Summary
基因 858
象征 CAV2
同义词 CAV
Description caveolin 2
Reference MIM:601048|HGNC:HGNC:1528|Ensembl:ENSG00000105971|HPRD:03029|Vega:Otthumg00000023414
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7q31.1
Pascal P值 0.565
Sherlock p-value 0.674
胎儿β -0.673

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 Description 信息
CV:GWASdb Genome-wide Association Studies 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
Literature High-throughput literature-search Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias 点击显示详细信息
网络 Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network Contribution to shortest path in PPI network: 1.0199

Section I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SRGAP2 0.87 0.96
FAM123B 0.86 0.95
EIF2C4 0.86 0.91
ZNF445 0.85 0.94
ZCCHC14 0.85 0.95
asxl1 0.85 0.94
ST8SIA2 0.85 0.90
USP42 0.85 0.95
GPR161 0.84 0.90
ralgps1 0.84 0.94
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AIFM3 -0.64 -0.81
HLA-F -0.63 -0.79
aldoc -0.63 -0.75
C5orf53 -0.63 -0.78
HEPN1 -0.63 -0.78
TSC22D4 -0.63 -0.83
克鲁 -0.62 -0.73
serpinb6 -0.62 -0.78
S100B -0.62 -0.88
HSD17B14 -0.62 -0.83

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 10212252
GO:0042803 蛋白质同构化活性 艾达 8552590
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016050 vesicle organization 艾达 12743374
GO:0006906 囊泡融合 艾达 12743374
GO:0048278 囊泡对接 艾达 12743374
Cellular component 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0000139 高尔基membrane IEA -
去:0005794 高尔基体 IEA -
去:0005901 小屋 nas 8552590
去:0005886 质膜 艾达 15788404
去:0005887 integral to plasma membrane 艾达 8552590
GO:0048471 细胞质的核周区 艾达 8552590
去:0030133 运输囊泡 艾达 11256614

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
kegg焦点粘附 201 138 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID Syndecan 2途径 33 27 All SZGR 2.0 genes in this pathway
中村肿瘤区周围与中央 285 181 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 205 140 All SZGR 2.0 genes in this pathway
刘前列腺癌DN 481 290 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ONKEN UVEAL MELANOMA DN 526 357 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DAVICIONI TARGETS OF PAX FOXO1 FUSIONS UP 255 177 All SZGR 2.0 genes in this pathway
turashvili乳房导管癌与导管正常DN 198 110 All SZGR 2.0 genes in this pathway
乳腺癌腔与基础DN 455 304 All SZGR 2.0 genes in this pathway
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王攀登目标 269 146 All SZGR 2.0 genes in this pathway
vecchi胃癌先进与早期 175 120 All SZGR 2.0 genes in this pathway
UDayakumar Med1靶向 135 82 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KINSEY TARGETS OF EWSR1 FLII FUSION UP 1278 748 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌变性DN 537 339 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Vanharanta子宫肌瘤,带7Q缺失DN 36 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781 1082 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KAN RESPONSE TO ARSENIC TRIOXIDE 123 80 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Olsson E2F3靶向DN 49 33 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Midorikawa在肝癌中扩增 55 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gruetzmann胰腺癌 358 245 All SZGR 2.0 genes in this pathway
WATTEL AUTONOMOUS THYROID ADENOMA DN 55 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM2 153 102 All SZGR 2.0 genes in this pathway
通过ELK3 UP总缺氧 209 139 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ingram SHH靶向DN 64 41 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LOCKWOOD AMPLIFIED IN LUNG CANCER 214 139 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Suz12目标 1038 678 All SZGR 2.0 genes in this pathway
brocke凋亡由IL6逆转 144 98 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张EWSR1 FLI1融合的目标 88 68 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 182 119 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Cromer转移DN 81 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REN ALVEOLAR RHABDOMYOSARCOMA DN 408 274 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang Smarce1靶向DN 371 218 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CUI TCF21目标2 DN 830 547 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chiba对TSA的反应 52 33 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kuninger IGF1 vs PDGFB目标DN 46 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
大脑衰老 262 186 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ZHANG ANTIVIRAL RESPONSE TO RIBAVIRIN DN 51 32 All SZGR 2.0 genes in this pathway
JIANG HYPOXIA CANCER 83 52 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stein Esrra靶向DN 105 63 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马丁内斯RB1靶向 673 430 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez TP53靶向 602 364 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 All SZGR 2.0 genes in this pathway
华莱士前列腺癌DN 6 6 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Iwanaga癌变由Kras Pten DN 353 226 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张乳腺癌祖细胞 425 253 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Labbe TGFB1靶向DN 108 64 All SZGR 2.0 genes in this pathway
黄达沙替尼的抵抗 81 53 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ruiz TNC靶向DN 142 79 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ZHAN LATE DIFFERENTIATION GENES UP 33 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yagi AML带8 21易位 368 247 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stein Esrra目标 535 325 All SZGR 2.0 genes in this pathway
钱德兰转移DN 306 191 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chicas RB1目标汇合 567 365 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smad1和Smad5抑制Pangas肿瘤 134 85 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 All SZGR 2.0 genes in this pathway
pasini suz12靶向DN 315 215 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bakker FOXO3靶向DN 187 109 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Winzen通过KHSRP退化 100 70 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ERBB2同工型的Pedersen转移7 403 240 All SZGR 2.0 genes in this pathway
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-29 966 973 1A,M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu