基因页面:KRT37
总结吗?
GeneID | 8688年 |
象征 | KRT37 |
同义词 | HA7 | K37 | KRTHA7 |
描述 | 角蛋白37 |
参考 | MIM: 604541|HGNC: HGNC: 6455|运用:ENSG00000108417|HPRD: 05175|织女:OTTHUMG00000133606 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 17 q21.2 |
帕斯卡假定值 | 0.326 |
胎儿β | 0.139 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg10226036 | 17 | 39581966 | KRT37 | 9.13 e-5 | -0.696 | 0.027 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs10994209 | chr10 | 61877705 | KRT37 | 8688年 | 0.19 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KRT37_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PI4K2A | 0.91 | 0.91 |
CYFIP2 | 0.90 | 0.90 |
AP3M2 | 0.88 | 0.89 |
KIAA1737 | 0.88 | 0.88 |
ATP6V1A | 0.87 | 0.89 |
TGOLN2 | 0.87 | 0.87 |
进行MFN2 | 0.87 | 0.87 |
STK24 | 0.86 | 0.83 |
USP32 | 0.86 | 0.84 |
PPTC7 | 0.86 | 0.87 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.59 | -0.48 |
AF347015.18 | -0.53 | -0.44 |
AC010300.1 | -0.51 | -0.49 |
AF347015.8 | -0.50 | -0.43 |
MT-CO2 | -0.50 | -0.44 |
IL32 | -0.50 | -0.41 |
AF347015.2 | -0.49 | -0.38 |
AF347015.31 | -0.49 | -0.43 |
AC098691.2 | -0.49 | -0.42 |
CSAG1 | -0.48 | -0.42 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
田中在食管癌癌甲基化 | 103年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
营地结肠癌拷贝数 | 92年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布朗感染血巨细胞病毒30分钟 | 56 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马顿斯维甲酸反应了 | 857年 | 456年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |