概括
基因 8557
象征 TCAP
同义词 CMD1N | CMH25 | LGMD2G | T-CAP | Tele | Telethonin
描述 滴定帽
参考 MIM:604488|HGNC:HGNC:11610|HPRD:05133|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q12
Pascal P值 0.004
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0033

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10026915 CHR4 57857770 TCAP 8557 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PHLDB2 0.47 0.47
ABCA9 0.44 0.46
APC 0.42 0.35
十一月 0.42 0.34
LAMC3 0.41 0.38
SLC6A20 0.40 0.38
PCDH20 0.40 0.34
GLT8D2 0.40 0.29
RUCK 0.40 0.37
APOB 0.39 0.35
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SSR4 -0.25 -0.26
RPS21 -0.24 -0.28
polr2j -0.24 -0.26
MRPL53 -0.24 -0.25
RPL23A -0.24 -0.22
LSM2 -0.23 -0.24
nudt8 -0.23 -0.25
AP003068.3 -0.23 -0.24
C22orf32 -0.23 -0.23
uxt -0.23 -0.25

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 10984498|11842093
去:0008307 肌肉的结构成分 塔斯 9350988
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006461 蛋白质复合物组件 塔斯 9817758
去:0006950 对压力的反应 塔斯 17921333
GO:0050982 机械刺激的检测 塔斯 17921333
GO:0045214 肌节组织 塔斯 17921333
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0030018 Z光盘 艾达 17921333

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
反应组横纹的肌肉收缩 27 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组肌肉收缩 48 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马皮肤癌进度DN 100 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
nguyen Notch1靶向 29 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen lvad支持失败的心 103 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlingemann皮肤致癌TPA DN 29 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因