概括
基因 86
象征 actl6a
同义词 actl6 | arpn-beta | arp4 | baf53a | ino80k
描述 肌动蛋白像6a一样
参考 MIM:604958|HGNC:HGNC:24124|ENSEMBL:ENSG00000136518|HPRD:05389|Vega:Otthumg00000157782
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3Q26.33
Pascal P值 0.376
胎儿β 2.259
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG01568846 3 179281462 actl6a 4.44e-8 -0.008 1.22E-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
Arhgdia GDIA1 |MGC117248 |Rhogdi |Rhogdi-1 RHO GDP解离抑制剂(GDI)alpha 两个杂交 Biogrid 16169070
baz1b WBSCR10 |WBSCR9 |WSTF 与锌指域相邻的溴结构域,1B - HPRD,Biogrid 12837248
C20ORF20 EAF7 |FLJ10914 |MRG15BP |MRGBP |URCC4 染色体20开放阅读框20 - HPRD 12963728
EP400 CAGH32 |DKFZP434I225 |FLJ42018 |FLJ45115 |P400 |TNRC12 E1a结合蛋白P400 亲和力捕获ms Biogrid 11509179
ewsr1 ews 尤因肉瘤断裂点区域1 两个杂交 Biogrid 16189514
ING1 p24ing1c |p33 |p33ing1 |p33ing1b |P47 |P47ing1a 成长家族抑制剂,成员1 亲和力捕获ms Biogrid 11784859
kat2a GCN5 |GCN5L2 |MGC102791 |PCAF-B |HGCN5 K(赖氨酸)乙酰转移酶2A 共同分级 Biogrid 11839798
Kat5 esa1 |htatip |htatip1 |plip |提示|TIP60 |CPLA2 K(赖氨酸)乙酰转移酶5 共同分级 Biogrid 11839798
我的C Bhlhe39 |c-myc V-myc骨髓质体病毒性癌基因同源物(禽类) - HPRD,Biogrid 11839798
polr2a MGC75453 |polr2 |波拉|RPB1 |RPBH1 |RPO2 |rpol2 |rpiils |HRPB220 |HSRPB1 聚合酶(RNA)II(定向DNA)多肽A,220KDA - HPRD 9710619
relb i-Rel |艾尔 V-REL网状内皮病病毒性癌基因同源物B - HPRD,Biogrid 14743216
ruvbl1 ECP54 |ino80h |NMP238 |Pontin |Pontin52 |RVB1 |tih1 |TIP49 |TIP49A ruvb样1(大肠杆菌) - HPRD,Biogrid 11839798
Smarca2 BAF190 |BRM |FLJ36757 |MGC74511 |SNF2 |snf2l2 |snf2la |swi2 |sth1p |hbrm | hSNF2a SWI/SNF相关,矩阵相关,染色质的肌动蛋白依赖性调节剂,亚家族A,成员2 - HPRD,Biogrid 12437990
Smarca4 BAF190 |BRG1 |FLJ39786 |SNF2 |snf2-beta |snf2l4 |SNF2LB |swi2 |HSNF2B SWI/SNF相关,矩阵相关,染色质的肌动蛋白依赖性调节剂,亚家族A,成员4 - HPRD,Biogrid 9845365
Smarcb1 BAF47 |ini1 |RDT |SNF5 |SNF5L1 |SFH1P |snr1 |HSNFS SWI/SNF相关,矩阵相关,染色质的肌动蛋白依赖性调节剂,亚家族B,成员1 共纯化 Biogrid 8895581
Smarce1 BAF57 SWI/SNF相关,矩阵相关,染色质的肌动蛋白依赖性调节剂,亚家族E,成员1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 9845365
trrap FLJ10671 |PAF350/400 |PAF400 |Staf40 |tr-ap |Tra1 转化/转录结构域相关蛋白 - HPRD,Biogrid 11839798


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID MYC活动途径 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MYC PATHWAY 25 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤 305 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Slebos头和颈癌与HPV 84 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮增强 293 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶向血清抑制 159 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TACI DN的Moreaux多发性骨髓瘤 172 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
大脑衰老 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom Wnt途径需要MYC 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性2D 69 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer生存DN 175 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Core血清反应 212 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G3 UP 188 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应11 103 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因