概括
基因 8549
象征 lgr5
同义词 fex | gpr49 | gpr67 | grp49 | hg38
描述 富含亮氨酸的重复含有G蛋白偶联受体5
参考 MIM:606667|HGNC:HGNC:4504|ENSEMBL:ENSG00000139292|HPRD:05979|Vega:Otthumg00000169543
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12Q21.1
Pascal P值 0.468
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.578

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG18527133 12 71834707 lgr5 9.04e-5 -0.5 0.027 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MTMR7 0.89 0.90
Spock1 0.89 0.89
Rab6a 0.88 0.90
SV2A 0.88 0.90
inpp5f 0.87 0.87
ENO2 0.86 0.87
Elovl4 0.86 0.87
SRPK2 0.86 0.90
Trim37 0.86 0.89
是的 0.86 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
higd1b -0.61 -0.62
AF347015.2 -0.60 -0.57
ACSF2 -0.60 -0.63
FXYD1 -0.59 -0.58
AF347015.31 -0.59 -0.59
MT-CO2 -0.58 -0.59
AF347015.21 -0.58 -0.57
AP002478.3 -0.58 -0.63
Rab34 -0.58 -0.67
EIF4EBP3 -0.57 -0.63

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0016500 蛋白质激素受体活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007186 G蛋白偶联受体蛋白信号通路 IEA -
去:0007186 G蛋白偶联受体蛋白信号通路 塔斯 9642114
去:0007165 信号转导 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 IEA -
去:0005887 质膜的积分 塔斯 9642114

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Rodrigues DCC目标DN 121 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaeger转移DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee神经Crest干细胞DN 118 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
sabates结直肠腺瘤 141 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lucas HNF4A靶向DN 8 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Begum目标 60 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wood EBV EBNA1靶向 110 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼头颈癌 100 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌12q13 Q21 Amplicon 46 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1靶向DN 234 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1外源目标 85 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom Wnt途径需要MYC 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C 47 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 UP 176 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类干扰素DN 52 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshioka肝癌早期复发DN 65 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤 207 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向 387 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组D的UVC响应 280 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delpuech FOXO3靶向 68 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38部分的phong TNF响应 160 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 308 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因