
miR-15/16/195/424/497 | 423年 | 429年 | 1 | hsa-miR-15a大脑 | UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG |
hsa-miR-16大脑 | UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG | ||||
hsa-miR-15b大脑 | UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA | ||||
hsa - mir - 195深圳 | UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC | ||||
hsa - mir - 424 | CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA | ||||
hsa - mir - 497 | CAGCAGCACACUGUGGUUUGU | ||||
mir - 365 | 58 | 64年 | 1 | hsa - mir - 365 | UAAUGCCCCUAAAAAUCCUUAU |
mir - 503 | 423年 | 429年 | 1 | hsa - mir - 503 | UAGCAGCGGGAACAGUUCUGCAG |