基因页：TNK1
概括？
| 基因 | 8711 |
| 象征 | TNK1 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 酪氨酸激酶，非受体，1 |
| 参考 | MIM：608076|HGNC：HGNC：11940|ENSEMBL：ENSG00000174292|HPRD：09730|Vega：Otthumg00000178174 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17p13.1 |
| Pascal P值 | 0.038 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | TNK1 | 8711 | 0.05 | 反式 | ||
| RS7584986 | CHR2 | 184111432 | TNK1 | 8711 | 0.06 | 反式 | ||
| RS10008800 | CHR4 | 5773180 | TNK1 | 8711 | 0.05 | 反式 | ||
| RS10491487 | CHR5 | 80323367 | TNK1 | 8711 | 0.03 | 反式 | ||
| RS9364293 | CHR6 | 169199078 | TNK1 | 8711 | 0.06 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | TNK1 | 8711 | 4.485e-4 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| diras3 | 0.62 | 0.47 |
| FEZF1 | 0.62 | 0.30 |
| AC009163.1 | 0.60 | 0.41 |
| AVP | 0.60 | -0.12 |
| PMCH | 0.60 | 0.32 |
| dnali1 | 0.59 | 0.43 |
| HCRT | 0.59 | 0.16 |
| C2ORF70 | 0.59 | 0.32 |
| 牛 | 0.59 | -0.08 |
| TMEM146 | 0.59 | 0.38 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SPARCL1 | -0.20 | -0.32 |
| sohlh1 | -0.20 | -0.41 |
| itpka | -0.19 | -0.31 |
| CABP1 | -0.19 | -0.38 |
| 抓牢 | -0.18 | -0.30 |
| TRPV6 | -0.18 | -0.25 |
| aldh1a1 | -0.18 | -0.31 |
| ephx4 | -0.18 | -0.26 |
| nnmt | -0.18 | -0.31 |
| SLC26A4 | -0.18 | -0.17 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sarrio上皮间质转变 | 180 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 | 206 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |