概括?
基因ID 8682
Symbol PEA15
同义词 HMAT1|HUMMAT1H|MAT1|MAT1H|PEA-15|PED
描述 富含星形胶质细胞的磷蛋白15
参考 MIM:603434|HGNC:HGNC:8822|ENSEMBL:ENSG00000162734|HPRD:04579|Vega:OTTHUMG00000031605
基因type protein-coding
地图位置 1q21.1
Sherlock P值 0.003
Fetal beta -0.962
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历:PGCNP Genome-wide Association Study GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 Psr: 0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) Psr: 0.00814
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 Click to show details
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 0.0161

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

Not available

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
MPP5 0.87 0.90
USP8 0.86 0.85
CCDC47 0.86 0.84
tor1aip1 0.86 0.87
STAT3 0.84 0.85
ACBD5 0.84 0.84
ERAP1 0.83 0.86
KIAA0776 0.83 0.83
弹簧1 0.83 0.84
SENP2 0.83 0.78
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
RPL35 -0.41 -0.48
IL32 -0.41 -0.29
AP003068.3 -0.40 -0.40
AF347015.21 -0.39 -0.14
FAM159B -0.39 -0.37
RPL36 -0.38 -0.46
RPS21 -0.38 -0.45
C1orf61 -0.38 -0.27
AL022328.1 -0.37 -0.29
APOC1 -0.37 -0.12

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005351 糖:氢分类者活性 IEA -
GO:0005515 protein binding 新闻学会 10442631
Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0008643 carbohydrate transport IEA -
去:0006916 anti-apoptosis IDA 10442631
GO:0042981 regulation of apoptosis IDA 10442631
GO:0046325 negative regulation of glucose import IDA 9670003
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005875 微管相关的复合物 NAS 8662970
GO:0005737 细胞质 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
ABCD4 ABC41 |EST352188 |P70R |P79R |PMP69 |PXMP1L ATP结合录音带,亚家族D(ALD),成员4 两个杂交 BioGRID 16169070
AKT1 AKT | MGC99656 | PKB | PKB-ALPHA | PRKBA | RAC | RAC-ALPHA v-akt murine thymoma viral oncogene homolog 1 AKT与PED相互作用。 BIND 12808093
CASP8 ALPS2B | CAP4 | FLICE | FLJ17672 | MACH | MCH5 | MGC78473 caspase 8,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 - HPRD,Biogrid 10442631|10493725
FADD Gig3 |MGC8528 |Mort1 FAS(TNFRSF6)通过死亡域关联 - HPRD,Biogrid 10442631|10493725
L1CAM CAML1 |CD171 |HSAS |HSAS1 |Masa |麦克风5 |n-caml1 |S10 |SPG1 L1 cell adhesion molecule 两个杂交 BioGRID 16169070
luc7l2 CGI-59 | CGI-74 | FLJ10657 | LUC7B2 LUC7-like 2 (S. cerevisiae) 两个杂交 BioGRID 16169070
MAPK1 ERK | ERK2 | ERT1 | MAPK2 | P42MAPK | PRKM1 | PRKM2 | p38 | p40 | p41 | p41mapk mitogen-activated protein kinase 1 - HPRD,Biogrid 11702783
MAPK3 ERK1 | HS44KDAP | HUMKER1A | MGC20180 | P44ERK1 | P44MAPK | PRKM3 mitogen-activated protein kinase 3 - HPRD,Biogrid 11702783
MAPK3 ERK1 | HS44KDAP | HUMKER1A | MGC20180 | P44ERK1 | P44MAPK | PRKM3 mitogen-activated protein kinase 3 PEA-15 interacts with ERK 1. BIND 11702783
PLD1 - phospholipase D1, phosphatidylcholine-specific - HPRD,Biogrid 10926929
PLD2 - phospholipase D2 - HPRD,Biogrid 10926929
RPS6KA3 CLS | HU-3 | ISPK-1 | MAPKAPK1B | MRX19 | RSK | RSK2 | S6K-alpha3 | p90-RSK2 | pp90RSK2 ribosomal protein S6 kinase, 90kDa, polypeptide 3 - HPRD,Biogrid 12796492
RPS6KA3 CLS | HU-3 | ISPK-1 | MAPKAPK1B | MRX19 | RSK | RSK2 | S6K-alpha3 | p90-RSK2 | pp90RSK2 ribosomal protein S6 kinase, 90kDa, polypeptide 3 PEA-15 interacts with RSK2. BIND 12796492


V.途径注释

Pathway name Pathway size #szgr 2.0基因 Info
PID P73PATHWAY 79 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL UP 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA UP 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA DIAMOND BLACKFAN ANEMIA ERYTHROID DN 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEMNITZ RESPONSE TO PROSTAGLANDIN E2 UP 146 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不佳 276 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DOANE RESPONSE TO ANDROGEN UP 184 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROY WOUND BLOOD VESSEL UP 50 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UDAYAKUMAR MED1 TARGETS DN 240 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS 8HR UP 164 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS 12HR UP 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 1 DN 378 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN 164 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FRIDMAN SENESCENCE UP 77 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI MATURE B LYMPHOCYTE UP 90 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2 TARGETS DN 108 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA TNF SIGNALING DN 90 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA RESPONSE TO IFNG DN 85 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER DENA UP 60 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NADLER OBESITY UP 61 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB TARGETS 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GERY CEBP目标 126 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANG IMMORTALIZED BY HPV31 DN 65 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG VHL TARGETS 138 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂反应和XPC DN 228 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SESTO RESPONSE TO UV C1 72 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU SMARCA4 TARGETS 64 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG HYPOXIA NORMAL 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zamora NOS2靶向DN 96 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标DN 105 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ TP53 TARGETS UP 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS UP 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Marzec IL2发出信号 115 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IWANAGA CARCINOGENESIS BY KRAS PTEN DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZKI TUMOR INVASIVENESS 3D DN 270 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER TUMOR VS NORMAL ADJACENT TISSUE UP 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLUM RESPONSE TO SALIRASIB UP 245 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUIZ TNC TARGETS DN 142 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAIRO HEPATOBLASTOMA CLASSES DN 210 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG REGULATED BY MYC DN 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI INDUCED T TO NATURAL KILLER UP 307 182 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 1 UP 7 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PASINI SUZ12 TARGETS DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TERAO AOX4 TARGETS HG UP 28 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIEG HYPOXIA NOT VIA KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FORTSCHEGGER PHF8 TARGETS DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOUDOUKHA BOUND BY IGF2BP2 111 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-124.1 1527年 1534年 1A,m8 hsa-miR-124a UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
hsa-miR-124a UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 1527年 1533年 1A HSA-MIR-506 UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA
hsa-miR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
HSA-MIR-506 UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA
hsa-miR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
miR-132/212 753 759 m8 HSA-MIR-212SZ uaacagucuccagucacgccc
hsa-miR-132 uaacagucuacccaugggg
miR-329 1105 1111 1A HSA-MIR-329 AACACACCUGGUUAACCUCUUU
miR-338 512 518 1A HSA-MIR-338 UCCAGCAUCAGUGAUUUUGUUGA
mir-34/449 1146 1153 1A,m8 HSA-MIR-34A UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU
HSA-MIR-34C AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449b Aggcaguguauuguuagcuggc
miR-544 346 352 1A HSA-MIR-544 AUUCUGCAUUUUUAGCAAGU