基因页：SLC25A12

概括？
基因 8604
象征 SLC25A12
同义词 AGC1 | Aralar
描述 Solute Carrier家族25成员12
参考 MIM：603667|HGNC：HGNC：10982|ENSEMBL：ENSG00000115840|HPRD：04719|Vega：Otthumg00000134290
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2Q24
Pascal P值 9.778e-5
Sherlock P值 0.251
胎儿β -0.717
DMG 1（＃研究）
主持人 小脑半球
小脑
额叶皮质BA9
元
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
G2CDB.HUMAN_MITOCHONDRIA
G2CDB.HUMANNRC
COMPOSITESET
潜在的突触基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 1
DNM：Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：4

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
SLC25A12 CHR2 172666145 G 一个 NM_003705
NR_047549		 p.426l> f
。		 错过
npcrna		 精神分裂症 DNM：Fromer_2014

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG20104535 2 172750996 SLC25A12 1.07E-8 -0.009 4.57E-6 DMG：JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
LST1 0.79 0.79
GMFG 0.78 0.78
Pycard 0.73 0.68
IFI27L2 0.72 0.63
trem2 0.72 0.65
VAMP5 0.71 0.72
CD63 0.71 0.69
暴利 0.69 0.69
MGST2 0.69 0.71
Ly96 0.69 0.73
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SPTAN1 -0.51 -0.62
myo18a -0.51 -0.56
SUPT6H -0.51 -0.56
PTPN23 -0.51 -0.60
HNRNPUL2 -0.50 -0.51
TCOF1 -0.50 -0.60
tnks1bp1 -0.50 -0.57
SMG6 -0.50 -0.57
USP20 -0.50 -0.57
KDM5C -0.50 -0.61

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0015183 L-天冬氨酸跨膜转运蛋白活性 艾达 谷氨酸（GO期限：9） 11566871
去：0005313 L-谷氨酸跨膜转运蛋白活性 艾达 谷氨酸（GO期限：9） 11566871
去：0005488 捆绑 IEA -
去：0005509 钙离子结合 艾达 9722566
去：0005215 转运蛋白活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0015813 L-谷氨酸运输 艾达 谷氨酸（GO期限：9） 11566871
GO：0015810 天冬氨酸运输 艾达 谷氨酸（GO期限：9） 11566871
去：0006810 运输 IEA -
GO：0043490 苹果酸天冬氨酸班车 艾达 11566871
GO：0051592 对钙离子的反应 艾达 11566871
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005739 线粒体 艾达 9722566|11566871
去：0005743 线粒体内膜 IEA -
去：0016020 膜 IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 nas 9722566

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
反应组线粒体蛋白进口 58 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组糖异生 34 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
碳水化合物的反应组代谢 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组葡萄糖代谢 69 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 XPCS DN 88 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时 176 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2目标 424 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mahajan对IL1A DN的反应 76 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild E2F3致癌特征 246 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉（Stein Esrra）瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽玛辐射2G后的生存率不佳 171 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K9ME3 DN的Acevedo肝癌 120 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染30分钟DN 150 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时DN 254 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应中间 98 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg KDM3A靶向缺氧 208 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-320 194 200 1a HSA-MIR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa