基因页:YARS
概括?
基因 | 8565 |
象征 | YARS |
同义词 | cmtdic | tyrrs | yrs | yts |
描述 | 酪酶tRNA合成酶 |
参考 | MIM:603623|HGNC:HGNC:12840|ENSEMBL:ENSG00000134684|HPRD:09153|Vega:Otthumg00000003933 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p35.1 |
Pascal P值 | 0.033 |
Sherlock P值 | 0.143 |
TADA P值 | 0.011 |
胎儿β | -1.139 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
YARS | CHR1 | 33276261 | 一种 | G | NM_003680 | p.104m> t | 错过 | 精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/YARS_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CUL2 | 0.93 | 0.91 |
dync1li1 | 0.92 | 0.91 |
RNF8 | 0.91 | 0.89 |
加尔斯 | 0.91 | 0.91 |
带子 | 0.90 | 0.87 |
PSMD1 | 0.90 | 0.89 |
immt | 0.90 | 0.88 |
DNM1L | 0.89 | 0.86 |
Rab11a | 0.89 | 0.88 |
DDX1 | 0.89 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.79 | -0.74 |
AF347015.2 | -0.79 | -0.75 |
AF347015.8 | -0.79 | -0.74 |
AF347015.31 | -0.78 | -0.74 |
mt-cyb | -0.77 | -0.73 |
AF347015.33 | -0.77 | -0.72 |
AF347015.15 | -0.76 | -0.73 |
AF347015.27 | -0.76 | -0.73 |
AF347015.21 | -0.75 | -0.70 |
AF347015.26 | -0.75 | -0.71 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg氨基酰基tRNA生物合成 | 41 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组胞质tRNA氨基酰化 | 24 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome tRNA氨基酰化 | 42 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 | 158 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mayburd对L663536的回应 | 29 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林格伦膀胱癌群集3 | 329 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser MYC靶向血清抑制 | 159 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MANALO缺氧DN | 289 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast DN | 309 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN | 163 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tseng irs1靶向 | 113 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bacolod抗烷基化剂DN | 60 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C7的反应 | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Takeer吉西他滨抗性DN | 122 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chauhan对甲氧雌二醇的反应 | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN | 238 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李最近的胸腺移民 | 227 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
骨髓瘤与成熟B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 | 101 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
活化B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 | 81 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |