基因页:DOCK7
Summary?
GeneID | 85440 |
象征 | DOCK7 |
同义词 | EIEE23 | ZIR2 |
描述 | 细胞因子7 |
参考 | MIM:615730|HGNC:HGNC:19190|ENSEMBL:ENSG00000116641|HPRD:16833|Vega:Otthumg0000000013131 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p31.3 |
Pascal P值 | 0.564 |
Sherlock P值 | 0.485 |
胎儿β | 1.574 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.02692 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:5 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG06595852 | 1 | 63154465 | DOCK7 | 1.123E-4 | 0.309 | 0.029 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS9875435 | CHR3 | 28720220 | DOCK7 | 85440 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DOCK7_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005085 | 鸟苷核苷酸交换因子活性 | IEA | - | |
去:0005525 | GTP结合 | IEA | - | |
去:0051020 | GTPase结合 | IEA | - | |
GO:0048365 | RAC GTPase结合 | 艾达 | 16982419 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007409 | 轴突发生 | 小鬼 | 神经元,轴突,神经突(GO期限:12) | 16982419 |
去:0031175 | 神经突发育 | 小鬼 | 神经元,轴突,神经突,树突(GO期限:10) | 16982419 |
去:0007399 | 神经系统的发展 | IEA | 神经突(GO期限:5) | - |
GO:0000226 | 微管细胞骨架组织 | 小鬼 | 16982419 | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
去:0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
GO:0033138 | 肽基丝氨酸磷酸化的阳性调节 | 小鬼 | 16982419 | |
GO:0032863 | RAC GTPase活性的激活 | 艾达 | 16982419 | |
GO:0045200 | 建立神经细胞极性 | 小鬼 | 16982419 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0030426 | 生长锥 | 塔斯 | Axon,Dendrite(GO期限:5) | 16982419 |
GO:0030424 | 轴突 | 塔斯 | 神经元,轴突,神经递质(GO期限:6) | 16982419 |
GO:0045178 | 细胞的基部 | 塔斯 | 16982419 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID ERBB2 ERBB3途径 | 44 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌 | 294 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jaatinen造血干细胞向上 | 316 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAL PRMT5靶向 | 203 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hedenfalk乳腺癌BRCA1与BRCA2 | 163 | 113 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bredemeyer抹布发信号不是通过ATM提高 | 62 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bredemeyer抹布通过ATM而不是通过NFKB向上发出信号 | 49 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-181 | 388 | 394 | M8 | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
mir-23 | 385 | 391 | 1a | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
mir-30-5p | 392 | 399 | 1A,M8 | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
HSA-MIR-30C脑 | UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC | ||||
HSA-MIR-30DSZ | UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG | ||||
HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
mir-543 | 389 | 395 | M8 | HSA-MIR-543 | aaacauucgcggugcacuucu |