总结吗?
GeneID 87年
象征 ACTN1
同义词 BDPLT15
描述 辅肌动蛋白α1
参考 MIM: 102575|HGNC: HGNC: 163|运用:ENSG00000072110|HPRD: 00020|织女:OTTHUMG00000171386
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 14抓起| 14 q22-q24
帕斯卡假定值 0.387
夏洛克假定值 0.099
这样假定值 0.018
胎儿β -1.662
DMG 1(#研究)
eGene 小脑
迈尔斯的顺式和反式
支持 结构可塑性
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS
CompositeSet
Ascano FMRP目标

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
简历:PheWAS Phenome-wide协会研究(PheWAS) 157个snp与精神分裂症有关 0
DMG: Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 1
认为:Fromer_2014 全外显子组测序分析 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。

部分即遗传学和表观遗传学注释

@简历:PheWAS

SNP ID 染色体 位置 等位基因 P 函数 基因 上/下距离

@认为表

基因 染色体 位置 裁判 Alt 成绩单 AA变化 突变类型 筛选 CG46 特征 研究
ACTN1 chr14 69352217 T C NM_001102
NM_001130004
NM_001130005
p.437H > R
p.437H > R
p.437H > R
错义
错义
错义
精神分裂症 认为:Fromer_2014

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg21350283 14 69445743 ACTN1 -0.024 0.27 DMG: Nishioka_2013

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs16827037 chr3 117203284 ACTN1 87年 0.08 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
CDC2L5 0.87 0.90
ZBTB2 0.87 0.88
KLHL20 0.86 0.91
SART3 0.86 0.89
UBTF 0.86 0.88
KIAA0174 0.86 0.88
RSPRY1 0.85 0.89
ZNF146 0.85 0.88
CTR9 0.85 0.88
SMEK1 0.85 0.89
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
FXYD1 -0.71 -0.81
AF347015.31 -0.70 -0.80
MT-CO2 -0.70 -0.80
AF347015.33 -0.68 -0.77
AF347015.27 -0.68 -0.78
IFI27 -0.68 -0.77
C5orf53 -0.67 -0.71
AF347015.21 -0.66 -0.83
HIGD1B -0.66 -0.78
MT-CYB -0.66 -0.76

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 PubMed ID
ACTN1 FLJ40884 辅肌动蛋白、α1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11470434
背景 Arc-1 | CD324 | CDHE |适应型| LCAM | UVO 钙粘蛋白1 1型钙粘蛋白(上皮) 亲和力Capture-Western BioGRID 9535896
CDK5R1 CDK5P35 | CDK5R | MGC33831 | NCK5A | p23 | p25 | p35区域| p35nck5a 细胞周期蛋白依赖性激酶5,调节亚基1 (p35区域) 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
2台混合动力
BioGRID 12223541
CDK5R2 NCK5AI | P39 | p39nck5ai 细胞周期蛋白依赖性激酶5,调节亚基2 (p39) - - - - - - HPRD, BioGRID 12223541
COL17A1 BA16H23.2 | BP180 | BPAG2 | FLJ60881 | KIAA0204 | LAD-1 胶原蛋白、类型十七、α1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11739652
CSRP3 CLP | CMD1M | CMH12 | CRP3 | LMO4 | MGC14488 | MGC61993 |延时 半胱氨酸和glycine-rich蛋白3(心脏LIM蛋白) - - - - - - HPRD 12642359
CTNNA1 CAP102 | FLJ36832 连环蛋白(cadherin-associated蛋白质),α1,102 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 7790378
FBP1 出口押汇 的特性,6-bisphosphatase 1 - - - - - - HPRD, BioGRID 12507293
GIPC1 C19orf3 | GIPC | GLUT1CBP | Hs.6454 | IIP-1 | MGC15889 | MGC3774 | |扼杀RGS19IP1 | SEMCAP | SYNECTIIN | SYNECTIN |技巧2 GIPC PDZ域包含家庭,成员1 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 10198040
GRIN2A NMDAR2A | NR2A 谷氨酸受体,ionotropic N-methyl D-aspartate 2 a - - - - - - HPRD 11854440
ITGB1 CD29 | FNRB | GPIIA | MDF2 | MSK12 | VLA-BETA相似|方法估算出来的 整合素β1(纤连蛋白受体β多肽抗原CD29包括MDF2 MSK12) 重新组成复杂 BioGRID 2116421
MAGEA11 MAGE-11 | MAGE11 | MAGEA-11 | MGC10511 黑色素瘤抗原家族,11 2台混合动力 BioGRID 16189514
MYOT LGMD1 | LGMD1A | TTID myotilin - - - - - - HPRD, BioGRID 12499399
MYOZ1 CS-2 | FATZ | MYOZ myozenin 1 - - - - - - HPRD 11842093
MYOZ1 CS-2 | FATZ | MYOZ myozenin 1 2台混合动力 BioGRID 16189514
MYOZ2 C4orf5 | CS-1 myozenin 2 - - - - - - HPRD 11842093
MYOZ3 CS-3 | CS3 | FRP3 myozenin 3 - - - - - - HPRD 11842093
NEBL FLJ53769 | LNEBL | MGC119746 | MGC119747 | bA56H7.1 nebulette - - - - - - HPRD 10470015
PDLIM1 CLIM1 | CLP-36 | CLP36 | hCLIM1 PDZ和LIM域1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11110697
PDLIM1 CLIM1 | CLP-36 | CLP36 | hCLIM1 PDZ和LIM域1 CLP-36与alpha-actinin 1。这种交互是仿照人类CLP-36证明之间的交互和鸡肉alpha-actinin 1。 绑定 10753915
的PHB PHB1 prohibitin 亲和力Capture-Western BioGRID 12628297
PKN1 它们的| MGC46204 | PAK1 |波兰| PKN-ALPHA | PRK1 | PRKCL1 蛋白激酶N1 - - - - - - HPRD, BioGRID 9030526|11802708
PYGB MGC9213 糖原磷酸化酶;大脑 重新组成复杂 BioGRID 12211109
RAVER1 KIAA1978 核糖核蛋白,PTB-binding 1 - - - - - - HPRD 11724819
SSX2IP ADIP | FLJ10848 | KIAA0923 | MGC75026 滑膜肉瘤,X断点2相互作用的蛋白质 - - - - - - HPRD, BioGRID 12446711
测试工程师 苔丝DKFZp586B2022 | MGC1146 | | TESS-2 睾丸中记录(3 LIM域) - - - - - - HPRD 12695497
TRAF4 CART1 | MLN62 | RNF83 TNF receptor-associated因子4 TRAF4与alpha-actinin交互。 绑定 12023963
TTN CMD1G | CMH9 | CMPD4 | CONNECTIN | DKFZp451N061 | EOMFC | FLJ26020 | FLJ26409 | FLJ32040 | FLJ34413 | FLJ39564 | FLJ43066 | HMERF | LGMD2J | TMD - - - - - - HPRD, BioGRID 11305911|11846417
XRCC4 - - - - - - x射线在中国仓鼠细胞修复补充缺陷修复4 2台混合动力 BioGRID 16189514
ZYX股票 ESP-2 | HED-2 zyxin - - - - - - HPRD, BioGRID 10224105|11423549


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG粘着斑 201年 138年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG ADHERENS结 75年 53 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG紧密连接 134年 86年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG白细胞TRANSENDOTHELIAL迁移 118年 78年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG调节肌动蛋白细胞骨架 216年 144年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG系统性红斑狼疮 140年 One hundred. 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG ARRHYTHMOGENIC右心室心肌病ARVC 76年 59 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA CELL2CELL通路 14 11 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA整合素途径 38 29日 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA UCALPAIN通路 18 11 所有SZGR 2.0基因通路
圣整合素信号通路 82年 62年 所有SZGR 2.0基因通路
PID相同的途径 45 32 所有SZGR 2.0基因通路
PID SYNDECAN 4通道 32 25 所有SZGR 2.0基因通路
PID ECADHERIN稳定途径 42 34 所有SZGR 2.0基因通路
PID FAK通路 59 45 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME细胞细胞通讯 120年 77年 所有SZGR 2.0基因通路
升高血小板胞质CA2 REACTOME响应 89年 56 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME细胞细胞外基质的相互作用 14 10 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME细胞组织结 78年 43 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME NEPHRIN交互 20. 15 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME止血 466年 331年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME血小板激活信号和聚合 208年 138年 所有SZGR 2.0基因通路
渡边直肠癌放疗反应DN 92年 51 所有SZGR 2.0基因通路
BERTUCCI髓与乳腺癌导管DN 169年 118年 所有SZGR 2.0基因通路
弗尔涅腺泡的发育后期DN 21 13 所有SZGR 2.0基因通路
FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人 579年 346年 所有SZGR 2.0基因通路
CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS基本DN 455年 304年 所有SZGR 2.0基因通路
CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS间充质DN 460年 312年 所有SZGR 2.0基因通路
HOEBEKE淋巴干细胞DN 86年 59 所有SZGR 2.0基因通路
唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1融合HSC DN 187年 115年 所有SZGR 2.0基因通路
TIEN肠道益生菌6小时DN 167年 One hundred. 所有SZGR 2.0基因通路
TIEN肠道益生菌24小时 557年 331年 所有SZGR 2.0基因通路
金正日WT1目标了 214年 155年 所有SZGR 2.0基因通路
金正日WT1目标8小时 164年 122年 所有SZGR 2.0基因通路
格雷厄姆CML分裂和正常的静止 181年 101年 所有SZGR 2.0基因通路
百度转移DN 161年 93年 所有SZGR 2.0基因通路
HAHTOLA蕈样CD4 DN 116年 71年 所有SZGR 2.0基因通路
ENK紫外线反应表皮 293年 179年 所有SZGR 2.0基因通路
林格伦膀胱癌集群1 DN 378年 231年 所有SZGR 2.0基因通路
BERENJENO通过RHOA转换 536年 340年 所有SZGR 2.0基因通路
朗MYB家庭的目标 29日 16 所有SZGR 2.0基因通路
马丁与HDAC 44 31日 所有SZGR 2.0基因通路
MARTORIATI MDM4目标神经上皮 176年 111年 所有SZGR 2.0基因通路
洛佩兹MBD的目标 957年 597年 所有SZGR 2.0基因通路
TP53 SCIAN倒生的目标和TP73 DN 31日 23 所有SZGR 2.0基因通路
鲜明的前额叶皮层22 q11删除 195年 138年 所有SZGR 2.0基因通路
AMIT EGF响应480海拉 164年 118年 所有SZGR 2.0基因通路
尼尔森对雄激素 86年 61年 所有SZGR 2.0基因通路
FLECHNER活检肾移植好的VS捐赠 555年 346年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗骨髓细胞发展起来 165年 One hundred. 所有SZGR 2.0基因通路
THEILGAARD中性粒细胞在皮肤伤口DN 225年 163年 所有SZGR 2.0基因通路
任肺泡横纹肌肉瘤DN 408年 274年 所有SZGR 2.0基因通路
KAAB失败心脏心房DN 141年 99年 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 1237年 837年 所有SZGR 2.0基因通路
击倒卡路里限制肌肉DN 87年 59 所有SZGR 2.0基因通路
KAAB心脏心房和心室 249年 170年 所有SZGR 2.0基因通路
麦克朗可卡因奖励5 d 79年 62年 所有SZGR 2.0基因通路
BANDRES应对CARMUSTIN管理24小时DN 33 21 所有SZGR 2.0基因通路
RODWELL肾脏老化了 487年 303年 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病早期布莱洛克的DN 165年 106年 所有SZGR 2.0基因通路
BANDRES应对CARMUSTIN没有管理48小时DN 32 25 所有SZGR 2.0基因通路
BANDRES应对CARMUSTIN管理48小时DN 161年 105年 所有SZGR 2.0基因通路
检查参与组成分泌腺中肺癌和成纤维细胞 132年 93年 所有SZGR 2.0基因通路
GAVIN集群P7 FOXP3目标 90年 52 所有SZGR 2.0基因通路
萧述三乳腺癌基底 648年 398年 所有SZGR 2.0基因通路
克罗默肿瘤发生了 63年 36 所有SZGR 2.0基因通路
戴维斯多发性骨髓瘤VS开战DN 28 18 所有SZGR 2.0基因通路
LINDSTEDT树突状细胞成熟D 68年 44 所有SZGR 2.0基因通路
甜蜜的肺癌喀斯特 491年 316年 所有SZGR 2.0基因通路
霍夫曼PRE BI大前BII淋巴细胞DN 75年 61年 所有SZGR 2.0基因通路
李T淋巴细胞早期DN 57 36 所有SZGR 2.0基因通路
60张及目标的人力资源 293年 203年 所有SZGR 2.0基因通路
八木AML和发票16易位 422年 277年 所有SZGR 2.0基因通路
弗尔涅腺泡的发育晚2 277年 172年 所有SZGR 2.0基因通路
黄成人组织干细胞模块 721年 492年 所有SZGR 2.0基因通路
么时间响应黄体酮集群16 79年 47 所有SZGR 2.0基因通路
赛对促性腺激素DN 87年 66年 所有SZGR 2.0基因通路
萨松应对FORSKOLIN DN 88年 68年 所有SZGR 2.0基因通路
KARLSSON TGFB1目标了 127年 78年 所有SZGR 2.0基因通路
DN KARLSSON TGFB1目标 207年 139年 所有SZGR 2.0基因通路
李诱导T自然杀伤DN 116年 83年 所有SZGR 2.0基因通路
金所有障碍CALB1 CORR 548年 370年 所有SZGR 2.0基因通路
DN WIERENGA STAT5A目标 213年 127年 所有SZGR 2.0基因通路
DN PILON KLF1目标 1972年 1213年 所有SZGR 2.0基因通路
MIYAGAWA EWSR1 ETS融合DN的目标 229年 135年 所有SZGR 2.0基因通路
DN PASINI SUZ12目标 315年 215年 所有SZGR 2.0基因通路
KOINUMA SMAD2或SMAD3的目标 824年 528年 所有SZGR 2.0基因通路
IKEDA MIR30目标了 116年 87年 所有SZGR 2.0基因通路
皮德森转移由ERBB2同种型7 403年 240年 所有SZGR 2.0基因通路
他的目标611 ERBB2的清洁技术基金对碘氧基苯甲醚 76年 45 所有SZGR 2.0基因通路
KRIEG KDM3A目标不缺氧 208年 107年 所有SZGR 2.0基因通路