概括
基因 8622
象征 PDE8B
同义词 ADSD | PPNAD3
描述 磷酸二酯酶8b
参考 MIM:603390|HGNC:HGNC:8794|ENSEMBL:ENSG00000113231|HPRD:04546|Vega:Otthumg00000102170
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5q13.3
Pascal P值 0.436
Sherlock P值 0.834
胎儿β -1.729
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS163018 CHR5 76735197 PDE8B 8622 0 顺式
RS1678772 CHR5 76738869 PDE8B 8622 0.01 顺式
RS6453314 CHR5 76807625 PDE8B 8622 0.01 顺式
RS6453315 CHR5 76807696 PDE8B 8622 0.06 顺式
RS163018 CHR5 76735197 PDE8B 8622 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg Purine代谢 159 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha的信号事件 121 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanharanta子宫肌瘤 45 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wotton Runx目标DN 29 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasaki成人T细胞白血病 176 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室 249 170 该途径中的所有SZGR 2.0基因
布朗HCMV感染48小时 180 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bhati G2M被2methoxyestradiol DN逮捕 127 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nutt GBM与AO Glioma DN 45 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 206 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tian tnf信令不通过NFKB 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP带有H3K4ME3和H3K27ME3 137 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38部分的phong TNF响应 160 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 308 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因