概括
基因 8633
象征 UNC5C
同义词 UNC5H3
描述 UNC-5 Netrin受体C
参考 MIM:603610|HGNC:HGNC:12569|ENSEMBL:ENSG00000182168|HPRD:04678|Vega:Otthumg00000130989
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4Q21-Q23
Pascal P值 0.005
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
dedd 0.96 0.95
FTSJ1 0.94 0.95
tinf2 0.94 0.93
DHP 0.94 0.94
PRR3 0.94 0.94
ddost 0.94 0.93
ARMC6 0.94 0.95
RPUSD4 0.94 0.94
C4orf14 0.93 0.92
EIF4A1 0.93 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.78 -0.90
AF347015.31 -0.78 -0.89
MT-CO2 -0.78 -0.89
AF347015.33 -0.77 -0.89
AF347015.8 -0.77 -0.91
mt-cyb -0.76 -0.90
AF347015.15 -0.74 -0.89
AF347015.26 -0.73 -0.91
C5orf53 -0.73 -0.79
AIFM3 -0.73 -0.78

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005042 Netrin受体活性 塔斯 9782087
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007420 大脑发育 塔斯 大脑(GO期限:7) 9782087
去:0007411 轴突指导 塔斯 Axon(GO期限:13) 9126742
去:0007165 信号转导 IEA -
去:0006915 凋亡 IEA -
去:0007275 多细胞生物发育 IEA -
去:0030334 细胞迁移的调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG轴突指导 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Netrin途径 32 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Netrin1信号传导 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
剑麻结肠直肠腺瘤DN 291 176 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1自分泌目标DN 142 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN 244 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1通过NFIC 10小时信号传导 54 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-125/351 595 601 1a HSA-MIR-125B ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A ucccugagacccuuaaccugug
mir-30-5p 366 373 1A,M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-324-5p 386 393 1A,M8 HSA-MIR-324-5p CGCAUCCCCUAGGGCAUUGGU
mir-339 382 389 1A,M8 HSA-MIR-339 ucccuccuccaggagcuca
mir-384 294 301 1A,M8 HSA-MIR-384 auuccuagaaauuguucaua
mir-486 274 281 1A,M8 HSA-MIR-486 uccuguacugagcugcccccgag