概括
基因 8708
象征 B3GALT1
同义词 beta3gal-t1
描述 β-1,3-半乳糖基转移酶1
参考 MIM:603093|HGNC:HGNC:916|HPRD:04369|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q24.3
Pascal P值 0.008
主持人 小脑半球
小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.02395

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C21orf62 0.48 0.16
TP53AIP1 0.42 0.25
VCAM1 0.42 0.16
POU2F1 0.42 0.12
FCHSD1 0.42 0.21
Eln 0.42 0.21
cdc42bpg 0.42 0.15
LRRC36 0.42 0.22
ZNF474 0.42 0.07
SHFM1 0.41 0.26
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.33 -0.21 -0.18
AF347015.15 -0.21 -0.19
mt-cyb -0.21 -0.19
AF347015.27 -0.20 -0.18
MT-CO2 -0.20 -0.16
AF347015.8 -0.20 -0.17
AF347015.2 -0.20 -0.14
AF347015.31 -0.19 -0.16
AF347015.26 -0.19 -0.16
AF347015.9 -0.19 -0.18

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008378 半乳糖基转移酶活性 IEA -
GO:0016757 转移酶活性,转移糖基团 IEA -
去:0008499 UDP-半乳糖:β-N-乙酰葡萄糖胺β-1,3-半乳糖基转移酶活性活性 nas -
GO:0030145 锰离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0030259 脂质糖基化 nas -
去:0006486 蛋白氨基酸糖基化 nas -
去:0009312 寡糖生物合成过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000139 高尔基膜 IEA -
去:0005794 高尔基体 IEA -
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 nas -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KeGG糖果果脂生物合成乳酸和新乳糖系列 26 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 170 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe Wnt3a靶向DN 97 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN 264 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC DN监管 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤经典 162 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ohguchi肝HNF4A靶向DN 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组D的UVC响应 280 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-378 406 413 1A,M8 HSA-MIR-378 cuccugacuccaggucugugu