基因页：AP3B1
概括？
| 基因 | 8546 |
| 象征 | AP3B1 |
| 同义词 | adtb3 | adtb3a | hps | hps2 | pe |
| 描述 | 适配器相关的蛋白质复合物3β1亚基 |
| 参考 | MIM：603401|HGNC：HGNC：566|ENSEMBL：ENSG00000132842|HPRD：04551|Vega：Otthumg00000106919 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5Q14.1 |
| Pascal P值 | 0.001 |
| Sherlock P值 | 0.252 |
| 胎儿β | -0.645 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG25601631 | 5 | 77590568 | AP3B1 | 3.5e-8 | -0.006 | 1.03E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PDLIM5 | 0.88 | 0.87 |
| S1PR1 | 0.87 | 0.86 |
| SLC15A2 | 0.87 | 0.87 |
| timp3 | 0.87 | 0.87 |
| PSAT1 | 0.86 | 0.91 |
| suclg2 | 0.86 | 0.88 |
| BMPR1B | 0.86 | 0.85 |
| RFX4 | 0.85 | 0.91 |
| EDNRB | 0.85 | 0.80 |
| LRIG1 | 0.85 | 0.90 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| mpped1 | -0.40 | -0.39 |
| FAM49A | -0.39 | -0.35 |
| Nell2 | -0.39 | -0.38 |
| myt1l | -0.38 | -0.32 |
| Med19 | -0.37 | -0.44 |
| AC011491.1 | -0.37 | -0.42 |
| TBC1D30 | -0.37 | -0.31 |
| SATB2 | -0.37 | -0.37 |
| klhl1 | -0.36 | -0.34 |
| Dact1 | -0.36 | -0.31 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Kegg溶酶体 | 121 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome膜贩运 | 129 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Trans Golgi网络囊泡芽 | 60 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Golgi相关囊泡生物发生 | 53 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过CD40 DN的Hollmann凋亡 | 267 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Borczuk恶性间皮瘤 | 305 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nouzova维甲酸和H4乙酰化 | 143 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁内斯对trabectedin的反应 | 50 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 外邦紫外线低剂量DN | 67 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Karlsson TGFB1靶向DN | 207 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |