基因页:TCAP
概括?
基因 | 8557 |
象征 | TCAP |
同义词 | CMD1N | CMH25 | LGMD2G | T-CAP | Tele | Telethonin |
描述 | 滴定帽 |
参考 | MIM:604488|HGNC:HGNC:11610|HPRD:05133| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q12 |
Pascal P值 | 0.004 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.0033 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10026915 | CHR4 | 57857770 | TCAP | 8557 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TCAP_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PHLDB2 | 0.47 | 0.47 |
ABCA9 | 0.44 | 0.46 |
APC | 0.42 | 0.35 |
十一月 | 0.42 | 0.34 |
LAMC3 | 0.41 | 0.38 |
SLC6A20 | 0.40 | 0.38 |
PCDH20 | 0.40 | 0.34 |
GLT8D2 | 0.40 | 0.29 |
RUCK | 0.40 | 0.37 |
APOB | 0.39 | 0.35 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SSR4 | -0.25 | -0.26 |
RPS21 | -0.24 | -0.28 |
polr2j | -0.24 | -0.26 |
MRPL53 | -0.24 | -0.25 |
RPL23A | -0.24 | -0.22 |
LSM2 | -0.23 | -0.24 |
nudt8 | -0.23 | -0.25 |
AP003068.3 | -0.23 | -0.24 |
C22orf32 | -0.23 | -0.23 |
uxt | -0.23 | -0.25 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 10984498|11842093 | |
去:0008307 | 肌肉的结构成分 | 塔斯 | 9350988 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006461 | 蛋白质复合物组件 | 塔斯 | 9817758 | |
去:0006950 | 对压力的反应 | 塔斯 | 17921333 | |
GO:0050982 | 机械刺激的检测 | 塔斯 | 17921333 | |
GO:0045214 | 肌节组织 | 塔斯 | 17921333 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0030018 | Z光盘 | 艾达 | 17921333 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
反应组横纹的肌肉收缩 | 27 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组肌肉收缩 | 48 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
悍马皮肤癌进度DN | 100 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
nguyen Notch1靶向 | 29 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 | 225 | 163 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen lvad支持失败的心 | 103 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlingemann皮肤致癌TPA DN | 29 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |