概括
基因 8565
象征 YARS
同义词 cmtdic | tyrrs | yrs | yts
描述 酪酶tRNA合成酶
参考 MIM:603623|HGNC:HGNC:12840|ENSEMBL:ENSG00000134684|HPRD:09153|Vega:Otthumg00000003933
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p35.1
Pascal P值 0.033
Sherlock P值 0.143
TADA P值 0.011
胎儿β -1.139
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
YARS CHR1 33276261 一种 G NM_003680 p.104m> t 错过 精神分裂症 DNM:Fromer_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CUL2 0.93 0.91
dync1li1 0.92 0.91
RNF8 0.91 0.89
加尔斯 0.91 0.91
带子 0.90 0.87
PSMD1 0.90 0.89
immt 0.90 0.88
DNM1L 0.89 0.86
Rab11a 0.89 0.88
DDX1 0.89 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.79 -0.74
AF347015.2 -0.79 -0.75
AF347015.8 -0.79 -0.74
AF347015.31 -0.78 -0.74
mt-cyb -0.77 -0.73
AF347015.33 -0.77 -0.72
AF347015.15 -0.76 -0.73
AF347015.27 -0.76 -0.73
AF347015.21 -0.75 -0.70
AF347015.26 -0.75 -0.71

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg氨基酰基tRNA生物合成 41 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组胞质tRNA氨基酰化 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome tRNA氨基酰化 42 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 158 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mayburd对L663536的回应 29 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林格伦膀胱癌群集3 329 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶向血清抑制 159 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO缺氧DN 289 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN 163 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tseng irs1靶向 113 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bacolod抗烷基化剂DN 60 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C7的反应 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Takeer吉西他滨抗性DN 122 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chauhan对甲氧雌二醇的反应 51 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN 238 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李最近的胸腺移民 227 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨髓瘤与成熟B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
活化B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 81 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因