基因页：年代TC2
概括?
| 基因ID | 8614 |
| 年代ymbol | 年代TC2 |
| 同义词 | STC-2 | STCRP |
| 描述 | stanniocalcin 2 |
| 参考 | MIM:603665|HGNC:HGNC:11374|Ensembl:ENSG00000113739|HPRD：04717|Vega:OTTHUMG00000130542 |
| 基因type | protein-coding |
| 地图位置 | 5q35.1 |
| Pascal P值 | 0.544 |
| Fetal beta | -1.327 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因set name | 基因组方法 | 描述 | Info |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG:Jaffe_2016 | Genome-wide DNA methylation analysis | This dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05. | 1 |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | Psr: 0.0276 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | Chromosome | Position | Nearest gene | P (dis) | beta（dis） | FDR (dis) | 年代tudy |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg08711858 | 5 | 172756550 | 年代TC2 | 2.39E-8 | -0.009 | 7.83E-6 | DMG:Jaffe_2016 |
年代ection II. Transcriptome annotation
基因ral gene expression (GTEx)
基因expression during devlopment (BrainCloud)
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注：
年代C: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
年代T1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
Top co-expressed genes in brain regions
| Top 10 positively co-expressed genes | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 年代pearman's Correlation |
| THOC4 | 0.95 | 0.93 |
| RANBP1 | 0.93 | 0.89 |
| H2afy | 0.92 | 0.92 |
| 年代FRS7 | 0.92 | 0.89 |
| RUVBL1 | 0.92 | 0.92 |
| HNRNPM | 0.92 | 0.89 |
| C1orf77 | 0.91 | 0.93 |
| U2AF1 | 0.91 | 0.90 |
| HNRNPL | 0.91 | 0.91 |
| AC026691.1 | 0.91 | 0.91 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 年代pearman's Correlation |
| AF347015.27 | -0.73 | -0.87 |
| AF347015.33 | -0.73 | -0.87 |
| AF347015.31 | -0.73 | -0.85 |
| MT-CO2 | -0.72 | -0.85 |
| MT-CYB | -0.71 | -0.85 |
| AF347015.8 | -0.71 | -0.86 |
| AF347015.15 | -0.70 | -0.87 |
| HLA-F | -0.67 | -0.74 |
| AF347015.2 | -0.67 | -0.85 |
| AF347015.26 | -0.66 | -0.85 |
年代ection III. Gene Ontology annotation
| Molecular function | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO:0005179 | hormone activity | 塔斯 | 9723890 | |
| Biological process | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| GO:0007267 | cell-cell signaling | 塔斯 | 9753616 | |
| 去：0007166 | 细胞表面受体连接的信号转导 | 塔斯 | 9753616 | |
| GO:0007584 | response to nutrient | 塔斯 | 9753616 | |
| 细胞分量 | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| GO:0005576 | extracellular region | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ADAM11 | MDC | 亚当金属肽酶结构域11 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| AIFM1 | aif |MGC111425 |PDCD8 | apoptosis-inducing factor, mitochondrion-associated, 1 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| ARRB2 | ARB2 |arr2 |Barr2 |DKFZP686L0365 | 逮捕，beta 2 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| CARHSP1 | CRHSP-24 | CSDC1 | MGC111446 | 钙调节的热稳定蛋白1，24KDA | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| EIF2B3 | EIF-2B | EIF2Bgamma | eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 3 gamma, 58kDa | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| FLJ10357 | 年代OLO | 假设蛋白FLJ10357 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| PEBP1 | HCNP | PBP | PEBP | RKIP | 磷脂酰乙醇胺结合蛋白1 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| POLR2C | RPB3 |RPB31 |HRPB33 |HSRPB3 | polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide C, 33kDa | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| POLR3F | MGC13517 |RPC39 |RPC6 | 聚合酶（RNA）III（定向DNA）多肽F，39 kDa | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| PPP1R8 | ARD-1 | ARD1 | NIPP-1 | NIPP1 | PRO2047 | protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 8 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| PTN | HARP | HBGF8 | HBNF | NEGF1 | pleiotrophin | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
V.途径注释
| Pathway name | Pathway size | ＃szgr 2.0基因 | Info |
|---|---|---|---|
| NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 年代CHUETZ BREAST CANCER DUCTAL INVASIVE DN | 84 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| igarashi atf4靶向dn | 90 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DAVICIONI MOLECULAR ARMS VS ERMS UP | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TURASHVILI BREAST LOBULAR CARCINOMA VS DUCTAL NORMAL DN | 91 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TURASHVILI BREAST LOBULAR CARCINOMA VS LOBULAR NORMAL UP | 94 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pramoonjago sox4靶向 | 52 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DEURIG T细胞PROLYMPHOCYTIC白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DOANE BREAST CANCER ESR1 UP | 112 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HORIUCHI WTAP TARGETS UP | 306 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| VECCHI GASTRIC CANCER ADVANCED VS EARLY UP | 175 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞 | 275 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GARGALOVIC RESPONSE TO OXIDIZED PHOSPHOLIPIDS RED UP | 17 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周炎性反应lps up | 431 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 埃尔维奇缺氧 | 171 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ELVIDGE HYPOXIA BY DMOG UP | 130 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC UP | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHEBOTAEV GR TARGETS UP | 77 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MCBRYAN PUBERTAL BREAST 3 4WK UP | 214 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房4 5WK | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KAN对砷三氧化物的反应 | 123 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rashi对电离辐射5的响应5 | 147 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| AMUNDSON RESPONSE TO ARSENITE | 217 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 温曼对缺氧DN的适应 | 41 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向胎儿肝 | 227 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WANG HCP PROSTATE CANCER | 111 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUYTTEN EZH2 TARGETS UP | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KOYAMA SEMA3B TARGETS UP | 292 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BENPORATH EED TARGETS | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ONDER CDH1 TARGETS 2 UP | 256 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onder CDH1目标1向上 | 140 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ONDER CDH1 TARGETS 3 UP | 17 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ONDER CDH1 SIGNALING VIA CTNNB1 | 83 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MANALO HYPOXIA UP | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHAN MULTIPLE MYELOMA CD1 UP | 45 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHAN MULTIPLE MYELOMA CD1 VS CD2 UP | 66 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BROWN MYELOID CELL DEVELOPMENT DN | 129 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HALMOS CEBPA TARGETS DN | 46 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nguyen Notch1靶向DN | 86 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MENSE HYPOXIA UP | 98 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WANG SMARCE1 TARGETS DN | 371 | 218 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindvall通过Tert Up永生 | 78 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LEONARD HYPOXIA | 47 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JIANG HYPOXIA NORMAL | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARIADASON RESPONSE TO CURCUMIN SULINDAC 5 | 23 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KRIGE AMINO ACID DEPRIVATION | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR UP | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HOWLIN CITED1 TARGETS 2 DN | 17 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Riggins他莫昔芬抵抗DN | 220 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RIGGI EWING SARCOMA PROGENITOR DN | 191 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 年代MID BREAST CANCER RELAPSE IN LIVER DN | 10 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌腔 | 84 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BONOME OVARIAN CANCER SURVIVAL OPTIMAL DEBULKING | 246 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bernard PPAPDC1B目标DN | 58 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chen Hoxa5靶向9小时 | 223 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BLUM RESPONSE TO SALIRASIB UP | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WINTER HYPOXIA METAGENE | 242 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOYLAN MULTIPLE MYELOMA D CLUSTER UP | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RUIZ TNC TARGETS DN | 142 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHANG TLX TARGETS 60HR DN | 277 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| COLINA TARGETS OF 4EBP1 AND 4EBP2 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Poola侵入性乳腺癌DN | 134 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LOPEZ MESOTHELIOMA SURVIVAL OVERALL DN | 16 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng正常老化DN | 30 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KYNG WERNER SYNDROM DN | 29 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 6HR UP | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 24HR UP | 324 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 | 211 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MIYAGAWA TARGETS OF EWSR1 ETS FUSIONS DN | 229 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vandesluis Commd1目标2组 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kasler HDAC7目标2 DN | 32 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PEDERSEN METASTASIS BY ERBB2 ISOFORM 7 | 403 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Plasari TGFB1通过NFIC 10HR DN信号传导 | 30 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KRIEG HYPOXIA NOT VIA KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fortschegger PHF8靶向 | 279 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZWANG DOWN BY 2ND EGF PULSE | 293 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
年代ection VI. microRNA annotation
| miRNA family | 目标位置 | mirna id | miRNA seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR start | UTR end | Match method | |||
| miR-1/206 | 58 | 65 | 1A,m8 | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
| HSA-MIR-206年代Z | UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG | ||||
| HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
| mir-24 | 624 | 631 | 1A,m8 | HSA-MIR-24年代Z | UGGCUCAGUUCAGCAGGAACAG |
| miR-329 | 133 | 139 | m8 | HSA-MIR-329脑 | AACACACCUGGUUAACCUCUUU |
| mir-542-3p | 92 | 98 | 1A | HSA-MIR-542-3P | ugugacauugauaacugaaa |