Summary
GeneID 85440
象征 DOCK7
同义词 EIEE23 | ZIR2
描述 细胞因子7
参考 MIM:615730|HGNC:HGNC:19190|ENSEMBL:ENSG00000116641|HPRD:16833|Vega:Otthumg0000000013131
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p31.3
Pascal P值 0.564
Sherlock P值 0.485
胎儿β 1.574
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.02692
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:5

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG06595852 1 63154465 DOCK7 1.123E-4 0.309 0.029 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS9875435 CHR3 28720220 DOCK7 85440 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005085 鸟苷核苷酸交换因子活性 IEA -
去:0005525 GTP结合 IEA -
去:0051020 GTPase结合 IEA -
GO:0048365 RAC GTPase结合 艾达 16982419
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007409 轴突发生 小鬼 神经元,轴突,神经突(GO期限:12) 16982419
去:0031175 神经突发育 小鬼 神经元,轴突,神经突,树突(GO期限:10) 16982419
去:0007399 神经系统的发展 IEA 神经突(GO期限:5) -
GO:0000226 微管细胞骨架组织 小鬼 16982419
去:0007275 多细胞生物发育 IEA -
去:0030154 细胞分化 IEA -
GO:0033138 肽基丝氨酸磷酸化的阳性调节 小鬼 16982419
GO:0032863 RAC GTPase活性的激活 艾达 16982419
GO:0045200 建立神经细胞极性 小鬼 16982419
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0030426 生长锥 塔斯 Axon,Dendrite(GO期限:5) 16982419
GO:0030424 轴突 塔斯 神经元,轴突,神经递质(GO期限:6) 16982419
GO:0045178 细胞的基部 塔斯 16982419

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID ERBB2 ERBB3途径 44 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌 294 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaatinen造血干细胞向上 316 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAL PRMT5靶向 203 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hedenfalk乳腺癌BRCA1与BRCA2 163 113 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 469 239 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bredemeyer抹布发信号不是通过ATM提高 62 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bredemeyer抹布通过ATM而不是通过NFKB向上发出信号 49 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-181 388 394 M8 HSA-MIR-181A aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D aacauucauuguugucggggguggguu
mir-23 385 391 1a HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
mir-30-5p 392 399 1A,M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
HSA-MIR-30DSZ UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-543 389 395 M8 HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu