基因页面:ACTN1
总结吗?
GeneID | 87年 |
象征 | ACTN1 |
同义词 | BDPLT15 |
描述 | 辅肌动蛋白α1 |
参考 | MIM: 102575|HGNC: HGNC: 163|运用:ENSG00000072110|HPRD: 00020|织女:OTTHUMG00000171386 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 14抓起| 14 q22-q24 |
帕斯卡假定值 | 0.387 |
夏洛克假定值 | 0.099 |
这样假定值 | 0.018 |
胎儿β | -1.662 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 小脑 迈尔斯的顺式和反式 |
支持 | 结构可塑性 G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS CompositeSet Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
简历:PheWAS | Phenome-wide协会研究(PheWAS) | 157个snp与精神分裂症有关 | 0 |
DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 1 |
认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
简历:PheWAS
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | P | 函数 | 基因 | 上/下距离 |
---|
认为表
基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ACTN1 | chr14 | 69352217 | T | C | NM_001102 NM_001130004 NM_001130005 |
p.437H > R p.437H > R p.437H > R |
错义 错义 错义 |
精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg21350283 | 14 | 69445743 | ACTN1 | -0.024 | 0.27 | DMG: Nishioka_2013 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs16827037 | chr3 | 117203284 | ACTN1 | 87年 | 0.08 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ACTN1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CDC2L5 | 0.87 | 0.90 |
ZBTB2 | 0.87 | 0.88 |
KLHL20 | 0.86 | 0.91 |
SART3 | 0.86 | 0.89 |
UBTF | 0.86 | 0.88 |
KIAA0174 | 0.86 | 0.88 |
RSPRY1 | 0.85 | 0.89 |
ZNF146 | 0.85 | 0.88 |
CTR9 | 0.85 | 0.88 |
SMEK1 | 0.85 | 0.89 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FXYD1 | -0.71 | -0.81 |
AF347015.31 | -0.70 | -0.80 |
MT-CO2 | -0.70 | -0.80 |
AF347015.33 | -0.68 | -0.77 |
AF347015.27 | -0.68 | -0.78 |
IFI27 | -0.68 | -0.77 |
C5orf53 | -0.67 | -0.71 |
AF347015.21 | -0.66 | -0.83 |
HIGD1B | -0.66 | -0.78 |
MT-CYB | -0.66 | -0.76 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ACTN1 | FLJ40884 | 辅肌动蛋白、α1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11470434 |
背景 | Arc-1 | CD324 | CDHE |适应型| LCAM | UVO | 钙粘蛋白1 1型钙粘蛋白(上皮) | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 9535896 |
CDK5R1 | CDK5P35 | CDK5R | MGC33831 | NCK5A | p23 | p25 | p35区域| p35nck5a | 细胞周期蛋白依赖性激酶5,调节亚基1 (p35区域) | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 12223541 |
CDK5R2 | NCK5AI | P39 | p39nck5ai | 细胞周期蛋白依赖性激酶5,调节亚基2 (p39) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12223541 |
COL17A1 | BA16H23.2 | BP180 | BPAG2 | FLJ60881 | KIAA0204 | LAD-1 | 胶原蛋白、类型十七、α1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11739652 |
CSRP3 | CLP | CMD1M | CMH12 | CRP3 | LMO4 | MGC14488 | MGC61993 |延时 | 半胱氨酸和glycine-rich蛋白3(心脏LIM蛋白) | - - - - - - | HPRD | 12642359 |
CTNNA1 | CAP102 | FLJ36832 | 连环蛋白(cadherin-associated蛋白质),α1,102 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7790378 |
FBP1 | 出口押汇 | 的特性,6-bisphosphatase 1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12507293 |
GIPC1 | C19orf3 | GIPC | GLUT1CBP | Hs.6454 | IIP-1 | MGC15889 | MGC3774 | |扼杀RGS19IP1 | SEMCAP | SYNECTIIN | SYNECTIN |技巧2 | GIPC PDZ域包含家庭,成员1 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 |
BioGRID | 10198040 |
GRIN2A | NMDAR2A | NR2A | 谷氨酸受体,ionotropic N-methyl D-aspartate 2 a | - - - - - - | HPRD | 11854440 |
ITGB1 | CD29 | FNRB | GPIIA | MDF2 | MSK12 | VLA-BETA相似|方法估算出来的 | 整合素β1(纤连蛋白受体β多肽抗原CD29包括MDF2 MSK12) | 重新组成复杂 | BioGRID | 2116421 |
MAGEA11 | MAGE-11 | MAGE11 | MAGEA-11 | MGC10511 | 黑色素瘤抗原家族,11 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
MYOT | LGMD1 | LGMD1A | TTID | myotilin | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12499399 |
MYOZ1 | CS-2 | FATZ | MYOZ | myozenin 1 | - - - - - - | HPRD | 11842093 |
MYOZ1 | CS-2 | FATZ | MYOZ | myozenin 1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
MYOZ2 | C4orf5 | CS-1 | myozenin 2 | - - - - - - | HPRD | 11842093 |
MYOZ3 | CS-3 | CS3 | FRP3 | myozenin 3 | - - - - - - | HPRD | 11842093 |
NEBL | FLJ53769 | LNEBL | MGC119746 | MGC119747 | bA56H7.1 | nebulette | - - - - - - | HPRD | 10470015 |
PDLIM1 | CLIM1 | CLP-36 | CLP36 | hCLIM1 | PDZ和LIM域1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11110697 |
PDLIM1 | CLIM1 | CLP-36 | CLP36 | hCLIM1 | PDZ和LIM域1 | CLP-36与alpha-actinin 1。这种交互是仿照人类CLP-36证明之间的交互和鸡肉alpha-actinin 1。 | 绑定 | 10753915 |
的PHB | PHB1 | prohibitin | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12628297 |
PKN1 | 它们的| MGC46204 | PAK1 |波兰| PKN-ALPHA | PRK1 | PRKCL1 | 蛋白激酶N1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9030526|11802708 |
PYGB | MGC9213 | 糖原磷酸化酶;大脑 | 重新组成复杂 | BioGRID | 12211109 |
RAVER1 | KIAA1978 | 核糖核蛋白,PTB-binding 1 | - - - - - - | HPRD | 11724819 |
SSX2IP | ADIP | FLJ10848 | KIAA0923 | MGC75026 | 滑膜肉瘤,X断点2相互作用的蛋白质 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12446711 |
测试工程师 | 苔丝DKFZp586B2022 | MGC1146 | | TESS-2 | 睾丸中记录(3 LIM域) | - - - - - - | HPRD | 12695497 |
TRAF4 | CART1 | MLN62 | RNF83 | TNF receptor-associated因子4 | TRAF4与alpha-actinin交互。 | 绑定 | 12023963 |
TTN | CMD1G | CMH9 | CMPD4 | CONNECTIN | DKFZp451N061 | EOMFC | FLJ26020 | FLJ26409 | FLJ32040 | FLJ34413 | FLJ39564 | FLJ43066 | HMERF | LGMD2J | TMD | 肌 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11305911|11846417 |
XRCC4 | - - - - - - | x射线在中国仓鼠细胞修复补充缺陷修复4 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
ZYX股票 | ESP-2 | HED-2 | zyxin | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10224105|11423549 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG粘着斑 | 201年 | 138年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG ADHERENS结 | 75年 | 53 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG紧密连接 | 134年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG白细胞TRANSENDOTHELIAL迁移 | 118年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG调节肌动蛋白细胞骨架 | 216年 | 144年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG系统性红斑狼疮 | 140年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG ARRHYTHMOGENIC右心室心肌病ARVC | 76年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA CELL2CELL通路 | 14 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA整合素途径 | 38 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA UCALPAIN通路 | 18 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
圣整合素信号通路 | 82年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID相同的途径 | 45 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID SYNDECAN 4通道 | 32 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID ECADHERIN稳定途径 | 42 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID FAK通路 | 59 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME细胞细胞通讯 | 120年 | 77年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
升高血小板胞质CA2 REACTOME响应 | 89年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME细胞细胞外基质的相互作用 | 14 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME细胞组织结 | 78年 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME NEPHRIN交互 | 20. | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME止血 | 466年 | 331年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME血小板激活信号和聚合 | 208年 | 138年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
渡边直肠癌放疗反应DN | 92年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BERTUCCI髓与乳腺癌导管DN | 169年 | 118年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
弗尔涅腺泡的发育后期DN | 21 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人 | 579年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS基本DN | 455年 | 304年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS间充质DN | 460年 | 312年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
HOEBEKE淋巴干细胞DN | 86年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1融合HSC DN | 187年 | 115年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
TIEN肠道益生菌6小时DN | 167年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
TIEN肠道益生菌24小时 | 557年 | 331年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金正日WT1目标了 | 214年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金正日WT1目标8小时 | 164年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
格雷厄姆CML分裂和正常的静止 | 181年 | 101年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
百度转移DN | 161年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
HAHTOLA蕈样CD4 DN | 116年 | 71年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ENK紫外线反应表皮 | 293年 | 179年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
林格伦膀胱癌集群1 DN | 378年 | 231年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BERENJENO通过RHOA转换 | 536年 | 340年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
朗MYB家庭的目标 | 29日 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马丁与HDAC | 44 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MARTORIATI MDM4目标神经上皮 | 176年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
洛佩兹MBD的目标 | 957年 | 597年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
TP53 SCIAN倒生的目标和TP73 DN | 31日 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
鲜明的前额叶皮层22 q11删除 | 195年 | 138年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
AMIT EGF响应480海拉 | 164年 | 118年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
尼尔森对雄激素 | 86年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FLECHNER活检肾移植好的VS捐赠 | 555年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布朗骨髓细胞发展起来 | 165年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
THEILGAARD中性粒细胞在皮肤伤口DN | 225年 | 163年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
任肺泡横纹肌肉瘤DN | 408年 | 274年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KAAB失败心脏心房DN | 141年 | 99年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
击倒卡路里限制肌肉DN | 87年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KAAB心脏心房和心室 | 249年 | 170年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
麦克朗可卡因奖励5 d | 79年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BANDRES应对CARMUSTIN管理24小时DN | 33 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RODWELL肾脏老化了 | 487年 | 303年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病早期布莱洛克的DN | 165年 | 106年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BANDRES应对CARMUSTIN没有管理48小时DN | 32 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BANDRES应对CARMUSTIN管理48小时DN | 161年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
检查参与组成分泌腺中肺癌和成纤维细胞 | 132年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GAVIN集群P7 FOXP3目标 | 90年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萧述三乳腺癌基底 | 648年 | 398年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
克罗默肿瘤发生了 | 63年 | 36 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
戴维斯多发性骨髓瘤VS开战DN | 28 | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
LINDSTEDT树突状细胞成熟D | 68年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
甜蜜的肺癌喀斯特 | 491年 | 316年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
霍夫曼PRE BI大前BII淋巴细胞DN | 75年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李T淋巴细胞早期DN | 57 | 36 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
60张及目标的人力资源 | 293年 | 203年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
八木AML和发票16易位 | 422年 | 277年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
弗尔涅腺泡的发育晚2 | 277年 | 172年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
黄成人组织干细胞模块 | 721年 | 492年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
么时间响应黄体酮集群16 | 79年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
赛对促性腺激素DN | 87年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萨松应对FORSKOLIN DN | 88年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KARLSSON TGFB1目标了 | 127年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN KARLSSON TGFB1目标 | 207年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李诱导T自然杀伤DN | 116年 | 83年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金所有障碍CALB1 CORR | 548年 | 370年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN WIERENGA STAT5A目标 | 213年 | 127年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MIYAGAWA EWSR1 ETS融合DN的目标 | 229年 | 135年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PASINI SUZ12目标 | 315年 | 215年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KOINUMA SMAD2或SMAD3的目标 | 824年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
IKEDA MIR30目标了 | 116年 | 87年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
皮德森转移由ERBB2同种型7 | 403年 | 240年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
他的目标611 ERBB2的清洁技术基金对碘氧基苯甲醚 | 76年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KRIEG KDM3A目标不缺氧 | 208年 | 107年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |