概括
基因 8603
象征 Fam193a
同义词 C4ORF8 | RES4-22
描述 序列相似性的家庭193成员a
参考 HGNC:HGNC:16822|ENSEMBL:ENSG00000125386|HPRD:09850|Vega:Otthumg00000160512
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4P16.3
Pascal P值 0.776
Sherlock P值 0.012
胎儿β 0.65
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG25978313 4 2733839 Fam193a 9.72E-6 0.753 0.013 DMG:Wockner_2014
CG07462954 4 2733734 Fam193a 1.037E-4 0.467 0.028 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1431938 CHR4 187752910 Fam193a 8603 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIAA1109 0.92 0.93
kif21a 0.92 0.93
DNAJC13 0.91 0.92
LARP1 0.91 0.92
PMS2 0.90 0.90
myh10 0.90 0.91
cdc42bpa 0.90 0.91
VPS53 0.89 0.88
mycbp2 0.89 0.92
夹子1 0.88 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.71 -0.67
AF347015.31 -0.70 -0.65
higd1b -0.70 -0.67
C1orf54 -0.68 -0.73
MT-CO2 -0.68 -0.64
FXYD1 -0.68 -0.61
增强 -0.68 -0.71
VAMP5 -0.68 -0.68
Metrn -0.66 -0.66
ifi27 -0.65 -0.60

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 XPCS DN 88 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD DN 84 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由组蛋白乙酰化DN调节的玛丽亚达森 54 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUILLETTE CLL 13Q14删除 74 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hsiao家政基因 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因