概括
基因 8550
象征 MAPKAPK5
同义词 mapkap-k5 | mk-5 | mk5 | prak
描述 有丝分裂原激活的蛋白激酶激活的蛋白激酶5
参考 MIM:606723|HGNC:HGNC:6889|HPRD:09467|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12Q24.13
Pascal P值 0.223
Sherlock P值 0.254
胎儿β 0.364
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG22778180 12 112280887 MAPKAPK5 2.45e-8 -0.008 7.94E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4491879 CHR3 189373908 MAPKAPK5 8550 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 来源 PubMed ID
ATF2 CRE-BP1 |creb2 |HB16 |MGC111558 |Treb7 激活转录因子2 - HPRD 9628874
EIF4E CBP |EIF4E1 |EIF4EL1 |EIF4F |MGC111573 真核翻译起始因子4E - HPRD 9628874
EIF4EBP1 4e-bp1 |4EBP1 |BP-1 |MGC4316 |phas-i 真核翻译起始因子4E结合蛋白1 - HPRD 9628874
HSPB1 CMT2F |DKFZP586P1322 |HMN2B |HS.76067 |HSP27 |HSP28 |HSP25 |SRP27 热休克27KDA蛋白1 - HPRD,Biogrid 9628874
HSPB2 HSP27 |HS.78846 |loh11cr1k |MGC133245 |MKBP 热冲击27KDA蛋白2 生化活动 Biogrid 9628874
六月 AP-1 |AP1 |C-Jun Jun Oncogene - HPRD 9628874
MAPK1 ERK |ERK2 |ERT1 |MAPK2 |p42mapk |prkm1 |prkm2 |p38 |P40 |P41 | p41mapk 有丝分裂原激活的蛋白激酶1 - HPRD 9628874
MAPK12 ERK3 |ERK6 |p38gamma |PRKM12 |SAPK-3 |SAPK3 有丝分裂原激活的蛋白激酶12 - HPRD 9628874
MAPK13 MGC99536 |PRKM13 |SAPK4 |p38delta 有丝分裂原激活的蛋白激酶13 - HPRD 9628874
MAPK9 JNK-55 |jnk2 |jnk2a |jnk2alpha |JNK2B |jnk2beta |prkm9 |SAPK |p54a |P54ASAPK 有丝分裂原激活的蛋白激酶9 - HPRD 9628874
MBP MGC99675 髓磷脂碱性蛋白质 - HPRD 9628874
myh11 AAT4 |DKFZP686D10126 |DKFZP686D19237 |FAA4 |FLJ35232 |MGC126726 |MGC32963 |SMHC |SMMHC 肌球蛋白,重链11,平滑肌 - HPRD 9628874
PLA2G4A MGC126350 |pla2g4 |cpla2-alpha 磷脂酶A2,IVA组(胞质,钙依赖性) PRAK1磷酸化CPLA2。 绑定 10978317


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg mapk信号通路 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta MAPK途径 87 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta P38MAPK途径 40 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG CD40Pathwaymap 34 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST P38 MAPK途径 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID p38 alpha beta下游途径 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bidus转移 214 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin dn的反应 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
营地结肠癌复制号码 92 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染30分钟DN 150 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因