基因页：PTCH2
概括？
| 基因 | 8643 |
| 象征 | PTCH2 |
| 同义词 | PTC2 |
| 描述 | 修补2 |
| 参考 | MIM：603673|HGNC：HGNC：9586|ENSEMBL：ENSG00000117425|HPRD：04722|Vega：Otthumg00000008490 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1p34.1 |
| Pascal P值 | 0.234 |
| 胎儿β | 0.009 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG04145643 | 1 | 45288012 | PTCH2 | 2.414e-4 | 0.437 | 0.037 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ABHD12B | 0.67 | 0.68 |
| coro6 | 0.65 | 0.73 |
| pthlh | 0.63 | 0.63 |
| Rab37 | 0.63 | 0.67 |
| CHRNB3 | 0.63 | 0.62 |
| STBD1 | 0.61 | 0.58 |
| EPS8L2 | 0.61 | 0.57 |
| LPCAT4 | 0.61 | 0.61 |
| ALKBH6 | 0.60 | 0.64 |
| CPNE9 | 0.60 | 0.69 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| tubb2b | -0.43 | -0.53 |
| KIAA1949 | -0.42 | -0.46 |
| YBX1 | -0.42 | -0.51 |
| PPP1R14B | -0.42 | -0.56 |
| carhsp1 | -0.41 | -0.58 |
| AC079354.7 | -0.41 | -0.52 |
| CD24 | -0.41 | -0.40 |
| ZNF501 | -0.41 | -0.49 |
| Tigd1 | -0.41 | -0.46 |
| marcksl1 | -0.41 | -0.45 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg刺猬信号通路 | 56 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG基底细胞癌 | 55 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID刺猬2 Pathway | 22 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome B类2 Secralin家族受体 | 88 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 奥多内尔转移 | 82 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mohankumar TLX1靶向DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shin B细胞淋巴瘤簇1 | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PTCH1和Sufu的Lee目标 | 53 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pedrioli mir31靶向 | 221 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang EGF间隔 | 105 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |