Summary
GeneID 8675
象征 STX16
同义词 SYN16
描述 语法16
参考 MIM:603666|HGNC:HGNC:11431|ENSEMBL:ENSG00000124222|HPRD:04718|Vega:Otthumg00000033084
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20q13.32
Pascal P值 7.855e-4
Sherlock P值 0.513
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 细胞内贩运

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 Hits with neuro-related keywords: 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS762126 CHR8 37472686 STX16 8675 0.15 反式
RS713190 CHR8 37473069 STX16 8675 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005484 SNAP受体活性 艾达 15215310
去:0005484 SNAP受体活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006886 细胞内蛋白转运 IEA -
去:0006891 高尔基体囊泡介导的转运 塔斯 9464276
GO:0016192 vesicle-mediated transport IEA -
GO:0042147 逆行运输,内体向高尔基 艾达 15215310
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0031201 军鼓复合物 塔斯 神经元,突触(GO期限:6) 15215310
去:0000139 高尔基膜 IEA -
去:0005792 微型体 塔斯 9587053
去:0005794 高尔基体 塔斯 9587053
去:0005737 细胞质 塔斯 9587053
GO:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
囊泡运输中的kegg圈圈相互作用 38 25 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME BOTULINUM NEUROTOXICITY 19 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组的蛋白水解裂解,裂解复合蛋白 17 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome神经元系统 279 221 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gary CD5目标 473 314 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Laiho结直肠癌锯齿状DN 86 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ginestier乳腺癌Znf217扩增 78 48 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ginestier乳腺癌20q13扩增 119 66 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC1靶向 457 269 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC3靶向 501 327 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sabates结直肠腺瘤的大小 23 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌DN 1375 806 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 All SZGR 2.0 genes in this pathway
环氧化物素的浓凋亡 239 157 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Darwiche皮肤肿瘤启动子 142 96 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Darwiche Papilloma风险低 162 104 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Darwiche Papilloma风险高 147 101 All SZGR 2.0 genes in this pathway
darwiche鳞状细胞癌 146 104 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD UP 64 39 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schlosser血清反应 134 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP 309 199 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana ATM PCC网络 1442 892 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Myc Max目标 775 494 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nikolsky乳腺癌20q12 Q13 Amplicon 149 76 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shipp DLBCL与卵泡淋巴瘤DN 45 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
flt3的大风apl突变 56 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kayo衰老的肌肉 244 165 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 All SZGR 2.0 genes in this pathway
级结肠癌 871 505 All SZGR 2.0 genes in this pathway
李区分T淋巴细胞 200 115 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由MYC约束 1103 714 All SZGR 2.0 genes in this pathway
figueroa aml甲基化簇4 112 64 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标3 430 288 All SZGR 2.0 genes in this pathway
STAT3的Azare肿瘤转化 121 70 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LOPEZ TRANSLATION VIA FN1 SIGNALING 35 21 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-122 1017 1023 1a HSA-MIR-122A uggagugugacaaugguuuugu
miR-128 938 944 1a hsa-miR-128a ucacagugaaccggucuuuu
hsa-miR-128b ucacagugaaccggucuuc
mir-132/212 3157 3163 1a HSA-MIR-212SZ uaacagucuccagucacgccc
HSA-MIR-132 uaacagucuacccaugggg
HSA-MIR-212SZ uaacagucuccagucacgccc
HSA-MIR-132 uaacagucuacccaugggg
miR-137 3096 3102 M8 HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-145 3163 3169 1a HSA-MIR-145 guccaguuucccaggaaucccuu
mir-193 644 650 M8 HSA-MIR-193A Aacuggccuacaaagucccag
HSA-MIR-193B aacuggcccucaaagucccgcuuu
mir-194 3158 3164 M8 HSA-MIR-194 uguaacagcaacuccauga
MiR-200BC/429 3222 3228 1a HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-203.1 1022 1028 1a HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-27 938 945 1A,M8 HSA-MIR-27A uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B uucacaguggcuaaguucugc
mir-299-5p 729 736 1A,M8 HSA-MIR-299-5P ugguuuaccgucccacauacau
miR-377 595 601 1a HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu
mir-493-5p 3176 3182 1a HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu