基因页:Fam193a
概括?
基因 | 8603 |
象征 | Fam193a |
同义词 | C4ORF8 | RES4-22 |
描述 | 序列相似性的家庭193成员a |
参考 | HGNC:HGNC:16822|ENSEMBL:ENSG00000125386|HPRD:09850|Vega:Otthumg00000160512 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4P16.3 |
Pascal P值 | 0.776 |
Sherlock P值 | 0.012 |
胎儿β | 0.65 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG25978313 | 4 | 2733839 | Fam193a | 9.72E-6 | 0.753 | 0.013 | DMG:Wockner_2014 |
CG07462954 | 4 | 2733734 | Fam193a | 1.037E-4 | 0.467 | 0.028 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1431938 | CHR4 | 187752910 | Fam193a | 8603 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KIAA1109 | 0.92 | 0.93 |
kif21a | 0.92 | 0.93 |
DNAJC13 | 0.91 | 0.92 |
LARP1 | 0.91 | 0.92 |
PMS2 | 0.90 | 0.90 |
myh10 | 0.90 | 0.91 |
cdc42bpa | 0.90 | 0.91 |
VPS53 | 0.89 | 0.88 |
mycbp2 | 0.89 | 0.92 |
夹子1 | 0.88 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.71 | -0.67 |
AF347015.31 | -0.70 | -0.65 |
higd1b | -0.70 | -0.67 |
C1orf54 | -0.68 | -0.73 |
MT-CO2 | -0.68 | -0.64 |
FXYD1 | -0.68 | -0.61 |
增强 | -0.68 | -0.71 |
VAMP5 | -0.68 | -0.68 |
Metrn | -0.66 | -0.66 |
ifi27 | -0.65 | -0.60 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 XPCS DN | 88 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD DN | 84 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由组蛋白乙酰化DN调节的玛丽亚达森 | 54 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OUILLETTE CLL 13Q14删除 | 74 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |