基因页:EIF3B
Summary?
基因ID | 8662 |
Symbol | EIF3B |
同义词 | EIF3-ETA | EIF3-P110 | EIF3-P116 | EIF3S9 | PRT1 |
描述 | eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B |
参考 | MIM:603917|HGNC:HGNC:3280|ENSEMBL:ENSG00000106263|HPRD:06795|Vega:Otthumg0000000022839 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7p22.3 |
Pascal P值 | 0.004 |
Sherlock P值 | 8.539E-4 |
胎儿β | -0.238 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Guipponi_2014 | 整个外显子组测序分析 | 通过比较53个散发性SCZ及其未受影响的父母的外显子组来识别49个DNM |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | Sift | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
EIF3B | NM_001037283 | C.2029-1G.C | 拼接 | NA | NA | Schizophrenia | DNM:Guipponi_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/EIF3B_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SLC39A3 | 0.87 | 0.86 |
FBXW5 | 0.86 | 0.84 |
CDIPT | 0.86 | 0.86 |
WDR45 | 0.85 | 0.86 |
SLC5A2 | 0.85 | 0.82 |
C11orf68 | 0.84 | 0.81 |
格里纳 | 0.83 | 0.82 |
BCKDK | 0.83 | 0.81 |
SLC41A3 | 0.83 | 0.83 |
RABGGTA | 0.82 | 0.80 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.18 | -0.56 | -0.50 |
AF347015.8 | -0.54 | -0.41 |
MT-ATP8 | -0.54 | -0.46 |
AF347015.21 | -0.54 | -0.42 |
AF347015.26 | -0.52 | -0.40 |
NSBP1 | -0.51 | -0.53 |
MT-CO2 | -0.50 | -0.37 |
AF347015.2 | -0.50 | -0.37 |
EIF5B | -0.50 | -0.57 |
AF347015.33 | -0.50 | -0.39 |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
EIF3A | EIF3 |EIF3S10 |KIAA0139 |P167 |tif32 |EIF3-P170 |eif3-theta |P180 |P185 | 真核翻译起始因子3,亚基A | P150与HPRT1相互作用。 | 绑定 | 11169732 |
EIF3A | EIF3 |EIF3S10 |KIAA0139 |P167 |tif32 |EIF3-P170 |eif3-theta |P180 |P185 | 真核翻译起始因子3,亚基A | - | HPRD,Biogrid | 8995410|9822659 |
EIF3C | EIF3S8 |FLJ78287 |MGC189744 |EIF3-P110 | 真核翻译起始因子3,亚基C | Co-purification | Biogrid | 15946946 |
EIF3I | EIF3S2 |Pro2242 |Trip-1 |Trip1 |eif3-beta |EIF3-P36 | 真核翻译引发因子3,亚基I | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 16541103 |
EIF3J | EIF3S1 |eif3-alpha |EIF3-P35 | 真核翻译起始因子3,亚基J | Co-purification | Biogrid | 15946946 |
EIF3K | ARG134 | EIF3-p28 | EIF3S12 | HSPC029 | M9 | MSTP001 | PLAC-24 | PLAC24 | PRO1474 | PTD001 | 真核翻译起始因子3,亚基k | - | HPRD | 14519125 |
EIF4A1 | ddx2a |EIF-4A |EIF4A | 真核翻译起始因子4a,同工型1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 16541103 |
EIF4B | EIF-4B |Pro1843 | 真核翻译起始因子4b | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 16286006 |
EIF4E | CBP |EIF4E1 |EIF4EL1 |EIF4F |MGC111573 | 真核翻译起始因子4E | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 16541103 |
EIF4G1 | DKFZP686A1451 |EIF4F |EIF4G |P220 | 真核翻译起始因子4伽玛,1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 16541103 |
EIF6 | 2 | CAB | EIF3A | ITGB4BP | b | b(2)gcn | gcn | p27BBP | 真核翻译引发因子6 | Co-purification | Biogrid | 15946946 |
frap1 | FLJ44809 |frap |frap2 |mtor |RAFT1 |Rapt1 | FK506结合蛋白12-宽霉素相关蛋白1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 16286006 |
IL2RB | CD122 | P70-75 | 白介素2受体,β | 体内 | Biogrid | 7693677 |
KIAA1303 | - | 猛禽 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 16286006 |
RPS6 | - | 核糖体蛋白S6 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 16286006 |
RPS6KB1 | PS6K | S6K | S6K1 | STK14A | p70(S6K)-alpha | p70-S6K | p70-alpha | 核糖体蛋白S6激酶,70KDA,多肽1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 16286006 |