Summary
基因ID 8662
Symbol EIF3B
同义词 EIF3-ETA | EIF3-P110 | EIF3-P116 | EIF3S9 | PRT1
描述 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B
参考 MIM:603917|HGNC:HGNC:3280|ENSEMBL:ENSG00000106263|HPRD:06795|Vega:Otthumg0000000022839
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p22.3
Pascal P值 0.004
Sherlock P值 8.539E-4
胎儿β -0.238
支持 Ascano FMRP目标

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Guipponi_2014 整个外显子组测序分析 通过比较53个散发性SCZ及其未受影响的父母的外显子组来识别49个DNM

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 Sift CG46 特征 学习
EIF3B NM_001037283 C.2029-1G.C 拼接 NA NA Schizophrenia DNM:Guipponi_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SLC39A3 0.87 0.86
FBXW5 0.86 0.84
CDIPT 0.86 0.86
WDR45 0.85 0.86
SLC5A2 0.85 0.82
C11orf68 0.84 0.81
格里纳 0.83 0.82
BCKDK 0.83 0.81
SLC41A3 0.83 0.83
RABGGTA 0.82 0.80
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.18 -0.56 -0.50
AF347015.8 -0.54 -0.41
MT-ATP8 -0.54 -0.46
AF347015.21 -0.54 -0.42
AF347015.26 -0.52 -0.40
NSBP1 -0.51 -0.53
MT-CO2 -0.50 -0.37
AF347015.2 -0.50 -0.37
EIF5B -0.50 -0.57
AF347015.33 -0.50 -0.39

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者 别名b 官方全名b 实验 Source PubMed ID
EIF3A EIF3 |EIF3S10 |KIAA0139 |P167 |tif32 |EIF3-P170 |eif3-theta |P180 |P185 真核翻译起始因子3,亚基A P150与HPRT1相互作用。 绑定 11169732
EIF3A EIF3 |EIF3S10 |KIAA0139 |P167 |tif32 |EIF3-P170 |eif3-theta |P180 |P185 真核翻译起始因子3,亚基A - HPRD,Biogrid 8995410|9822659
EIF3C EIF3S8 |FLJ78287 |MGC189744 |EIF3-P110 真核翻译起始因子3,亚基C Co-purification Biogrid 15946946
EIF3I EIF3S2 |Pro2242 |Trip-1 |Trip1 |eif3-beta |EIF3-P36 真核翻译引发因子3,亚基I 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 16541103
EIF3J EIF3S1 |eif3-alpha |EIF3-P35 真核翻译起始因子3,亚基J Co-purification Biogrid 15946946
EIF3K ARG134 | EIF3-p28 | EIF3S12 | HSPC029 | M9 | MSTP001 | PLAC-24 | PLAC24 | PRO1474 | PTD001 真核翻译起始因子3,亚基k - HPRD 14519125
EIF4A1 ddx2a |EIF-4A |EIF4A 真核翻译起始因子4a,同工型1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 16541103
EIF4B EIF-4B |Pro1843 真核翻译起始因子4b 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 16286006
EIF4E CBP |EIF4E1 |EIF4EL1 |EIF4F |MGC111573 真核翻译起始因子4E 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 16541103
EIF4G1 DKFZP686A1451 |EIF4F |EIF4G |P220 真核翻译起始因子4伽玛,1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 16541103
EIF6 2 | CAB | EIF3A | ITGB4BP | b | b(2)gcn | gcn | p27BBP 真核翻译引发因子6 Co-purification Biogrid 15946946
frap1 FLJ44809 |frap |frap2 |mtor |RAFT1 |Rapt1 FK506结合蛋白12-宽霉素相关蛋白1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 16286006
IL2RB CD122 | P70-75 白介素2受体,β 体内 Biogrid 7693677
KIAA1303 - 猛禽 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 16286006
RPS6 - 核糖体蛋白S6 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 16286006
RPS6KB1 PS6K | S6K | S6K1 | STK14A | p70(S6K)-alpha | p70-S6K | p70-alpha 核糖体蛋白S6激酶,70KDA,多肽1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 16286006


Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome翻译 222 75 All SZGR 2.0 genes in this pathway
三元复合物的反应组形成,随后是43S复合物 74 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME ACTIVATION OF THE MRNA UPON BINDING OF THE CAP BINDING COMPLEX AND EIFS AND SUBSEQUENT BINDING TO 43S 84 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
蛋白质的反应组代谢 518 242 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome 3 UTR介导的翻译调节 176 51 All SZGR 2.0 genes in this pathway
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 All SZGR 2.0 genes in this pathway
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 All SZGR 2.0 genes in this pathway
乳腺癌腔与基础 380 215 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VECCHI GASTRIC CANCER EARLY UP 430 232 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN 335 193 All SZGR 2.0 genes in this pathway
runx1 runx1t1融合单核细胞的TONKS目标 204 140 All SZGR 2.0 genes in this pathway
周的炎症反应fima 544 308 All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌DN 1375 806 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 All SZGR 2.0 genes in this pathway
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 All SZGR 2.0 genes in this pathway
liang造血细胞数量小vs巨大 38 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 All SZGR 2.0 genes in this pathway
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Caffarel对THC 8HR 3 DN的响应 10 7 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王前列腺癌雄激素独立 66 37 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nikolsky乳腺癌7p22 Amplicon 38 27 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Menssen MYC目标 53 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 All SZGR 2.0 genes in this pathway
彭雷帕霉素反应dn 245 154 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LEI MYB目标 318 215 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ferrando T与MLL ENR融合DN一起 87 57 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zhan多发性骨髓瘤 64 46 All SZGR 2.0 genes in this pathway
XU RESPONSE TO TRETINOIN AND NSC682994 DN 15 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病 1691 1088 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张对Cantharidin DN的反应 69 46 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zamora NOS2靶向DN 96 71 All SZGR 2.0 genes in this pathway
WELCSH BRCA1靶向DN 141 92 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 All SZGR 2.0 genes in this pathway
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gavin Foxp3目标集群T7 98 63 All SZGR 2.0 genes in this pathway
戴尔基癌俯卧反应BPA 51 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
级结肠癌 871 505 All SZGR 2.0 genes in this pathway
等级结肠和直肠癌 285 167 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王肿瘤的侵入性 374 247 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boyault肝癌子类G3 UP 188 121 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CAIRO HEPATOBLASTOMA CLASSES UP 605 377 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Karlsson TGFB1靶向 127 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 All SZGR 2.0 genes in this pathway