基因页:B3GALT1
概括?
基因 | 8708 |
象征 | B3GALT1 |
同义词 | beta3gal-t1 |
描述 | β-1,3-半乳糖基转移酶1 |
参考 | MIM:603093|HGNC:HGNC:916|HPRD:04369| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q24.3 |
Pascal P值 | 0.008 |
主持人 | 小脑半球 小脑 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.02395 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/B3GALT1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C21orf62 | 0.48 | 0.16 |
TP53AIP1 | 0.42 | 0.25 |
VCAM1 | 0.42 | 0.16 |
POU2F1 | 0.42 | 0.12 |
FCHSD1 | 0.42 | 0.21 |
Eln | 0.42 | 0.21 |
cdc42bpg | 0.42 | 0.15 |
LRRC36 | 0.42 | 0.22 |
ZNF474 | 0.42 | 0.07 |
SHFM1 | 0.41 | 0.26 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.33 | -0.21 | -0.18 |
AF347015.15 | -0.21 | -0.19 |
mt-cyb | -0.21 | -0.19 |
AF347015.27 | -0.20 | -0.18 |
MT-CO2 | -0.20 | -0.16 |
AF347015.8 | -0.20 | -0.17 |
AF347015.2 | -0.20 | -0.14 |
AF347015.31 | -0.19 | -0.16 |
AF347015.26 | -0.19 | -0.16 |
AF347015.9 | -0.19 | -0.18 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008378 | 半乳糖基转移酶活性 | IEA | - | |
GO:0016757 | 转移酶活性,转移糖基团 | IEA | - | |
去:0008499 | UDP-半乳糖:β-N-乙酰葡萄糖胺β-1,3-半乳糖基转移酶活性活性 | nas | - | |
GO:0030145 | 锰离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0030259 | 脂质糖基化 | nas | - | |
去:0006486 | 蛋白氨基酸糖基化 | nas | - | |
去:0009312 | 寡糖生物合成过程 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000139 | 高尔基膜 | IEA | - | |
去:0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | nas | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KeGG糖果果脂生物合成乳酸和新乳糖系列 | 26 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 | 170 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Labbe Wnt3a靶向DN | 97 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN | 264 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤经典 | 162 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ohguchi肝HNF4A靶向DN | 149 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-378 | 406 | 413 | 1A,M8 | HSA-MIR-378 | cuccugacuccaggucugugu |