基因页:马可
概括?
基因 | 8685 |
象征 | 马可 |
同义词 | Scara2 |
描述 | 巨噬细胞受体与胶原结构 |
参考 | MIM:604870|HGNC:HGNC:6895|Ensembl:ENSG0000000019169|HPRD:05337|Vega:Otthumg00000131400 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q14.2 |
Pascal P值 | 0.467 |
胎儿β | 0.116 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0004 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00755 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2043746 | CHR2 | 119217287 | 马可 | 8685 | 0.13 | 顺式 | ||
RS2043745 | CHR2 | 119217441 | 马可 | 8685 | 0.13 | 顺式 | ||
RS17047497 | CHR2 | 56347610 | 马可 | 8685 | 0.01 | 反式 | ||
RS13136254 | CHR4 | 184824883 | 马可 | 8685 | 0.08 | 反式 | ||
RS11970411 | CHR6 | 138179160 | 马可 | 8685 | 0.18 | 反式 | ||
RS6973843 | CHR7 | 105985943 | 马可 | 8685 | 0.16 | 反式 | ||
RS230721 | CHR14 | 65318129 | 马可 | 8685 | 0.07 | 反式 | ||
RS8022462 | CHR14 | 65378375 | 马可 | 8685 | 0.07 | 反式 | ||
RS12147448 | CHR14 | 65381763 | 马可 | 8685 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005044 | 清道夫受体活性 | IEA | - | |
去:0008329 | 模式识别受体活性 | 塔斯 | 10331948 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007166 | 细胞表面受体连接的信号转导 | 塔斯 | 9468508 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 9468508 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 | 158 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 | 205 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌基础与仙女 | 330 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍林青春期乳腺 | 69 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath增殖 | 147 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lian Lipa目标6m | 74 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lian Lipa目标3M | 59 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞 | 156 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K27me3 | 196 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
coates巨噬细胞M1 vs M2向上 | 81 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP | 295 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi Plasmacytoma Up | 259 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ichiba移植与宿主疾病D7 UP | 107 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌ESR1 DN | 240 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jison Sickle细胞疾病 | 181 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈肝新陈代谢QTL顺式 | 93 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤DN | 267 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vanloo SP3靶向DN | 89 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |