基因页:UNC5C
概括?
基因 | 8633 |
象征 | UNC5C |
同义词 | UNC5H3 |
描述 | UNC-5 Netrin受体C |
参考 | MIM:603610|HGNC:HGNC:12569|ENSEMBL:ENSG00000182168|HPRD:04678|Vega:Otthumg00000130989 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4Q21-Q23 |
Pascal P值 | 0.005 |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/UNC5C_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
dedd | 0.96 | 0.95 |
FTSJ1 | 0.94 | 0.95 |
tinf2 | 0.94 | 0.93 |
DHP | 0.94 | 0.94 |
PRR3 | 0.94 | 0.94 |
ddost | 0.94 | 0.93 |
ARMC6 | 0.94 | 0.95 |
RPUSD4 | 0.94 | 0.94 |
C4orf14 | 0.93 | 0.92 |
EIF4A1 | 0.93 | 0.93 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.27 | -0.78 | -0.90 |
AF347015.31 | -0.78 | -0.89 |
MT-CO2 | -0.78 | -0.89 |
AF347015.33 | -0.77 | -0.89 |
AF347015.8 | -0.77 | -0.91 |
mt-cyb | -0.76 | -0.90 |
AF347015.15 | -0.74 | -0.89 |
AF347015.26 | -0.73 | -0.91 |
C5orf53 | -0.73 | -0.79 |
AIFM3 | -0.73 | -0.78 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005042 | Netrin受体活性 | 塔斯 | 9782087 | |
去:0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007420 | 大脑发育 | 塔斯 | 大脑(GO期限:7) | 9782087 |
去:0007411 | 轴突指导 | 塔斯 | Axon(GO期限:13) | 9126742 |
去:0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
去:0006915 | 凋亡 | IEA | - | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
去:0030334 | 细胞迁移的调节 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG轴突指导 | 129 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Netrin途径 | 32 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Netrin1信号传导 | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
剑麻结肠直肠腺瘤DN | 291 | 176 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU GH1自分泌目标DN | 142 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1目标10小时DN | 244 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1通过NFIC 10小时信号传导 | 54 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-125/351 | 595 | 601 | 1a | HSA-MIR-125B脑 | ucccugagacccuaacuuguga |
HSA-MIR-125A脑 | ucccugagacccuuaaccugug | ||||
mir-30-5p | 366 | 373 | 1A,M8 | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
mir-324-5p | 386 | 393 | 1A,M8 | HSA-MIR-324-5p | CGCAUCCCCUAGGGCAUUGGU |
mir-339 | 382 | 389 | 1A,M8 | HSA-MIR-339 | ucccuccuccaggagcuca |
mir-384 | 294 | 301 | 1A,M8 | HSA-MIR-384 | auuccuagaaauuguucaua |
mir-486 | 274 | 281 | 1A,M8 | HSA-MIR-486 | uccuguacugagcugcccccgag |