基因页:PLA2G4C
概括?
基因 | 8605 |
象征 | PLA2G4C |
同义词 | CPLA2-gamma |
描述 | 磷脂酶A2组IVC |
参考 | MIM:603602|HGNC:HGNC:9037|Ensembl:ENSG00000105499|HPRD:04673|Vega:Otthumg00000183185 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.3 |
Pascal P值 | 0.63 |
Sherlock P值 | 0.581 |
胎儿β | -1.842 |
主持人 | 小脑半球 小脑 额叶皮质BA9 元 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
tsnax | 0.86 | 0.88 |
arl6 | 0.83 | 0.85 |
cdc37l1 | 0.82 | 0.85 |
PPP3R1 | 0.82 | 0.84 |
UBLCP1 | 0.82 | 0.85 |
DNAJB9 | 0.81 | 0.83 |
trappc6b | 0.80 | 0.80 |
lyrm7 | 0.80 | 0.80 |
brms1l | 0.80 | 0.84 |
Rab6a | 0.80 | 0.82 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AL022328.1 | -0.44 | -0.51 |
EIF4EBP3 | -0.44 | -0.49 |
TMEM88 | -0.44 | -0.51 |
EGFL8 | -0.43 | -0.47 |
USHBP1 | -0.43 | -0.45 |
micall2 | -0.43 | -0.45 |
ptprcap | -0.43 | -0.45 |
AF347015.18 | -0.42 | -0.32 |
EFEMP2 | -0.41 | -0.47 |
NDUFA4L2 | -0.41 | -0.42 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005543 | 磷脂结合 | nas | 10085124 | |
GO:0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
GO:0047499 | 非钙依赖性磷脂酶A2活性 | 艾达 | 10085124 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016042 | 脂质分解代谢过程 | IEA | - | |
去:0007242 | 细胞内信号传导级联 | nas | 10085124 | |
去:0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
去:0007567 | 分娩 | nas | 10085124 | |
去:0006954 | 炎症反应 | nas | 10085124 | |
GO:0019369 | 花生四烯酸代谢过程 | nas | 10085124 | |
GO:0046475 | 甘油磷脂分解代谢过程 | 艾达 | 10085124 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | 塔斯 | 10085124 | |
去:0016020 | 膜 | 塔斯 | 10085124 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PI的反应组酰基链重塑 | 15 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PC的Reactome酰基链重塑 | 22 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组磷脂代谢 | 198 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PE的反应组酰基链重塑 | 21 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组甘油磷脂生物合成 | 82 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 | 205 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JAIN NFKB信号 | 75 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海勒被甲基化沉默 | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk精子 | 114 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dasu IL6信号向上 | 59 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2同工型的Pedersen转移7 | 403 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg KDM3A靶向缺氧 | 208 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |