概括
基因 8605
象征 PLA2G4C
同义词 CPLA2-gamma
描述 磷脂酶A2组IVC
参考 MIM:603602|HGNC:HGNC:9037|Ensembl:ENSG00000105499|HPRD:04673|Vega:Otthumg00000183185
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.3
Pascal P值 0.63
Sherlock P值 0.581
胎儿β -1.842
主持人 小脑半球
小脑
额叶皮质BA9

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 1 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
tsnax 0.86 0.88
arl6 0.83 0.85
cdc37l1 0.82 0.85
PPP3R1 0.82 0.84
UBLCP1 0.82 0.85
DNAJB9 0.81 0.83
trappc6b 0.80 0.80
lyrm7 0.80 0.80
brms1l 0.80 0.84
Rab6a 0.80 0.82
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AL022328.1 -0.44 -0.51
EIF4EBP3 -0.44 -0.49
TMEM88 -0.44 -0.51
EGFL8 -0.43 -0.47
USHBP1 -0.43 -0.45
micall2 -0.43 -0.45
ptprcap -0.43 -0.45
AF347015.18 -0.42 -0.32
EFEMP2 -0.41 -0.47
NDUFA4L2 -0.41 -0.42

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005543 磷脂结合 nas 10085124
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
GO:0047499 非钙依赖性磷脂酶A2活性 艾达 10085124
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016042 脂质分解代谢过程 IEA -
去:0007242 细胞内信号传导级联 nas 10085124
去:0008152 代谢过程 IEA -
去:0007567 分娩 nas 10085124
去:0006954 炎症反应 nas 10085124
GO:0019369 花生四烯酸代谢过程 nas 10085124
GO:0046475 甘油磷脂分解代谢过程 艾达 10085124
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 塔斯 10085124
去:0016020 塔斯 10085124

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PI的反应组酰基链重塑 15 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PC的Reactome酰基链重塑 22 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组磷脂代谢 198 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PE的反应组酰基链重塑 21 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组甘油磷脂生物合成 82 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 205 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAIN NFKB信号 75 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
海勒被甲基化沉默 282 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk精子 114 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤课程DN 210 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dasu IL6信号向上 59 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工型的Pedersen转移7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg KDM3A靶向缺氧 208 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因