基因页:MAPKAPK5
概括?
基因 | 8550 |
象征 | MAPKAPK5 |
同义词 | mapkap-k5 | mk-5 | mk5 | prak |
描述 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激活的蛋白激酶5 |
参考 | MIM:606723|HGNC:HGNC:6889|HPRD:09467| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12Q24.13 |
Pascal P值 | 0.223 |
Sherlock P值 | 0.254 |
胎儿β | 0.364 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG22778180 | 12 | 112280887 | MAPKAPK5 | 2.45e-8 | -0.008 | 7.94E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS4491879 | CHR3 | 189373908 | MAPKAPK5 | 8550 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MAPKAPK5_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 来源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ATF2 | CRE-BP1 |creb2 |HB16 |MGC111558 |Treb7 | 激活转录因子2 | - | HPRD | 9628874 |
EIF4E | CBP |EIF4E1 |EIF4EL1 |EIF4F |MGC111573 | 真核翻译起始因子4E | - | HPRD | 9628874 |
EIF4EBP1 | 4e-bp1 |4EBP1 |BP-1 |MGC4316 |phas-i | 真核翻译起始因子4E结合蛋白1 | - | HPRD | 9628874 |
HSPB1 | CMT2F |DKFZP586P1322 |HMN2B |HS.76067 |HSP27 |HSP28 |HSP25 |SRP27 | 热休克27KDA蛋白1 | - | HPRD,Biogrid | 9628874 |
HSPB2 | HSP27 |HS.78846 |loh11cr1k |MGC133245 |MKBP | 热冲击27KDA蛋白2 | 生化活动 | Biogrid | 9628874 |
六月 | AP-1 |AP1 |C-Jun | Jun Oncogene | - | HPRD | 9628874 |
MAPK1 | ERK |ERK2 |ERT1 |MAPK2 |p42mapk |prkm1 |prkm2 |p38 |P40 |P41 | p41mapk | 有丝分裂原激活的蛋白激酶1 | - | HPRD | 9628874 |
MAPK12 | ERK3 |ERK6 |p38gamma |PRKM12 |SAPK-3 |SAPK3 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶12 | - | HPRD | 9628874 |
MAPK13 | MGC99536 |PRKM13 |SAPK4 |p38delta | 有丝分裂原激活的蛋白激酶13 | - | HPRD | 9628874 |
MAPK9 | JNK-55 |jnk2 |jnk2a |jnk2alpha |JNK2B |jnk2beta |prkm9 |SAPK |p54a |P54ASAPK | 有丝分裂原激活的蛋白激酶9 | - | HPRD | 9628874 |
MBP | MGC99675 | 髓磷脂碱性蛋白质 | - | HPRD | 9628874 |
myh11 | AAT4 |DKFZP686D10126 |DKFZP686D19237 |FAA4 |FLJ35232 |MGC126726 |MGC32963 |SMHC |SMMHC | 肌球蛋白,重链11,平滑肌 | - | HPRD | 9628874 |
PLA2G4A | MGC126350 |pla2g4 |cpla2-alpha | 磷脂酶A2,IVA组(胞质,钙依赖性) | PRAK1磷酸化CPLA2。 | 绑定 | 10978317 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg mapk信号通路 | 267 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta MAPK途径 | 87 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta P38MAPK途径 | 40 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SIG CD40Pathwaymap | 34 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ST P38 MAPK途径 | 37 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID p38 alpha beta下游途径 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bidus转移 | 214 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯对trabectedin dn的反应 | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
营地结肠癌复制号码 | 92 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染30分钟DN | 150 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |