基因页：ruvbl1
Summary？
| 基因 | 8607 |
| 象征 | ruvbl1 |
| Synonyms | ECP-54 | ECP54 | INO80H | NMP 238 | NMP238 | PONTIN | PONTIN52 | RVB1 | TIH1 | TIP49 | TIP49A |
| Description | ruvb像AAA ATPASE 1 |
| Reference | MIM：603449|HGNC：HGNC：10474|Ensembl：ENSG00000175792|HPRD：09143|Vega：Otthumg00000159658 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| Map location | 3Q21 |
| Pascal p-value | 0.003 |
| Sherlock p-value | 0.914 |
| 主持人 | Myers' cis & trans |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | Method of gene set | Description | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组协会研究 | GWAS |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6812324 | CHR4 | 157991591 | ruvbl1 | 8607 | 0.06 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| Gene | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| LEF1 | 0.54 | 0.31 |
| ano2 | 0.53 | 0.26 |
| OTX2 | 0.52 | 0.16 |
| KLK10 | 0.52 | 0.20 |
| TRH | 0.50 | 0.01 |
| anxa3 | 0.50 | 0.28 |
| epha1 | 0.49 | 0.15 |
| GPR177 | 0.49 | 0.25 |
| podnl1 | 0.49 | 0.23 |
| PDE5A | 0.48 | 0.23 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| Gene | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| gnrhr | -0.26 | -0.31 |
| LMO7 | -0.26 | -0.22 |
| Elmod1 | -0.25 | -0.19 |
| DNAJC2 | -0.24 | -0.24 |
| Nova1 | -0.24 | -0.23 |
| AC022692.2 | -0.23 | -0.20 |
| ARHGAP20 | -0.23 | -0.17 |
| UPF2 | -0.23 | -0.17 |
| DPP4 | -0.22 | -0.23 |
| GTDC1 | -0.22 | -0.16 |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| actl6a | actl6 |arp4 |BAF53A |INO80K |MGC5382 | 类似肌动蛋白的6A | - | HPRD,BioGRID | 11839798 |
| C19orf2 | FLJ10575 |nnx3 |rmp |Uri | chromosome 19 open reading frame 2 | - | HPRD | 14615539 |
| C20ORF20 | EAF7 |FLJ10914 |MRG15BP |MRGBP |URCC4 | chromosome 20 open reading frame 20 | - | HPRD | 12963728 |
| C2orf44 | FLJ21945 |pp384 | 染色体2开放阅读框44 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
| CD82 | 4F9 | C33 | GR15 | IA4 | KAI1 | R2 | SAR2 | ST6 | TSPAN27 | CD82分子 | RUVBL1（Pontin）与CD82（KAI1）启动子相互作用。 | 绑定 | 15829968 |
| CTNNB1 | ctnnb |DKFZP686D02253 |FLJ25606 |FLJ37923 | Catenin（cadherin相关蛋白），β1，88KDA | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 9843967 |
| DNASE2 | DNASE2A | |黑暗DNL2 | 脱氧核糖核酸酶II，溶酶体 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
| E2F7 | FLJ12981 | E2F transcription factor 7 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
| EP400 | CAGH32 |DKFZP434I225 |FLJ42018 |FLJ45115 |P400 |TNRC12 | E1A binding protein p400 | Affinity Capture-MS 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 11509179 |
| FDFT1 | DGPT |ERG9 |SQS |SS | farneyl--磷酸酯Farnesyltransferase 1 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
| GNAS | Aho |C20orf45 |GNAS1 |GPSA |GSA |GSP |MGC33735 |php1a |php1b |poh | dJ309F20.1.1 | dJ806M20.3.3 | GNA复合基因座 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
| HLA-B | AS |HLA-B-7301 |HLA-B73 |hlab |HLAC |SPDA1 | 主要的组织相容性复合物，I类，B | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
| Kat5 | esa1 |htatip |htatip1 |plip |提示|TIP60 |CPLA2 | K（赖氨酸）乙酰转移酶5 | HTATIP (Tip60) interacts with RUVBL1 (pontin). | 绑定 | 15829968 |
| KIAA1377 | - | KIAA1377 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| KLK3 | APS | KLK2A1 | PSA | hK3 | Kallikrein相关肽酶3 | RUVBL1（Pontin）与KLK3（PSA）启动子相互作用。 | 绑定 | 15829968 |
| LEF1 | DKFZP586H0919 |tcf1alpha | 淋巴增强剂结合因子1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9843967 |
| MAP3K7 | TAK1 | TGF1a | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶7 | - | HPRD | 14743216 |
| MAP3K7IP2 | FLJ21885 | KIAA0733 | TAB2 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶7相互作用蛋白2 | - | HPRD | 14743216 |
| 我的C | Bhlhe39 |c-myc | V-myc骨髓质体病毒性癌基因同源物（禽类） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共纯化 重构的复合物 |
Biogrid | 11509179|11839798 |
| NOP5/NOP58 | HSPC120 | 核仁蛋白NOP5/NOP58 | - | HPRD | 12417735 |
| 佩洛 | CGI-17 |Pro1770 | Pelota同源物（果蝇） | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
| PSTPIP1 | CD2BP1 | CD2BP1L | CD2BP1S | H-PIP | PAPAS | PSTPIP | 脯氨酸 - 丝氨酸 - 硫代磷酸酶相互作用蛋白1 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
| RP11-529I10.4 | DKFZP566F084 | 在原发性睫状运动障碍的小鼠模型中删除 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
| ruvbl2 | CGI-46 |ECP51 |ino80j |reptin |RVB2 |tih2 |TIP48 |TIP49B | RuvB-like 2 (E. coli) | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
| Smarca2 | BAF190 |BRM |FLJ36757 |MGC74511 |SNF2 |snf2l2 |snf2la |swi2 |sth1p |hbrm | hSNF2a | SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 | 共同分级 | Biogrid | 11839798 |
| SMNDC1 | smnr |SPF30 | 生存运动神经元结构域包含1个 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
| STAP1 | brdg1 |Stap-1 | 信号转导适配器家族成员1 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 14615539 |
| TBP | gtf2d |GTF2D1 |MGC117320 |MGC126054 |MGC126055 |SCA17 |tfiid | 塔塔盒结合蛋白 | 重构的复合物 | Biogrid | 9843967 |
| trrap | FLJ10671 |PAF350/400 |PAF400 |Staf40 |tr-ap |Tra1 | 转化/转录结构域相关蛋白 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11839798 |