基因页:actl6a
概括?
基因 | 86 |
象征 | actl6a |
同义词 | actl6 | arpn-beta | arp4 | baf53a | ino80k |
描述 | 肌动蛋白像6a一样 |
参考 | MIM:604958|HGNC:HGNC:24124|ENSEMBL:ENSG00000136518|HPRD:05389|Vega:Otthumg00000157782 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3Q26.33 |
Pascal P值 | 0.376 |
胎儿β | 2.259 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG01568846 | 3 | 179281462 | actl6a | 4.44e-8 | -0.008 | 1.22E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ACTL6A_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
Arhgdia | GDIA1 |MGC117248 |Rhogdi |Rhogdi-1 | RHO GDP解离抑制剂(GDI)alpha | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
baz1b | WBSCR10 |WBSCR9 |WSTF | 与锌指域相邻的溴结构域,1B | - | HPRD,Biogrid | 12837248 |
C20ORF20 | EAF7 |FLJ10914 |MRG15BP |MRGBP |URCC4 | 染色体20开放阅读框20 | - | HPRD | 12963728 |
EP400 | CAGH32 |DKFZP434I225 |FLJ42018 |FLJ45115 |P400 |TNRC12 | E1a结合蛋白P400 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 11509179 |
ewsr1 | ews | 尤因肉瘤断裂点区域1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
ING1 | p24ing1c |p33 |p33ing1 |p33ing1b |P47 |P47ing1a | 成长家族抑制剂,成员1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 11784859 |
kat2a | GCN5 |GCN5L2 |MGC102791 |PCAF-B |HGCN5 | K(赖氨酸)乙酰转移酶2A | 共同分级 | Biogrid | 11839798 |
Kat5 | esa1 |htatip |htatip1 |plip |提示|TIP60 |CPLA2 | K(赖氨酸)乙酰转移酶5 | 共同分级 | Biogrid | 11839798 |
我的C | Bhlhe39 |c-myc | V-myc骨髓质体病毒性癌基因同源物(禽类) | - | HPRD,Biogrid | 11839798 |
polr2a | MGC75453 |polr2 |波拉|RPB1 |RPBH1 |RPO2 |rpol2 |rpiils |HRPB220 |HSRPB1 | 聚合酶(RNA)II(定向DNA)多肽A,220KDA | - | HPRD | 9710619 |
relb | i-Rel |艾尔 | V-REL网状内皮病病毒性癌基因同源物B | - | HPRD,Biogrid | 14743216 |
ruvbl1 | ECP54 |ino80h |NMP238 |Pontin |Pontin52 |RVB1 |tih1 |TIP49 |TIP49A | ruvb样1(大肠杆菌) | - | HPRD,Biogrid | 11839798 |
Smarca2 | BAF190 |BRM |FLJ36757 |MGC74511 |SNF2 |snf2l2 |snf2la |swi2 |sth1p |hbrm | hSNF2a | SWI/SNF相关,矩阵相关,染色质的肌动蛋白依赖性调节剂,亚家族A,成员2 | - | HPRD,Biogrid | 12437990 |
Smarca4 | BAF190 |BRG1 |FLJ39786 |SNF2 |snf2-beta |snf2l4 |SNF2LB |swi2 |HSNF2B | SWI/SNF相关,矩阵相关,染色质的肌动蛋白依赖性调节剂,亚家族A,成员4 | - | HPRD,Biogrid | 9845365 |
Smarcb1 | BAF47 |ini1 |RDT |SNF5 |SNF5L1 |SFH1P |snr1 |HSNFS | SWI/SNF相关,矩阵相关,染色质的肌动蛋白依赖性调节剂,亚家族B,成员1 | 共纯化 | Biogrid | 8895581 |
Smarce1 | BAF57 | SWI/SNF相关,矩阵相关,染色质的肌动蛋白依赖性调节剂,亚家族E,成员1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9845365 |
trrap | FLJ10671 |PAF350/400 |PAF400 |Staf40 |tr-ap |Tra1 | 转化/转录结构域相关蛋白 | - | HPRD,Biogrid | 11839798 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID MYC活动途径 | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID MYC PATHWAY | 25 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Borczuk恶性间皮瘤 | 305 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Slebos头和颈癌与HPV | 84 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮增强 | 293 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌基础与仙女 | 330 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser MYC靶向血清抑制 | 159 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TACI DN的Moreaux多发性骨髓瘤 | 172 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
大脑衰老 | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom Wnt途径需要MYC | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性2D | 69 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer生存DN | 175 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Core血清反应 | 212 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G3 UP | 188 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应11 | 103 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 | 374 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |