基因页面:ZIC5
总结吗?
GeneID | 85416年 |
象征 | ZIC5 |
同义词 | - - - - - - |
描述 | 也是家庭成员5 |
参考 | HGNC: HGNC: 20322|运用:ENSG00000139800|HPRD: 15737|织女:OTTHUMG00000017280 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 13 q32.3 |
帕斯卡假定值 | 0.584 |
胎儿β | 0.014 |
DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg10679688 | 13 | 100624965 | ZIC5 | 2.43 e-5 | 0.681 | 0.017 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZIC5_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003677 | DNA结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0030900 | 前脑发展 | 国际能源机构 | 大脑(术语层面:8) | - - - - - - |
去:0001843 | 神经管闭合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0030154 | 细胞分化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
乔治MIR192和MIR215的目标 | 893年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
瑞士POSTRADIATION肿瘤逃避DN | 373年 | 196年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
菲格罗亚AML甲基化集群3 | 170年 | 97年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
德拉克洛瓦RAR绑定西文 | 462年 | 273年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RAO受SALL4 | 227年 | 149年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
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UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
miR-103/107 | 549年 | 555年 | 1 | hsa - mir - 103大脑 | AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUGA |
hsa - mir - 107大脑 | AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUCA | ||||
mir - 128 | 762年 | 768年 | 1 | hsa - mir - 128 a | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU |
hsa - mir - 128 b | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC | ||||
hsa - mir - 128 a | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU | ||||
hsa - mir - 128 b | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC | ||||
miR-130/301 | 2146年 | 2153年 | 1、m8 | hsa - mir - 130 a大脑 | CAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAU |
hsa - mir - 301 | CAGUGCAAUAGUAUUGUCAAAGC | ||||
hsa - mir - 130 b大脑 | CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU | ||||
hsa - mir - 454 - 3 - p | UAGUGCAAUAUUGCUUAUAGGGUUU | ||||
mir - 181 | 1289年 | 1295年 | m8 | hsa - mir - 181 a大脑 | AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU |
hsa - mir - 181 b深圳 | AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG | ||||
hsa - mir - 181 c大脑 | AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU | ||||
hsa - mir - 181 d大脑 | AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU | ||||
mir - 186 | 2153年 | 2160年 | 1、m8 | hsa - mir - 186 | CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU |
miR-19 | 2145年 | 2151年 | m8 | hsa-miR-19a | UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA |
hsa-miR-19b | UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA | ||||
mir - 218 | 1635年 | 1641年 | m8 | hsa - mir - 218大脑 | UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU |
miR-23 | 1762年 | 1769年 | 1、m8 | hsa-miR-23a大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC |
hsa-miR-23b大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUACC | ||||
miR-26 | 1957年 | 1963年 | 1 | hsa-miR-26a大脑 | UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC |
hsa-miR-26b深圳 | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||
hsa-miR-26a大脑 | UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC | ||||
hsa-miR-26b深圳 | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||
miR-27 | 762年 | 768年 | m8 | hsa-miR-27a大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC |
hsa-miR-27b大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC | ||||
hsa-miR-27a大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC | ||||
hsa-miR-27b大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC | ||||
miR-29 | 1859年 | 1865年 | m8 | hsa-miR-29a深圳 | UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU |
hsa-miR-29b深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU | ||||
hsa-miR-29c深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCGGU | ||||
miR-31 | 102年 | 108年 | 1 | hsa-miR-31 | AGGCAAGAUGCUGGCAUAGCUG |
mir - 323 | 1761年 | 1768年 | 1、m8 | hsa - mir - 323大脑 | GCACAUUACACGGUCGACCUCU |
miR-34/449 | 320年 | 326年 | m8 | hsa-miR-34a大脑 | UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU |
hsa-miR-34c | AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC | ||||
hsa - mir - 449 | UGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGU | ||||
hsa - mir - 449 b | AGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGC | ||||
mir - 369 - 3 - p | 1653年 | 1659年 | 1 | hsa - mir - 369 - 3 - p | AAUAAUACAUGGUUGAUCUUU |
mir - 374 | 1653年 | 1659年 | m8 | hsa - mir - 374 | UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG |
mir - 377 | 1293年 | 1299年 | m8 | hsa - mir - 377 | AUCACACAAAGGCAACUUUUGU |
mir - 382 | 2126年 | 2132年 | m8 | hsa - mir - 382大脑 | GAAGUUGUUCGUGGUGGAUUCG |
mir - 485 - 3 - p | 2041年 | 2047年 | 1 | hsa - mir - 485 - 3 - p | GUCAUACACGGCUCUCCUCUCU |
hsa - mir - 485 - 3 - p | GUCAUACACGGCUCUCCUCUCU | ||||
mir - 486 | 680年 | 686年 | 1 | hsa - mir - 486 | UCCUGUACUGAGCUGCCCCGAG |
miR-9 | 1641年 | 1648年 | 1、m8 | hsa-miR-9深圳 | UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA |