概括
基因 8685
象征 马可
同义词 Scara2
描述 巨噬细胞受体与胶原结构
参考 MIM:604870|HGNC:HGNC:6895|Ensembl:ENSG0000000019169|HPRD:05337|Vega:Otthumg00000131400
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q14.2
Pascal P值 0.467
胎儿β 0.116
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0004
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00755

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2043746 CHR2 119217287 马可 8685 0.13 顺式
RS2043745 CHR2 119217441 马可 8685 0.13 顺式
RS17047497 CHR2 56347610 马可 8685 0.01 反式
RS13136254 CHR4 184824883 马可 8685 0.08 反式
RS11970411 CHR6 138179160 马可 8685 0.18 反式
RS6973843 CHR7 105985943 马可 8685 0.16 反式
RS230721 CHR14 65318129 马可 8685 0.07 反式
RS8022462 CHR14 65378375 马可 8685 0.07 反式
RS12147448 CHR14 65381763 马可 8685 0.07 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005044 清道夫受体活性 IEA -
去:0008329 模式识别受体活性 塔斯 10331948
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007166 细胞表面受体连接的信号转导 塔斯 9468508
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
去:0005887 质膜的积分 塔斯 9468508

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 158 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 205 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍林青春期乳腺 69 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath增殖 147 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lian Lipa目标6m 74 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lian Lipa目标3M 59 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞 156 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27me3 196 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
coates巨噬细胞M1 vs M2向上 81 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP 295 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma Up 259 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ichiba移植与宿主疾病D7 UP 107 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 DN 240 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病 181 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈肝新陈代谢QTL顺式 93 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤DN 267 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanloo SP3靶向DN 89 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因