基因页:PEA15
概括?
基因ID | 8682 |
Symbol | PEA15 |
同义词 | HMAT1|HUMMAT1H|MAT1|MAT1H|PEA-15|PED |
描述 | 富含星形胶质细胞的磷蛋白15 |
参考 | MIM:603434|HGNC:HGNC:8822|ENSEMBL:ENSG00000162734|HPRD:04579|Vega:OTTHUMG00000031605 |
基因type | protein-coding |
地图位置 | 1q21.1 |
Sherlock P值 | 0.003 |
Fetal beta | -0.962 |
支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因set name | 基因组方法 | 描述 | Info |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | Genome-wide Association Study | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included. | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | Psr: 0.0235 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.00814 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | Click to show details |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | Contribution to shortest path in PPI network: 0.0161 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
Section II. Transcriptome annotation
基因ral gene expression (GTEx)
![Not available](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PEA15_DE_GTEx.png)
基因expression during devlopment (BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
Top co-expressed genes in brain regions
Top 10 positively co-expressed genes | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
MPP5 | 0.87 | 0.90 |
USP8 | 0.86 | 0.85 |
CCDC47 | 0.86 | 0.84 |
tor1aip1 | 0.86 | 0.87 |
STAT3 | 0.84 | 0.85 |
ACBD5 | 0.84 | 0.84 |
ERAP1 | 0.83 | 0.86 |
KIAA0776 | 0.83 | 0.83 |
弹簧1 | 0.83 | 0.84 |
SENP2 | 0.83 | 0.78 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
RPL35 | -0.41 | -0.48 |
IL32 | -0.41 | -0.29 |
AP003068.3 | -0.40 | -0.40 |
AF347015.21 | -0.39 | -0.14 |
FAM159B | -0.39 | -0.37 |
RPL36 | -0.38 | -0.46 |
RPS21 | -0.38 | -0.45 |
C1orf61 | -0.38 | -0.27 |
AL022328.1 | -0.37 | -0.29 |
APOC1 | -0.37 | -0.12 |
Section III. Gene Ontology annotation
Molecular function | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0005351 | 糖:氢分类者活性 | IEA | - | |
GO:0005515 | protein binding | 新闻学会 | 10442631 | |
Biological process | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
GO:0008643 | carbohydrate transport | IEA | - | |
去:0006916 | anti-apoptosis | IDA | 10442631 | |
GO:0042981 | regulation of apoptosis | IDA | 10442631 | |
GO:0046325 | negative regulation of glucose import | IDA | 9670003 | |
细胞分量 | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
GO:0005875 | 微管相关的复合物 | NAS | 8662970 | |
GO:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ABCD4 | ABC41 |EST352188 |P70R |P79R |PMP69 |PXMP1L | ATP结合录音带,亚家族D(ALD),成员4 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
AKT1 | AKT | MGC99656 | PKB | PKB-ALPHA | PRKBA | RAC | RAC-ALPHA | v-akt murine thymoma viral oncogene homolog 1 | AKT与PED相互作用。 | BIND | 12808093 |
CASP8 | ALPS2B | CAP4 | FLICE | FLJ17672 | MACH | MCH5 | MGC78473 | caspase 8,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | - | HPRD,Biogrid | 10442631|10493725 |
FADD | Gig3 |MGC8528 |Mort1 | FAS(TNFRSF6)通过死亡域关联 | - | HPRD,Biogrid | 10442631|10493725 |
L1CAM | CAML1 |CD171 |HSAS |HSAS1 |Masa |麦克风5 |n-caml1 |S10 |SPG1 | L1 cell adhesion molecule | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
luc7l2 | CGI-59 | CGI-74 | FLJ10657 | LUC7B2 | LUC7-like 2 (S. cerevisiae) | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
MAPK1 | ERK | ERK2 | ERT1 | MAPK2 | P42MAPK | PRKM1 | PRKM2 | p38 | p40 | p41 | p41mapk | mitogen-activated protein kinase 1 | - | HPRD,Biogrid | 11702783 |
MAPK3 | ERK1 | HS44KDAP | HUMKER1A | MGC20180 | P44ERK1 | P44MAPK | PRKM3 | mitogen-activated protein kinase 3 | - | HPRD,Biogrid | 11702783 |
MAPK3 | ERK1 | HS44KDAP | HUMKER1A | MGC20180 | P44ERK1 | P44MAPK | PRKM3 | mitogen-activated protein kinase 3 | PEA-15 interacts with ERK 1. | BIND | 11702783 |
PLD1 | - | phospholipase D1, phosphatidylcholine-specific | - | HPRD,Biogrid | 10926929 |
PLD2 | - | phospholipase D2 | - | HPRD,Biogrid | 10926929 |
RPS6KA3 | CLS | HU-3 | ISPK-1 | MAPKAPK1B | MRX19 | RSK | RSK2 | S6K-alpha3 | p90-RSK2 | pp90RSK2 | ribosomal protein S6 kinase, 90kDa, polypeptide 3 | - | HPRD,Biogrid | 12796492 |
RPS6KA3 | CLS | HU-3 | ISPK-1 | MAPKAPK1B | MRX19 | RSK | RSK2 | S6K-alpha3 | p90-RSK2 | pp90RSK2 | ribosomal protein S6 kinase, 90kDa, polypeptide 3 | PEA-15 interacts with RSK2. | BIND | 12796492 |
V.途径注释
Pathway name | Pathway size | #szgr 2.0基因 | Info |
---|---|---|---|
PID P73PATHWAY | 79 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL UP | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ONKEN UVEAL MELANOMA UP | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAZDA DIAMOND BLACKFAN ANEMIA ERYTHROID DN | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHEMNITZ RESPONSE TO PROSTAGLANDIN E2 UP | 146 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 | 255 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Huttmann B Cll生存不佳 | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DOANE RESPONSE TO ANDROGEN UP | 184 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ROY WOUND BLOOD VESSEL UP | 50 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UDAYAKUMAR MED1 TARGETS DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM WT1 TARGETS 8HR UP | 164 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM WT1 TARGETS 12HR UP | 162 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 1 DN | 378 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN | 164 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FRIDMAN SENESCENCE UP | 77 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MORI MATURE B LYMPHOCYTE UP | 90 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LE EGR2 TARGETS DN | 108 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SANA TNF SIGNALING DN | 90 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SANA RESPONSE TO IFNG DN | 85 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEE LIVER CANCER DENA UP | 60 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NADLER OBESITY UP | 61 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEI MYB TARGETS | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GERY CEBP目标 | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHANG IMMORTALIZED BY HPV31 DN | 65 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JIANG VHL TARGETS | 138 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王顺铂反应和XPC DN | 228 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SESTO RESPONSE TO UV C1 | 72 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIU SMARCA4 TARGETS | 64 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JIANG HYPOXIA NORMAL | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zamora NOS2靶向DN | 96 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标DN | 105 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARTINEZ RB1 TARGETS DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARTINEZ TP53 TARGETS UP | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS UP | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Marzec IL2发出信号 | 115 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IWANAGA CARCINOGENESIS BY KRAS PTEN DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RIZKI TUMOR INVASIVENESS 3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ACEVEDO LIVER TUMOR VS NORMAL ADJACENT TISSUE UP | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BLUM RESPONSE TO SALIRASIB UP | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RUIZ TNC TARGETS DN | 142 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S1 | 237 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CAIRO HEPATOBLASTOMA CLASSES DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DANG REGULATED BY MYC DN | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LI INDUCED T TO NATURAL KILLER UP | 307 | 182 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JOHNSTONE PARVB TARGETS 1 UP | 7 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PASINI SUZ12 TARGETS DN | 315 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TERAO AOX4 TARGETS HG UP | 28 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KRIEG HYPOXIA NOT VIA KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FORTSCHEGGER PHF8 TARGETS DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOUDOUKHA BOUND BY IGF2BP2 | 111 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Section VI. microRNA annotation
miRNA family | 目标位置 | mirna id | miRNA seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR start | UTR end | Match method | |||
miR-124.1 | 1527年 | 1534年 | 1A,m8 | hsa-miR-124a | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
hsa-miR-124a | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA | ||||
mir-124/506 | 1527年 | 1533年 | 1A | HSA-MIR-506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
hsa-miR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
HSA-MIR-506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA | ||||
hsa-miR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
miR-132/212 | 753 | 759 | m8 | HSA-MIR-212SZ | uaacagucuccagucacgccc |
hsa-miR-132脑 | uaacagucuacccaugggg | ||||
miR-329 | 1105 | 1111 | 1A | HSA-MIR-329脑 | AACACACCUGGUUAACCUCUUU |
miR-338 | 512 | 518 | 1A | HSA-MIR-338脑 | UCCAGCAUCAGUGAUUUUGUUGA |
mir-34/449 | 1146 | 1153 | 1A,m8 | HSA-MIR-34A脑 | UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU |
HSA-MIR-34C | AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC | ||||
HSA-MIR-449 | uggcaguguauuguagcuggu | ||||
HSA-MIR-449b | Aggcaguguauuguuagcuggc | ||||
miR-544 | 346 | 352 | 1A | HSA-MIR-544 | AUUCUGCAUUUUUAGCAAGU |