基因页:DCHS1
概括?
基因 | 8642 |
象征 | DCHS1 |
同义词 | cdh19 | cdh25 | cdhr6 | fib1 | mvp2 | pcdh16 | vmlds1 |
描述 | 羧蛋白钙粘蛋白相关1 |
参考 | MIM:603057|HGNC:HGNC:13681|ENSEMBL:ENSG00000166341|HPRD:04341|Vega:Otthumg00000133398 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11P15.4 |
Pascal P值 | 0.007 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 皮质 额叶皮质BA9 海马 |
支持 | 细胞粘附和透射信号传导 Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS12288043 | 11 | 6676285 | DCHS1 | ENSG00000166341.6 | 7.67177E-7 | 0.03 | 800 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DCHS1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马纳洛缺氧 | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1突变DN的Verhaak AML | 246 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yague pryumor耐药性DN | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mueller AML融合DN的共同靶标 | 31 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoelzel NF1靶向DN | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |