基因页:dixDC1
概括?
基因 | 85458 |
象征 | dixDC1 |
同义词 | CCD1 |
描述 | 包含1的DIX域 |
参考 | MIM:610493|HGNC:HGNC:23695|Ensembl:ENSG00000150764|HPRD:16804|Vega:Otthumg00000166912 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q23.1 |
Pascal P值 | 0.985 |
Sherlock P值 | 0.664 |
胎儿β | 1.398 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.006 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SNP_A-1916780 | 0 | dixDC1 | 85458 | 0.09 | 反式 | |||
RS6812244 | CHR4 | 140705509 | dixDC1 | 85458 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003779 | 肌动蛋白结合 | IEA | - | |
去:0004871 | 信号传感器活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016055 | Wnt受体信号通路 | IEA | - | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
GO:0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
wnt信令 | 89 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
sotiriou乳腺癌1级vs 3 DN | 52 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ginestier乳腺癌20q13扩增 | 119 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时 | 176 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen lvad支持失败的心 | 103 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VART KSHV感染血管生成标记DN | 138 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McMurray TP53 HRAS合作响应DN | 67 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi缺氧 | 140 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert核心少突胶质细胞分化 | 40 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1目标10小时DN | 244 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-124.1 | 276 | 282 | 1a | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
mir-141/200a | 239 | 245 | M8 | HSA-MIR-141 | uaacacugucugugugugugaugg |
HSA-MIR-200A | uaacacugucuguguguguaaacgaugu | ||||
mir-15/16/195/424/497 | 321 | 327 | 1a | HSA-MIR-15A脑 | uagcagcacauaugguugug |
HSA-MIR-16脑 | uagcagcacguaaauauuggcg | ||||
HSA-MIR-15B脑 | uagcagcacaucaugguuaca | ||||
HSA-MIR-195SZ | uagcagaaaaauauuggc | ||||
HSA-MIR-424 | Cagcagcaauucauguuuugaa | ||||
HSA-MIR-497 | cagcagcacacuguguuugu | ||||
mir-182 | 106 | 112 | 1a | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
mir-34/449 | 1277 | 1284 | 1A,M8 | HSA-MIR-34A脑 | uggcaguguuaguguguuuu |
HSA-MIR-34C | Aggcaguguaguagcugauugc | ||||
HSA-MIR-449 | uggcaguguauuguagcuggu | ||||
HSA-MIR-449B | Aggcaguguauuguuagcuggc | ||||
mir-378 | 56 | 62 | 1a | HSA-MIR-378 | cuccugacuccaggucugugu |
mir-452 | 475 | 481 | M8 | HSA-MIR-452 | UguuugcaggaaacugagaC |
HSA-MIR-452 | UguuugcaggaaacugagaC | ||||
mir-503 | 321 | 327 | 1a | HSA-MIR-503 | uagcagcgggaacaguucugcag |
mir-9 | 504 | 511 | 1A,M8 | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |
mir-96 | 105 | 112 | 1A,M8 | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |