总结吗?
GeneID 869年
象征 CBLN1
同义词 - - - - - -
描述 cerebellin 1前体
参考 MIM: 600432|HGNC: HGNC: 1543|运用:ENSG00000102924|HPRD: 02697|织女:OTTHUMG00000133148
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 16 q12.1
帕斯卡假定值 0.015
胎儿β 0.451
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
简历:PheWAS Phenome-wide协会研究(PheWAS) 157个snp与精神分裂症有关 0
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 1
GSMA_IIE 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) Psr: 0.01775
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:2

部分即遗传学和表观遗传学注释

@简历:PheWAS

SNP ID 染色体 位置 等位基因 P 函数 基因 上/下距离

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg00049033 16 49317080 CBLN1 3.22 e-5 -0.389 0.019 DMG: Wockner_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
snp_a - 4290143 0 CBLN1 869年 0.01 反式
rs17572651 chr1 218943612 CBLN1 869年 0.17 反式
rs16829545 chr2 151977407 CBLN1 869年 1.077 e-21 反式
rs3845734 chr2 171125572 CBLN1 869年 4.526 e - 反式
rs1967327 chr2 179314358 CBLN1 869年 0.16 反式
rs7584986 chr2 184111432 CBLN1 869年 2.669 e-12 反式
rs2183142 chr4 159232695 CBLN1 869年 3.596 e-5 反式
rs170776 chr4 173276735 CBLN1 869年 0.02 反式
rs1396222 chr4 173279496 CBLN1 869年 0.01 反式
rs335993 chr4 173321789 CBLN1 869年 0.05 反式
rs335980 chr4 173329784 CBLN1 869年 0 反式
rs335982 chr4 173330945 CBLN1 869年 0.02 反式
rs336016 chr4 173366576 CBLN1 869年 0.19 反式
rs337984 chr4 173411662 CBLN1 869年 0.01 反式
rs17762315 chr5 76807576 CBLN1 869年 8.137的军医 反式
rs10491487 chr5 80323367 CBLN1 869年 0.14 反式
snp_a - 4218600 0 CBLN1 869年 0.03 反式
rs1380396 chr5 100737044 CBLN1 869年 0.02 反式
rs17136514 chr5 100847200 CBLN1 869年 0.11 反式
rs9968624 chr5 100848223 CBLN1 869年 0.11 反式
rs12196880 chr6 24313746 CBLN1 869年 0.06 反式
rs10806988 chr6 24341768 CBLN1 869年 0.04 反式
rs9461864 chr6 33481468 CBLN1 869年 3.54的军医 反式
rs16890367 chr6 38078448 CBLN1 869年 0.13 反式
rs2961531 chr7 79260819 CBLN1 869年 0.19 反式
rs7787830 chr7 98797019 CBLN1 869年 0.2 反式
rs3118341 chr9 25185518 CBLN1 869年 0 反式
rs1126130 chr9 25209346 CBLN1 869年 0.13 反式
rs1998746 chr9 25211761 CBLN1 869年 0.13 反式
rs9406868 chr9 25223372 CBLN1 869年 0.01 反式
rs2225105 chr9 25480908 CBLN1 869年 0.01 反式
rs11139334 chr9 84209393 CBLN1 869年 6.463的军医 反式
rs2393316 chr10 59333070 CBLN1 869年 0.12 反式
rs9989228 chr14 37809252 CBLN1 869年 0.17 反式
rs16955618 chr15 29937543 CBLN1 869年 1.787 e-32 反式
rs2077735 chr15 58479024 CBLN1 869年 0.07 反式
rs9941296 chr16 2759498 CBLN1 869年 0.09 反式
rs4782029 chr16 17248015 CBLN1 869年 0.17 反式
rs16945437 chr17 11797650 CBLN1 869年 0 反式
rs11873184 chr18 1584081 CBLN1 869年 0.01 反式
rs11882889 chr19 19887684 CBLN1 869年 0 反式
rs7274477 chr20 1676942 CBLN1 869年 0.14 反式
rs1041786 chr21 22617710 CBLN1 869年 4.159 e - 反式
rs16981387 chr22 26495864 CBLN1 869年 0.05 反式
rs16986332 chrX 10958354 CBLN1 869年 0 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
MAL 0.90 0.90
CD9 0.90 0.90
NINJ2 0.89 0.87
无足的 0.89 0.88
DBNDD2 0.89 0.90
PLLP 0.88 0.89
EVI2A 0.88 0.89
RTKN 0.88 0.90
CYP27A1 0.87 0.89
CRYAB 0.87 0.88
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
NKIRAS2 -0.61 -0.62
KIAA1949 -0.61 -0.66
CRMP1 -0.59 -0.62
ZNF551 -0.59 -0.65
AC004017.1 -0.59 -0.65
ZBTB8A -0.59 -0.62
KIF21B -0.59 -0.65
DPYSL3 -0.59 -0.63
KIAA1211 -0.59 -0.66
GMIP -0.59 -0.62

第三部分。基因本体论注释

生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0007268 突触传递 助教 Synap神经元,神经递质(术语层面:6) 1704129
去:0007399 神经系统发育 助教 神经突(术语层面:5) 1704129
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0045202 突触 国际能源机构 Synap神经元,神经递质,神经胶质(术语层面:2) - - - - - -
去:0005576 细胞外区域 国际能源机构 - - - - - -
去:0016020 国际能源机构 - - - - - -
去:0030054 细胞结 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
DELYS甲状腺癌了 443年 294年 所有SZGR 2.0基因通路
兰斯乳腺癌16问若以桑不光要拷贝数 63年 44 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH SUZ12目标 1038年 678年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH速度的目标 1062年 725年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH ES与H3K27ME3 1118年 744年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH PRC2目标 652年 441年 所有SZGR 2.0基因通路
李PTCH1和SUFU DN的目标 83年 69年 所有SZGR 2.0基因通路
AFFAR YY1目标了 214年 133年 所有SZGR 2.0基因通路
迈斯纳人大HCP H3K4ME3和H3K27ME3 142年 103年 所有SZGR 2.0基因通路
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 1069年 729年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 435年 318年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森人大HCP H3K4ME3和H3K27ME3 210年 148年 所有SZGR 2.0基因通路
马顿斯维甲酸反应了 857年 456年 所有SZGR 2.0基因通路
PURBEY CTBP1和SATB1的目标 87年 52 所有SZGR 2.0基因通路
ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 1725年 838年 所有SZGR 2.0基因通路
NABA分泌的因素 344年 197年 所有SZGR 2.0基因通路
NABA MATRISOME相关 753年 411年 所有SZGR 2.0基因通路
NABA MATRISOME 1028年 559年 所有SZGR 2.0基因通路