基因页：tanc1
概括？
| 基因 | 85461 |
| 象征 | tanc1 |
| 同义词 | rolsb | tanc |
| 描述 | 四肽重复，arnkyrin重复和包含1 |
| 参考 | MIM：611397|HGNC：HGNC：29364|ENSEMBL：ENSG00000115183|HPRD：18146|Vega：Otthumg00000153945 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2q24.2 |
| Pascal P值 | 0.703 |
| Sherlock P值 | 0.429 |
| 胎儿β | -1.127 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | COMPOSITESET 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.02395 | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| tanc1 | CHR2 | 160074125 | G | 一个 | NM_001145909 NM_033394 |
p.1113r> h p.1121r> h |
错过 错过 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG04852339 | 2 | 159841571 | tanc1 | 1.668E-4 | -0.396 | 0.033 | DMG：Wockner_2014 |
| CG06961147 | 2 | 159824263 | tanc1 | 5.074E-4 | -0.478 | 0.047 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7000604 | CHR8 | 74746197 | tanc1 | 85461 | 0.1 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005488 | 捆绑 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触，神经递质（GO期限：5） | - |
| GO：0045202 | 突触 | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 动作 | PS1TP5BP1 | Actin，Beta | - | HPRD | 15673434 |
| CAMK2A | CAMKA |KIAA0968 | 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶IIα | - | HPRD | 15673434 |
| 桶 | CAGH39 |CMG |FLJ22219 |FLJ31914 |lin2 |Micpch |TNRC8 | 钙/钙调蛋白依赖性丝氨酸蛋白激酶（Maguk家族） | - | HPRD | 15673434 |
| DLG1 | DKFZP761P0818 |DKFZP781B0426 |dlgh1 |SAP97 |DJ1061C18.1.1 |HDLG | 圆盘，大型同源物1（果蝇） | - | HPRD | 15673434 |
| DLG4 | FLJ97752 |FLJ98574 |PSD95 |SAP90 | 圆盘，大型同源物4（果蝇） | - | HPRD | 15673434 |
| DLGAP1 | DAP-1 |DAP-1-Alpha |DAP-1-beta |gkap |MGC88156 |SAPAP1 |HGKAP | 圆盘，大（果蝇）同源物相关蛋白1 | - | HPRD | 15673434 |
| gria1 | gluh1 |glur1 |Glura |HBGR1 |MGC133252 | 谷氨酸受体，离子型，AMPA 1 | - | HPRD | 15673434 |
| grin2b | MGC142178 |MGC142180 |NMDAR2B |NR2B |HNR3 | 谷氨酸受体，离子型，N-甲基D-天冬氨酸2B | - | HPRD | 15673434 |
| Homer1 | 荷马|homer1a |homer1b |homer1c |SYN47 |VES-1 | 荷马同源物1（果蝇） | - | HPRD | 15673434 |
| 在一个 | FLJ18662 |FLJ57501 |MGC12702 |nef5 |NF-66 |TXBP-1 | 纳克斯蛋白间神经元中间丝蛋白，α | - | HPRD | 15673434 |
| Shank1 | SPANK-1 |SStrip |西南 | SH3和多个Ankyrin重复域1 | - | HPRD | 15673434 |
| SPTAN1 | （alpha）ii-spectrin |FLJ44613 |Neas | 光谱，α，非肉毒细胞1（阿尔法 - - - - - - - --------） | - | HPRD | 15673434 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 | 205 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| THUM收缩心力衰竭DN | 244 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vmyb vs cmyb的刘目标 | 20 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jaatinen造血干细胞向上 | 316 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sheth肝癌与TXNIP损失PAM2 | 153 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发12小时 | 116 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gavin Foxp3目标集群P4 | 100 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boylan多发性骨髓瘤C DN | 59 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wierenga Stat5A靶向 | 217 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wierenga Stat5a Targets Group2 | 60 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kasler HDAC7目标1 DN | 17 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-101 | 1608 | 1614年 | 1a | HSA-MIR-101 | uacaguacugauaacugaag |
| mir-142-5p | 1122 | 1128 | M8 | HSA-MIR-142-5P | cauaaaguagaaagcacuac |
| mir-144 | 1608 | 1614年 | 1a | HSA-MIR-144 | uacaguauagauguauguaguag |
| mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D | 1120 | 1127 | 1A，M8 | HSA-MIR-17-5P | caaagugcuuacugcagguagu |
| HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
| HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
| HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
| HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
| HSA-MIR-519D | caaagugccucccuuuagugugu | ||||
| mir-23 | 1316 | 1322 | 1a | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
| HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
| mir-29 | 1152 | 1158 | 1a | HSA-MIR-29ASZ | uagcaccaucugaaaucgguu |
| HSA-MIR-29BSZ | uagcaccauuugaaaucaguguu | ||||
| HSA-MIR-29CSZ | uagcaccauuugaaaucggu | ||||
| mir-338 | 1060 | 1066 | M8 | HSA-MIR-338脑 | uccagauuuuuguuga |
| mir-543 | 1366 | 1372 | M8 | HSA-MIR-543 | aaacauucgcggugcacuucu |