基因页面:CBLN1
总结吗?
GeneID | 869年 |
象征 | CBLN1 |
同义词 | - - - - - - |
描述 | cerebellin 1前体 |
参考 | MIM: 600432|HGNC: HGNC: 1543|运用:ENSG00000102924|HPRD: 02697|织女:OTTHUMG00000133148 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 16 q12.1 |
帕斯卡假定值 | 0.015 |
胎儿β | 0.451 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
简历:PheWAS | Phenome-wide协会研究(PheWAS) | 157个snp与精神分裂症有关 | 0 |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.01775 | |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
简历:PheWAS
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | P | 函数 | 基因 | 上/下距离 |
---|
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg00049033 | 16 | 49317080 | CBLN1 | 3.22 e-5 | -0.389 | 0.019 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
snp_a - 4290143 | 0 | CBLN1 | 869年 | 0.01 | 反式 | |||
rs17572651 | chr1 | 218943612 | CBLN1 | 869年 | 0.17 | 反式 | ||
rs16829545 | chr2 | 151977407 | CBLN1 | 869年 | 1.077 e-21 | 反式 | ||
rs3845734 | chr2 | 171125572 | CBLN1 | 869年 | 4.526 e - | 反式 | ||
rs1967327 | chr2 | 179314358 | CBLN1 | 869年 | 0.16 | 反式 | ||
rs7584986 | chr2 | 184111432 | CBLN1 | 869年 | 2.669 e-12 | 反式 | ||
rs2183142 | chr4 | 159232695 | CBLN1 | 869年 | 3.596 e-5 | 反式 | ||
rs170776 | chr4 | 173276735 | CBLN1 | 869年 | 0.02 | 反式 | ||
rs1396222 | chr4 | 173279496 | CBLN1 | 869年 | 0.01 | 反式 | ||
rs335993 | chr4 | 173321789 | CBLN1 | 869年 | 0.05 | 反式 | ||
rs335980 | chr4 | 173329784 | CBLN1 | 869年 | 0 | 反式 | ||
rs335982 | chr4 | 173330945 | CBLN1 | 869年 | 0.02 | 反式 | ||
rs336016 | chr4 | 173366576 | CBLN1 | 869年 | 0.19 | 反式 | ||
rs337984 | chr4 | 173411662 | CBLN1 | 869年 | 0.01 | 反式 | ||
rs17762315 | chr5 | 76807576 | CBLN1 | 869年 | 8.137的军医 | 反式 | ||
rs10491487 | chr5 | 80323367 | CBLN1 | 869年 | 0.14 | 反式 | ||
snp_a - 4218600 | 0 | CBLN1 | 869年 | 0.03 | 反式 | |||
rs1380396 | chr5 | 100737044 | CBLN1 | 869年 | 0.02 | 反式 | ||
rs17136514 | chr5 | 100847200 | CBLN1 | 869年 | 0.11 | 反式 | ||
rs9968624 | chr5 | 100848223 | CBLN1 | 869年 | 0.11 | 反式 | ||
rs12196880 | chr6 | 24313746 | CBLN1 | 869年 | 0.06 | 反式 | ||
rs10806988 | chr6 | 24341768 | CBLN1 | 869年 | 0.04 | 反式 | ||
rs9461864 | chr6 | 33481468 | CBLN1 | 869年 | 3.54的军医 | 反式 | ||
rs16890367 | chr6 | 38078448 | CBLN1 | 869年 | 0.13 | 反式 | ||
rs2961531 | chr7 | 79260819 | CBLN1 | 869年 | 0.19 | 反式 | ||
rs7787830 | chr7 | 98797019 | CBLN1 | 869年 | 0.2 | 反式 | ||
rs3118341 | chr9 | 25185518 | CBLN1 | 869年 | 0 | 反式 | ||
rs1126130 | chr9 | 25209346 | CBLN1 | 869年 | 0.13 | 反式 | ||
rs1998746 | chr9 | 25211761 | CBLN1 | 869年 | 0.13 | 反式 | ||
rs9406868 | chr9 | 25223372 | CBLN1 | 869年 | 0.01 | 反式 | ||
rs2225105 | chr9 | 25480908 | CBLN1 | 869年 | 0.01 | 反式 | ||
rs11139334 | chr9 | 84209393 | CBLN1 | 869年 | 6.463的军医 | 反式 | ||
rs2393316 | chr10 | 59333070 | CBLN1 | 869年 | 0.12 | 反式 | ||
rs9989228 | chr14 | 37809252 | CBLN1 | 869年 | 0.17 | 反式 | ||
rs16955618 | chr15 | 29937543 | CBLN1 | 869年 | 1.787 e-32 | 反式 | ||
rs2077735 | chr15 | 58479024 | CBLN1 | 869年 | 0.07 | 反式 | ||
rs9941296 | chr16 | 2759498 | CBLN1 | 869年 | 0.09 | 反式 | ||
rs4782029 | chr16 | 17248015 | CBLN1 | 869年 | 0.17 | 反式 | ||
rs16945437 | chr17 | 11797650 | CBLN1 | 869年 | 0 | 反式 | ||
rs11873184 | chr18 | 1584081 | CBLN1 | 869年 | 0.01 | 反式 | ||
rs11882889 | chr19 | 19887684 | CBLN1 | 869年 | 0 | 反式 | ||
rs7274477 | chr20 | 1676942 | CBLN1 | 869年 | 0.14 | 反式 | ||
rs1041786 | chr21 | 22617710 | CBLN1 | 869年 | 4.159 e - | 反式 | ||
rs16981387 | chr22 | 26495864 | CBLN1 | 869年 | 0.05 | 反式 | ||
rs16986332 | chrX | 10958354 | CBLN1 | 869年 | 0 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MAL | 0.90 | 0.90 |
CD9 | 0.90 | 0.90 |
NINJ2 | 0.89 | 0.87 |
无足的 | 0.89 | 0.88 |
DBNDD2 | 0.89 | 0.90 |
PLLP | 0.88 | 0.89 |
EVI2A | 0.88 | 0.89 |
RTKN | 0.88 | 0.90 |
CYP27A1 | 0.87 | 0.89 |
CRYAB | 0.87 | 0.88 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NKIRAS2 | -0.61 | -0.62 |
KIAA1949 | -0.61 | -0.66 |
CRMP1 | -0.59 | -0.62 |
ZNF551 | -0.59 | -0.65 |
AC004017.1 | -0.59 | -0.65 |
ZBTB8A | -0.59 | -0.62 |
KIF21B | -0.59 | -0.65 |
DPYSL3 | -0.59 | -0.63 |
KIAA1211 | -0.59 | -0.66 |
GMIP | -0.59 | -0.62 |
第三部分。基因本体论注释
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0007268 | 突触传递 | 助教 | Synap神经元,神经递质(术语层面:6) | 1704129 |
去:0007399 | 神经系统发育 | 助教 | 神经突(术语层面:5) | 1704129 |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0045202 | 突触 | 国际能源机构 | Synap神经元,神经递质,神经胶质(术语层面:2) | - - - - - - |
去:0005576 | 细胞外区域 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0030054 | 细胞结 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
DELYS甲状腺癌了 | 443年 | 294年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
兰斯乳腺癌16问若以桑不光要拷贝数 | 63年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH PRC2目标 | 652年 | 441年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李PTCH1和SUFU DN的目标 | 83年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
AFFAR YY1目标了 | 214年 | 133年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳人大HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 142年 | 103年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 | 435年 | 318年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森人大HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 210年 | 148年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马顿斯维甲酸反应了 | 857年 | 456年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PURBEY CTBP1和SATB1的目标 | 87年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NABA分泌的因素 | 344年 | 197年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NABA MATRISOME相关 | 753年 | 411年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NABA MATRISOME | 1028年 | 559年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |